Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2H9Y2

Protein Details
Accession A0A1X2H9Y2    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-326SPPPQPASARRHVRKTKKSSKKLQEPSNRAPATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-315ARRHVRKTKKSSKK
380-401KKRNRGGGHVTKSATRTRKSRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MYAYSQQHNPHPQAYFSSPAYDGEPTSFLPPLPPSSFDPLLLEMMANDYNNTAHYASQIDPTLPTTPVSEFDSHMYMTSMMANTSCCLPTGVATAAPTAATAPGMNNSYFAAPSSVLPSHHQHRSYQDKQQPQQLQHHPLPHEDALFASSSSYFEYDSPPMSSSPPGMTPSWFADEQPLHIDPLQMMACDPLLADYSTPSPSPLTPSTSPSPVAAVTPVIGLDLDATTEDWEPRDSFSEHEQHLLDPITPPTSLEYDQEIEDDREADTLGEDESETLPDDDDADEDPDWTATASPPPQPASARRHVRKTKKSSKKLQEPSNRAPATKIDPNNVCCTNCETTNTPLWRRNAAGEPLCNACGLFLKLHGIVRPLSLKTDVIKKRNRGGGHVTKSATRTRKSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.36
4 0.35
5 0.3
6 0.29
7 0.3
8 0.26
9 0.22
10 0.19
11 0.2
12 0.17
13 0.19
14 0.18
15 0.16
16 0.17
17 0.19
18 0.23
19 0.24
20 0.26
21 0.28
22 0.35
23 0.36
24 0.33
25 0.33
26 0.28
27 0.27
28 0.24
29 0.19
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.13
39 0.11
40 0.1
41 0.11
42 0.14
43 0.14
44 0.18
45 0.18
46 0.16
47 0.17
48 0.19
49 0.2
50 0.18
51 0.17
52 0.15
53 0.15
54 0.17
55 0.2
56 0.19
57 0.18
58 0.2
59 0.21
60 0.19
61 0.18
62 0.17
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.11
72 0.11
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.13
78 0.13
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.08
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.08
100 0.09
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.17
105 0.21
106 0.26
107 0.31
108 0.32
109 0.31
110 0.37
111 0.46
112 0.48
113 0.53
114 0.55
115 0.58
116 0.6
117 0.66
118 0.65
119 0.59
120 0.64
121 0.61
122 0.62
123 0.56
124 0.59
125 0.51
126 0.46
127 0.46
128 0.37
129 0.3
130 0.22
131 0.19
132 0.14
133 0.13
134 0.11
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.14
150 0.12
151 0.12
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.15
158 0.18
159 0.16
160 0.15
161 0.17
162 0.17
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.09
170 0.12
171 0.11
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.12
190 0.13
191 0.17
192 0.17
193 0.22
194 0.23
195 0.24
196 0.24
197 0.2
198 0.2
199 0.14
200 0.13
201 0.1
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.12
224 0.16
225 0.21
226 0.2
227 0.23
228 0.22
229 0.19
230 0.2
231 0.19
232 0.15
233 0.11
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.12
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.1
280 0.12
281 0.15
282 0.18
283 0.2
284 0.22
285 0.24
286 0.31
287 0.35
288 0.43
289 0.5
290 0.54
291 0.62
292 0.7
293 0.78
294 0.81
295 0.84
296 0.85
297 0.86
298 0.9
299 0.91
300 0.92
301 0.92
302 0.91
303 0.9
304 0.9
305 0.88
306 0.85
307 0.85
308 0.76
309 0.65
310 0.57
311 0.51
312 0.48
313 0.47
314 0.42
315 0.4
316 0.44
317 0.47
318 0.52
319 0.51
320 0.44
321 0.38
322 0.41
323 0.36
324 0.32
325 0.33
326 0.3
327 0.31
328 0.39
329 0.44
330 0.44
331 0.46
332 0.48
333 0.48
334 0.46
335 0.47
336 0.45
337 0.47
338 0.46
339 0.42
340 0.41
341 0.4
342 0.38
343 0.33
344 0.26
345 0.19
346 0.17
347 0.16
348 0.14
349 0.12
350 0.15
351 0.18
352 0.2
353 0.21
354 0.2
355 0.19
356 0.22
357 0.26
358 0.23
359 0.24
360 0.24
361 0.25
362 0.26
363 0.36
364 0.41
365 0.46
366 0.54
367 0.58
368 0.65
369 0.7
370 0.68
371 0.65
372 0.66
373 0.68
374 0.66
375 0.66
376 0.59
377 0.56
378 0.58
379 0.6
380 0.58
381 0.54