FuNGI

A0A1X2HDW2

Protein Details

Accession

A0A1X2HDW2

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
472-517	NLGVPRSKKESKEEKKARKAAVKEAKKNRRETKKSTKQAFKSEETR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
476-508	PRSKKESKEEKKARKAAVKEAKKNRRETKKSTK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MGKKPFIDRKEAKHYHVVHRSQRDPLINDNDAGERVLKEYIPGNVQKHKSSDEIERVRRKPVQLDQDEIDRRMGQAATYGIYFDDAGEYDYTQHLRVIGQGGDTVFLEAPQKEEKKPALPKKLSELAFRDDEDGKKRQLIEMPAGVLPSDVEMKVGLMNQGTGQENGLQPDMDPRLREILEALEDEEYIDEETADDDFFGELNADGEEYVPEEEEEEYYEEEVVDDDGNYDWQAAFRNFKRDQRRNGSDDEFEEEEERFDRQTVGTGFSVTSSIMHRNKGLSTLDDRFDKIEEEYGDDDDDDAEEMGAAGLLEDRDDFDDIVGELLDKKELVGKKMQPRLEGGTAEGKLDTLRSALMATRLDDEIIEAEKAKKKKSGAEEVDIWARPTQQTKAWDCQTVLSTYSNLENHPQLISDRGPRKKIVIDPKTGMPSLVAPEPRKSARSKLQESAAEEEDSEEEEEEEDEEEEERANLGVPRSKKESKEEKKARKAAVKEAKKNRRETKKSTKQAFKSEETRQRQILQNQRKSQGVKHIN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.7
3	0.73
4	0.72
5	0.71
6	0.74
7	0.73
8	0.7
9	0.7
10	0.67
11	0.6
12	0.6
13	0.59
14	0.51
15	0.48
16	0.43
17	0.38
18	0.32
19	0.3
20	0.23
21	0.15
22	0.15
23	0.16
24	0.14
25	0.14
26	0.16
27	0.18
28	0.23
29	0.28
30	0.31
31	0.39
32	0.43
33	0.45
34	0.46
35	0.46
36	0.44
37	0.42
38	0.46
39	0.47
40	0.53
41	0.59
42	0.65
43	0.64
44	0.68
45	0.69
46	0.64
47	0.62
48	0.62
49	0.63
50	0.57
51	0.6
52	0.55
53	0.59
54	0.59
55	0.51
56	0.45
57	0.34
58	0.31
59	0.28
60	0.26
61	0.16
62	0.15
63	0.15
64	0.13
65	0.13
66	0.13
67	0.1
68	0.11
69	0.1
70	0.07
71	0.07
72	0.07
73	0.08
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.12
78	0.13
79	0.12
80	0.13
81	0.12
82	0.11
83	0.13
84	0.15
85	0.13
86	0.13
87	0.14
88	0.13
89	0.13
90	0.13
91	0.12
92	0.09
93	0.09
94	0.11
95	0.1
96	0.12
97	0.19
98	0.22
99	0.22
100	0.28
101	0.31
102	0.37
103	0.48
104	0.55
105	0.58
106	0.6
107	0.61
108	0.63
109	0.67
110	0.61
111	0.56
112	0.51
113	0.45
114	0.42
115	0.4
116	0.36
117	0.31
118	0.32
119	0.32
120	0.32
121	0.28
122	0.29
123	0.29
124	0.29
125	0.31
126	0.31
127	0.3
128	0.28
129	0.29
130	0.26
131	0.25
132	0.22
133	0.17
134	0.13
135	0.09
136	0.09
137	0.07
138	0.06
139	0.06
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.08
144	0.06
145	0.07
146	0.07
147	0.1
148	0.11
149	0.1
150	0.1
151	0.12
152	0.12
153	0.14
154	0.14
155	0.11
156	0.1
157	0.14
158	0.17
159	0.16
160	0.16
161	0.16
162	0.19
163	0.19
164	0.19
165	0.15
166	0.13
167	0.13
168	0.13
169	0.13
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.08
174	0.07
175	0.06
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.05
196	0.05
197	0.04
198	0.04
199	0.05
200	0.06
201	0.05
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.05
220	0.08
221	0.08
222	0.14
223	0.15
224	0.23
225	0.26
226	0.34
227	0.44
228	0.5
229	0.58
230	0.62
231	0.67
232	0.62
233	0.64
234	0.59
235	0.5
236	0.43
237	0.38
238	0.29
239	0.22
240	0.2
241	0.15
242	0.13
243	0.12
244	0.11
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.1
250	0.1
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.11
256	0.12
257	0.08
258	0.08
259	0.07
260	0.13
261	0.14
262	0.15
263	0.16
264	0.17
265	0.17
266	0.19
267	0.19
268	0.14
269	0.17
270	0.19
271	0.2
272	0.2
273	0.2
274	0.18
275	0.18
276	0.16
277	0.12
278	0.13
279	0.11
280	0.12
281	0.13
282	0.12
283	0.12
284	0.11
285	0.11
286	0.07
287	0.07
288	0.05
289	0.04
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.03
295	0.02
296	0.02
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.04
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.05
308	0.06
309	0.05
310	0.04
311	0.04
312	0.05
313	0.05
314	0.04
315	0.04
316	0.1
317	0.11
318	0.13
319	0.19
320	0.26
321	0.34
322	0.41
323	0.43
324	0.39
325	0.41
326	0.43
327	0.39
328	0.33
329	0.26
330	0.25
331	0.23
332	0.22
333	0.19
334	0.14
335	0.12
336	0.12
337	0.1
338	0.05
339	0.05
340	0.05
341	0.06
342	0.06
343	0.09
344	0.1
345	0.1
346	0.12
347	0.12
348	0.12
349	0.11
350	0.11
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.08
355	0.12
356	0.17
357	0.2
358	0.22
359	0.26
360	0.27
361	0.34
362	0.41
363	0.48
364	0.47
365	0.5
366	0.5
367	0.48
368	0.5
369	0.44
370	0.37
371	0.27
372	0.23
373	0.19
374	0.2
375	0.2
376	0.2
377	0.28
378	0.31
379	0.39
380	0.4
381	0.42
382	0.39
383	0.39
384	0.36
385	0.3
386	0.27
387	0.2
388	0.18
389	0.16
390	0.19
391	0.17
392	0.16
393	0.18
394	0.17
395	0.17
396	0.17
397	0.16
398	0.13
399	0.16
400	0.18
401	0.24
402	0.31
403	0.37
404	0.4
405	0.4
406	0.43
407	0.45
408	0.51
409	0.53
410	0.51
411	0.52
412	0.52
413	0.56
414	0.56
415	0.51
416	0.42
417	0.32
418	0.27
419	0.23
420	0.24
421	0.25
422	0.23
423	0.26
424	0.32
425	0.34
426	0.36
427	0.36
428	0.4
429	0.44
430	0.52
431	0.55
432	0.55
433	0.59
434	0.6
435	0.6
436	0.57
437	0.5
438	0.4
439	0.34
440	0.29
441	0.23
442	0.19
443	0.16
444	0.11
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.08
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.07
458	0.08
459	0.1
460	0.13
461	0.19
462	0.21
463	0.27
464	0.35
465	0.41
466	0.44
467	0.52
468	0.6
469	0.63
470	0.72
471	0.78
472	0.81
473	0.85
474	0.89
475	0.88
476	0.85
477	0.8
478	0.79
479	0.79
480	0.79
481	0.79
482	0.82
483	0.83
484	0.83
485	0.88
486	0.88
487	0.88
488	0.86
489	0.86
490	0.87
491	0.87
492	0.9
493	0.9
494	0.9
495	0.87
496	0.88
497	0.85
498	0.81
499	0.78
500	0.78
501	0.78
502	0.76
503	0.74
504	0.68
505	0.67
506	0.68
507	0.7
508	0.7
509	0.71
510	0.73
511	0.75
512	0.75
513	0.76
514	0.71
515	0.67

A0A1X2HDW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer