Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

J0D1Y9

Protein Details
Accession J0D1Y9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-131IERTEKEREKELKRKRRQTKGKRGIALPBasic
305-326QCGPCGKYWHQHRKPRPVQYSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-128KEREKELKRKRRQTKGKRGI
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG adl:AURDEDRAFT_178289  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MNLKDQFEWDIVNSSNSPEHFAEVYCSDLGLGGEFKTAVAHCIREQSQVHMKSLFVVGHPMDGTPILEEEVKQTFLPPIDIAARSFEQTSTFTPIIDYLSDGEIERTEKEREKELKRKRRQTKGKRGIALPDRDPVRTHRTPAIGFPDMDPSLASSGITAPTSSKRAAAAAASATIAVMVASENEGGGGRYSAPVNLPEKAVQPPKPTRTRGLYKPPPIPNPIENPRAQMTKTENTALASTDRATRPPDSSGSTRLTAFHRPKDEFVAEGQHKNIIDGVWHCSNCGAPDGIAVGRRKGPNGIKSQCGPCGKYWHQHRKPRPVQYSTDRAWHERQLREMSKKGKRSRVLPNIHTDLPPSHNRVDDGPYQPLDVGASSPQSTMSSMSQQSVELPLAKKARINGNAPVSREAPRAASPPQLPPAPPPVPVVMPTNAAPPPPSGGDNGVQHVSAPPYPTDGSGPSLSPLARPEWLMTALKGMQDKYPDDRFDVIQRPRMQTEQTPDDEIWRVKCFDCPGKLYKPGPAQSLDNFEVHLRNRLHRQKVAARVSGAPPPSAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.23
3 0.22
4 0.26
5 0.22
6 0.24
7 0.22
8 0.22
9 0.24
10 0.21
11 0.23
12 0.18
13 0.17
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.11
18 0.11
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.12
26 0.14
27 0.16
28 0.17
29 0.24
30 0.26
31 0.31
32 0.32
33 0.36
34 0.44
35 0.44
36 0.45
37 0.39
38 0.38
39 0.33
40 0.35
41 0.28
42 0.18
43 0.2
44 0.17
45 0.18
46 0.19
47 0.16
48 0.14
49 0.14
50 0.14
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.1
56 0.12
57 0.14
58 0.15
59 0.14
60 0.15
61 0.16
62 0.16
63 0.18
64 0.15
65 0.16
66 0.18
67 0.19
68 0.19
69 0.2
70 0.2
71 0.2
72 0.2
73 0.18
74 0.16
75 0.18
76 0.2
77 0.22
78 0.21
79 0.2
80 0.19
81 0.2
82 0.19
83 0.17
84 0.15
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.14
94 0.18
95 0.23
96 0.25
97 0.34
98 0.42
99 0.5
100 0.58
101 0.67
102 0.73
103 0.78
104 0.87
105 0.88
106 0.9
107 0.92
108 0.93
109 0.94
110 0.94
111 0.92
112 0.87
113 0.8
114 0.78
115 0.75
116 0.7
117 0.6
118 0.56
119 0.49
120 0.43
121 0.42
122 0.38
123 0.39
124 0.35
125 0.37
126 0.36
127 0.38
128 0.38
129 0.41
130 0.42
131 0.36
132 0.33
133 0.3
134 0.31
135 0.26
136 0.25
137 0.21
138 0.15
139 0.13
140 0.13
141 0.11
142 0.06
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.11
149 0.14
150 0.14
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.12
157 0.1
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.04
165 0.03
166 0.02
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.08
181 0.11
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.17
187 0.22
188 0.27
189 0.27
190 0.33
191 0.39
192 0.46
193 0.52
194 0.53
195 0.53
196 0.55
197 0.59
198 0.59
199 0.63
200 0.63
201 0.63
202 0.68
203 0.68
204 0.65
205 0.61
206 0.57
207 0.5
208 0.49
209 0.48
210 0.44
211 0.39
212 0.38
213 0.37
214 0.34
215 0.31
216 0.27
217 0.27
218 0.26
219 0.27
220 0.26
221 0.24
222 0.23
223 0.23
224 0.19
225 0.14
226 0.11
227 0.1
228 0.13
229 0.13
230 0.14
231 0.16
232 0.17
233 0.18
234 0.19
235 0.21
236 0.2
237 0.21
238 0.24
239 0.24
240 0.24
241 0.22
242 0.22
243 0.23
244 0.28
245 0.3
246 0.31
247 0.33
248 0.34
249 0.34
250 0.37
251 0.34
252 0.26
253 0.23
254 0.25
255 0.22
256 0.22
257 0.21
258 0.19
259 0.18
260 0.17
261 0.17
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.13
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.09
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.15
282 0.16
283 0.16
284 0.21
285 0.25
286 0.28
287 0.36
288 0.37
289 0.36
290 0.39
291 0.4
292 0.41
293 0.39
294 0.34
295 0.27
296 0.34
297 0.34
298 0.38
299 0.47
300 0.52
301 0.59
302 0.66
303 0.73
304 0.76
305 0.81
306 0.84
307 0.81
308 0.74
309 0.72
310 0.69
311 0.67
312 0.58
313 0.56
314 0.48
315 0.43
316 0.41
317 0.42
318 0.42
319 0.37
320 0.4
321 0.41
322 0.45
323 0.46
324 0.5
325 0.52
326 0.52
327 0.6
328 0.62
329 0.63
330 0.62
331 0.64
332 0.68
333 0.69
334 0.7
335 0.65
336 0.64
337 0.6
338 0.57
339 0.51
340 0.41
341 0.34
342 0.31
343 0.3
344 0.27
345 0.24
346 0.24
347 0.25
348 0.25
349 0.27
350 0.28
351 0.28
352 0.27
353 0.25
354 0.24
355 0.23
356 0.21
357 0.17
358 0.12
359 0.09
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.16
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.14
378 0.14
379 0.18
380 0.2
381 0.21
382 0.22
383 0.24
384 0.31
385 0.33
386 0.35
387 0.36
388 0.43
389 0.46
390 0.47
391 0.46
392 0.39
393 0.37
394 0.35
395 0.29
396 0.23
397 0.21
398 0.23
399 0.22
400 0.26
401 0.25
402 0.28
403 0.32
404 0.31
405 0.3
406 0.3
407 0.36
408 0.31
409 0.31
410 0.28
411 0.26
412 0.25
413 0.26
414 0.27
415 0.2
416 0.2
417 0.19
418 0.21
419 0.2
420 0.19
421 0.18
422 0.15
423 0.17
424 0.16
425 0.17
426 0.14
427 0.17
428 0.21
429 0.21
430 0.23
431 0.21
432 0.19
433 0.18
434 0.18
435 0.18
436 0.15
437 0.16
438 0.13
439 0.16
440 0.17
441 0.17
442 0.18
443 0.17
444 0.19
445 0.19
446 0.19
447 0.16
448 0.18
449 0.17
450 0.16
451 0.17
452 0.16
453 0.15
454 0.16
455 0.17
456 0.17
457 0.21
458 0.2
459 0.19
460 0.2
461 0.2
462 0.22
463 0.23
464 0.21
465 0.21
466 0.23
467 0.26
468 0.29
469 0.34
470 0.33
471 0.34
472 0.35
473 0.35
474 0.38
475 0.44
476 0.43
477 0.45
478 0.49
479 0.51
480 0.52
481 0.53
482 0.5
483 0.47
484 0.5
485 0.49
486 0.46
487 0.45
488 0.42
489 0.42
490 0.43
491 0.4
492 0.35
493 0.31
494 0.31
495 0.27
496 0.32
497 0.35
498 0.38
499 0.41
500 0.43
501 0.47
502 0.51
503 0.59
504 0.56
505 0.58
506 0.58
507 0.57
508 0.55
509 0.52
510 0.49
511 0.44
512 0.5
513 0.44
514 0.36
515 0.32
516 0.3
517 0.32
518 0.3
519 0.34
520 0.3
521 0.34
522 0.45
523 0.53
524 0.6
525 0.59
526 0.66
527 0.67
528 0.74
529 0.75
530 0.69
531 0.63
532 0.6
533 0.58
534 0.55
535 0.48