FuNGI

A0A1X2H0E3

Protein Details

Accession

A0A1X2H0E3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
185-211	AQGFPKPARRSRFKEQQLKKRQPESGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
191-198	PARRSRFK

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, mito 8, cyto_nucl 8, nucl 5.5, plas 1, extr 1, pero 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MNECAPFLWMAESHCVKFDNPLFFFTTTIMHGRIRPTLGSDDDDLERMQQEFLTGSQRPSAAVKRKGPSLFAQRRQQQQSTEDADAADFAGMPTLETVPAGAQPEAQQEPYLEAEAATAEAEEDDKPQFMADPHGQHTPATKTMLDLSSLLGNVLGAVTENTVDTVAPPTLPTRPERSARSELHAQGFPKPARRSRFKEQQLKKRQPESGSEPVGTEPATLNVEDENMSRLDAMSEQELEEARQEVLSQLSPESISILLNRPKKPAVYSSPSVAARQTAQEQKAAEQAERDKLAWMDTSLQPPPLPEAVDEQDSVYRRVRFDLQGNIMDASVDVPRHKGLHHHGDEPDKAGYTLAELLYLVRSTVASQRAMVLTTLSRILWRAKSATEPVWVDILRIFRRADIAASIYLRSALDDRHLIVLVAAVQALAALVLPQEAFAAPEVLKETYDRCGYAGHLARYVLPRSDKDIKSLGEKFTQAVKSMQGQAEEEKEEQEENDAQLAERDLARGLVKMNLLQRIKYLLSPDSELLAVDGPSVELMVRILAWVAEAGPDVCEDIMRHDLLEPVVAWGLVNKPWPMTEDEPAHHQPSLAALRLLTVLSQSSKATAERVMDSSSACILPLLAVSPETACASLRGHAYALQIETLTLMRVQLCYGLVTPTLPDLQEPMMAWIKASLTQKTEQAWLRGAATWNVLQLCLNAAADPHKTTPAHAVEWHQPAAFLPLAVATVRTSSSFADTHPTTALCSPHDMALAAALGYLATWATYMDRFPPVDDTLTTEQVWQAAMASEPKALAMDQATVRYMELVEAVSKSQQQGALAAEARSKWTGPAMVEAVRRIARNNGQGEDGVLGRIAMGIWLDQVKDRSKRERLWCQGGFELAELESVVGSMHAGAAEKGLAQQLLQLCVLTRLSGDLASVLAPFYAAHDDDPQDSLMFPRNNSTPLNVTAWLMSPVVQAPAATLQAVAEIIQDPATLDHDVAVLCLMQAFLTADFWDPSVRKWLDHWLDVVCVRPMEGSSIEGFEAAWRRTSPAGGNFYPFYQAFVAHYAAESMGHPGFGRLLAYVSRFAGMDCEILLWSDYADVLKTIRVPRDSVAGCSDMSRGSTLLRAYLAAVRGKQVSRETGQDGMYWYALQLLKHNHASNPTLGTEDWLQRDKETADDWQQLSM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.28
3	0.26
4	0.33
5	0.36
6	0.37
7	0.35
8	0.37
9	0.39
10	0.38
11	0.38
12	0.31
13	0.27
14	0.21
15	0.22
16	0.22
17	0.21
18	0.23
19	0.26
20	0.3
21	0.3
22	0.28
23	0.29
24	0.31
25	0.31
26	0.32
27	0.3
28	0.29
29	0.28
30	0.29
31	0.25
32	0.21
33	0.2
34	0.17
35	0.16
36	0.12
37	0.12
38	0.12
39	0.13
40	0.18
41	0.18
42	0.19
43	0.22
44	0.22
45	0.23
46	0.27
47	0.35
48	0.38
49	0.46
50	0.52
51	0.53
52	0.61
53	0.62
54	0.6
55	0.59
56	0.6
57	0.62
58	0.63
59	0.68
60	0.68
61	0.76
62	0.8
63	0.76
64	0.71
65	0.63
66	0.63
67	0.59
68	0.53
69	0.44
70	0.36
71	0.31
72	0.26
73	0.23
74	0.14
75	0.08
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.07
80	0.08
81	0.08
82	0.08
83	0.08
84	0.08
85	0.07
86	0.1
87	0.12
88	0.11
89	0.12
90	0.13
91	0.19
92	0.21
93	0.21
94	0.19
95	0.17
96	0.2
97	0.2
98	0.2
99	0.14
100	0.12
101	0.12
102	0.11
103	0.11
104	0.08
105	0.06
106	0.05
107	0.05
108	0.06
109	0.06
110	0.08
111	0.09
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.11
116	0.11
117	0.18
118	0.21
119	0.25
120	0.28
121	0.32
122	0.32
123	0.31
124	0.35
125	0.32
126	0.3
127	0.28
128	0.26
129	0.23
130	0.27
131	0.28
132	0.24
133	0.2
134	0.18
135	0.17
136	0.17
137	0.15
138	0.1
139	0.09
140	0.08
141	0.07
142	0.05
143	0.04
144	0.04
145	0.04
146	0.05
147	0.05
148	0.05
149	0.06
150	0.06
151	0.06
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.11
157	0.15
158	0.18
159	0.21
160	0.26
161	0.32
162	0.38
163	0.42
164	0.48
165	0.53
166	0.53
167	0.55
168	0.56
169	0.54
170	0.53
171	0.52
172	0.45
173	0.42
174	0.47
175	0.44
176	0.45
177	0.47
178	0.5
179	0.55
180	0.63
181	0.65
182	0.68
183	0.76
184	0.77
185	0.81
186	0.84
187	0.86
188	0.88
189	0.91
190	0.89
191	0.87
192	0.82
193	0.75
194	0.73
195	0.7
196	0.67
197	0.6
198	0.52
199	0.45
200	0.39
201	0.36
202	0.28
203	0.21
204	0.12
205	0.11
206	0.12
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.09
219	0.09
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.1
224	0.11
225	0.12
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.09
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.16
245	0.22
246	0.29
247	0.31
248	0.34
249	0.36
250	0.37
251	0.38
252	0.4
253	0.41
254	0.41
255	0.42
256	0.41
257	0.45
258	0.44
259	0.42
260	0.35
261	0.28
262	0.21
263	0.22
264	0.25
265	0.26
266	0.26
267	0.28
268	0.28
269	0.28
270	0.31
271	0.3
272	0.24
273	0.21
274	0.24
275	0.26
276	0.27
277	0.26
278	0.22
279	0.21
280	0.22
281	0.19
282	0.17
283	0.16
284	0.17
285	0.21
286	0.2
287	0.21
288	0.2
289	0.19
290	0.21
291	0.18
292	0.16
293	0.13
294	0.16
295	0.18
296	0.19
297	0.19
298	0.17
299	0.19
300	0.2
301	0.22
302	0.22
303	0.22
304	0.21
305	0.24
306	0.27
307	0.27
308	0.3
309	0.35
310	0.34
311	0.34
312	0.35
313	0.32
314	0.28
315	0.23
316	0.19
317	0.13
318	0.1
319	0.09
320	0.08
321	0.09
322	0.1
323	0.11
324	0.12
325	0.17
326	0.22
327	0.32
328	0.35
329	0.38
330	0.4
331	0.44
332	0.44
333	0.41
334	0.34
335	0.24
336	0.21
337	0.17
338	0.13
339	0.1
340	0.11
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.06
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.11
352	0.14
353	0.13
354	0.14
355	0.16
356	0.16
357	0.16
358	0.15
359	0.11
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.08
364	0.08
365	0.1
366	0.13
367	0.14
368	0.16
369	0.16
370	0.16
371	0.2
372	0.23
373	0.23
374	0.24
375	0.23
376	0.22
377	0.23
378	0.22
379	0.19
380	0.18
381	0.21
382	0.18
383	0.19
384	0.19
385	0.16
386	0.18
387	0.18
388	0.16
389	0.12
390	0.13
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.11
395	0.11
396	0.1
397	0.1
398	0.09
399	0.07
400	0.09
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.1
406	0.09
407	0.09
408	0.07
409	0.07
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.03
414	0.03
415	0.03
416	0.02
417	0.02
418	0.02
419	0.02
420	0.02
421	0.02
422	0.03
423	0.03
424	0.04
425	0.04
426	0.06
427	0.05
428	0.06
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.09
433	0.1
434	0.12
435	0.13
436	0.12
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.18
441	0.22
442	0.19
443	0.19
444	0.19
445	0.21
446	0.23
447	0.24
448	0.19
449	0.17
450	0.17
451	0.23
452	0.32
453	0.3
454	0.3
455	0.33
456	0.32
457	0.35
458	0.38
459	0.33
460	0.27
461	0.27
462	0.25
463	0.26
464	0.26
465	0.21
466	0.19
467	0.19
468	0.19
469	0.22
470	0.22
471	0.17
472	0.17
473	0.17
474	0.18
475	0.18
476	0.16
477	0.12
478	0.12
479	0.11
480	0.1
481	0.11
482	0.1
483	0.09
484	0.1
485	0.09
486	0.08
487	0.09
488	0.09
489	0.08
490	0.07
491	0.07
492	0.05
493	0.06
494	0.07
495	0.07
496	0.07
497	0.09
498	0.09
499	0.11
500	0.13
501	0.19
502	0.19
503	0.19
504	0.19
505	0.2
506	0.2
507	0.19
508	0.18
509	0.14
510	0.14
511	0.16
512	0.15
513	0.13
514	0.13
515	0.11
516	0.09
517	0.08
518	0.06
519	0.05
520	0.05
521	0.04
522	0.03
523	0.04
524	0.03
525	0.02
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.03
535	0.03
536	0.03
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.06
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.09
550	0.08
551	0.09
552	0.07
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.05
557	0.04
558	0.05
559	0.06
560	0.07
561	0.07
562	0.07
563	0.08
564	0.1
565	0.13
566	0.14
567	0.17
568	0.18
569	0.19
570	0.24
571	0.26
572	0.25
573	0.21
574	0.19
575	0.15
576	0.17
577	0.18
578	0.13
579	0.11
580	0.09
581	0.1
582	0.1
583	0.1
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.06
590	0.07
591	0.08
592	0.08
593	0.09
594	0.1
595	0.1
596	0.11
597	0.12
598	0.12
599	0.11
600	0.11
601	0.11
602	0.1
603	0.08
604	0.07
605	0.06
606	0.05
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.03
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.06
619	0.06
620	0.09
621	0.09
622	0.09
623	0.09
624	0.1
625	0.11
626	0.11
627	0.11
628	0.09
629	0.08
630	0.07
631	0.08
632	0.06
633	0.06
634	0.04
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.06
640	0.06
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.07
649	0.06
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.08
654	0.08
655	0.1
656	0.11
657	0.11
658	0.11
659	0.1
660	0.1
661	0.14
662	0.16
663	0.15
664	0.15
665	0.17
666	0.19
667	0.2
668	0.25
669	0.22
670	0.22
671	0.22
672	0.2
673	0.2
674	0.19
675	0.19
676	0.15
677	0.14
678	0.13
679	0.13
680	0.12
681	0.11
682	0.09
683	0.08
684	0.08
685	0.07
686	0.07
687	0.05
688	0.06
689	0.08
690	0.09
691	0.1
692	0.1
693	0.13
694	0.13
695	0.14
696	0.2
697	0.21
698	0.21
699	0.21
700	0.24
701	0.26
702	0.29
703	0.29
704	0.23
705	0.2
706	0.19
707	0.2
708	0.17
709	0.1
710	0.07
711	0.07
712	0.07
713	0.07
714	0.07
715	0.04
716	0.05
717	0.06
718	0.06
719	0.07
720	0.07
721	0.1
722	0.1
723	0.1
724	0.15
725	0.15
726	0.16
727	0.16
728	0.16
729	0.14
730	0.16
731	0.17
732	0.12
733	0.14
734	0.14
735	0.14
736	0.14
737	0.13
738	0.1
739	0.09
740	0.08
741	0.06
742	0.05
743	0.04
744	0.03
745	0.03
746	0.03
747	0.02
748	0.02
749	0.02
750	0.03
751	0.04
752	0.05
753	0.05
754	0.07
755	0.1
756	0.1
757	0.11
758	0.14
759	0.15
760	0.15
761	0.15
762	0.19
763	0.2
764	0.22
765	0.21
766	0.18
767	0.17
768	0.16
769	0.16
770	0.1
771	0.07
772	0.05
773	0.06
774	0.07
775	0.08
776	0.08
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.06
783	0.09
784	0.09
785	0.1
786	0.11
787	0.11
788	0.11
789	0.1
790	0.09
791	0.06
792	0.06
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.07
797	0.08
798	0.09
799	0.09
800	0.11
801	0.11
802	0.11
803	0.12
804	0.12
805	0.14
806	0.14
807	0.14
808	0.14
809	0.13
810	0.15
811	0.14
812	0.13
813	0.11
814	0.11
815	0.13
816	0.12
817	0.15
818	0.15
819	0.18
820	0.19
821	0.19
822	0.21
823	0.21
824	0.21
825	0.19
826	0.23
827	0.24
828	0.3
829	0.33
830	0.3
831	0.29
832	0.29
833	0.29
834	0.24
835	0.19
836	0.12
837	0.08
838	0.07
839	0.05
840	0.05
841	0.05
842	0.03
843	0.03
844	0.03
845	0.04
846	0.05
847	0.06
848	0.08
849	0.11
850	0.17
851	0.24
852	0.29
853	0.37
854	0.44
855	0.52
856	0.6
857	0.67
858	0.69
859	0.72
860	0.69
861	0.64
862	0.58
863	0.51
864	0.42
865	0.31
866	0.24
867	0.14
868	0.12
869	0.08
870	0.07
871	0.05
872	0.04
873	0.04
874	0.03
875	0.03
876	0.03
877	0.03
878	0.03
879	0.04
880	0.04
881	0.05
882	0.05
883	0.05
884	0.06
885	0.07
886	0.06
887	0.06
888	0.09
889	0.1
890	0.12
891	0.12
892	0.11
893	0.11
894	0.13
895	0.13
896	0.1
897	0.08
898	0.08
899	0.08
900	0.08
901	0.08
902	0.06
903	0.06
904	0.07
905	0.07
906	0.05
907	0.05
908	0.05
909	0.05
910	0.06
911	0.08
912	0.08
913	0.09
914	0.12
915	0.13
916	0.14
917	0.16
918	0.15
919	0.13
920	0.13
921	0.13
922	0.18
923	0.19
924	0.18
925	0.21
926	0.23
927	0.26
928	0.27
929	0.28
930	0.24
931	0.25
932	0.28
933	0.24
934	0.23
935	0.21
936	0.21
937	0.19
938	0.15
939	0.13
940	0.11
941	0.11
942	0.11
943	0.1
944	0.09
945	0.08
946	0.1
947	0.1
948	0.09
949	0.08
950	0.07
951	0.07
952	0.08
953	0.06
954	0.06
955	0.06
956	0.06
957	0.06
958	0.06
959	0.06
960	0.07
961	0.09
962	0.09
963	0.08
964	0.08
965	0.09
966	0.09
967	0.08
968	0.08
969	0.06
970	0.05
971	0.05
972	0.05
973	0.04
974	0.05
975	0.05
976	0.05
977	0.06
978	0.07
979	0.08
980	0.09
981	0.09
982	0.13
983	0.13
984	0.14
985	0.23
986	0.23
987	0.23
988	0.25
989	0.34
990	0.35
991	0.37
992	0.37
993	0.29
994	0.31
995	0.31
996	0.31
997	0.22
998	0.17
999	0.16
1000	0.14
1001	0.13
1002	0.13
1003	0.13
1004	0.13
1005	0.12
1006	0.13
1007	0.13
1008	0.12
1009	0.12
1010	0.13
1011	0.17
1012	0.16
1013	0.18
1014	0.17
1015	0.2
1016	0.21
1017	0.24
1018	0.25
1019	0.28
1020	0.34
1021	0.33
1022	0.36
1023	0.34
1024	0.34
1025	0.36
1026	0.3
1027	0.25
1028	0.19
1029	0.18
1030	0.16
1031	0.18
1032	0.19
1033	0.14
1034	0.15
1035	0.12
1036	0.12
1037	0.12
1038	0.1
1039	0.11
1040	0.1
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.1
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.11
1047	0.08
1048	0.09
1049	0.11
1050	0.13
1051	0.14
1052	0.14
1053	0.15
1054	0.14
1055	0.14
1056	0.14
1057	0.13
1058	0.12
1059	0.1
1060	0.1
1061	0.09
1062	0.1
1063	0.1
1064	0.08
1065	0.07
1066	0.07
1067	0.07
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.07
1072	0.09
1073	0.15
1074	0.2
1075	0.26
1076	0.27
1077	0.29
1078	0.3
1079	0.38
1080	0.38
1081	0.36
1082	0.34
1083	0.29
1084	0.27
1085	0.26
1086	0.26
1087	0.18
1088	0.18
1089	0.16
1090	0.13
1091	0.12
1092	0.16
1093	0.15
1094	0.16
1095	0.15
1096	0.14
1097	0.15
1098	0.18
1099	0.21
1100	0.22
1101	0.22
1102	0.24
1103	0.28
1104	0.29
1105	0.32
1106	0.32
1107	0.35
1108	0.33
1109	0.38
1110	0.38
1111	0.37
1112	0.37
1113	0.33
1114	0.32
1115	0.27
1116	0.25
1117	0.2
1118	0.16
1119	0.18
1120	0.2
1121	0.18
1122	0.22
1123	0.26
1124	0.32
1125	0.39
1126	0.42
1127	0.39
1128	0.42
1129	0.45
1130	0.42
1131	0.39
1132	0.34
1133	0.29
1134	0.27
1135	0.27
1136	0.28
1137	0.3
1138	0.32
1139	0.33
1140	0.33
1141	0.31
1142	0.35
1143	0.32
1144	0.3
1145	0.27
1146	0.29
1147	0.32
1148	0.38

A0A1X2H0E3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer