Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HW49

Protein Details
Accession A0A1X2HW49    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
523-543YTYSQWRRHPDYKPQNDHPTPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
Amino Acid Sequences MEVHKDQFVDRLPLIEAAILEADFVSIDAEFTGLTADGTRLLAQDTPQERYEKMRRSVDAFSIIQYGICTFKRDGDTWTAKPFNFYIFDSEDVGFRNSRFITASTNSLNFLRKNGFDFNKWVDHGIPYRNQSEIESGRLENEANASNHKYNGKELSSADKRFAERLRKNISKWLQNGNTNTPLLVQTNSHRQRHLANDEVKDKKYNNFLYVKLRDTSHIEIKKRSEEAREARAMYDYNRPKDPLLNFGKVIEYIKRSKCPVIMHNGIFDLCHTVSQFWSRLPGQWKDFQEMVTDMWPQVVDTKYLAAYHPVLKSCFAASTALPPMFETVNKAFAVSGTRIVIPEAFNRYQGEDAFEHEAGYDAYQTGVIYLGFVHFVMENEEYWEAAEKEQIKENRPTQVEEFMQLDVLKNYYNKLFVMRKIPPYLDLCAQNEEEKEGVFYLDKIPEGMAQAAFELLYPELKPIKVRWVDATHAWLFTDINDGSAKFSGECGQRVYPFLPGNPEEPVAVQLGITEDACNMKLYTYSQWRRHPDYKPQNDHPTPSTRAIEELSASLNQQEESGHADSPGGDNVRVTARVSTVDYGADETIPNGGASFNDVGMDVPVSFQKRTEQASASPSKRKPQGEDQDESPSGKKHKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.16
4 0.12
5 0.12
6 0.1
7 0.09
8 0.08
9 0.07
10 0.06
11 0.06
12 0.05
13 0.04
14 0.05
15 0.04
16 0.05
17 0.04
18 0.04
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.06
23 0.06
24 0.07
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.12
31 0.2
32 0.23
33 0.26
34 0.29
35 0.31
36 0.3
37 0.38
38 0.46
39 0.47
40 0.51
41 0.54
42 0.54
43 0.57
44 0.6
45 0.55
46 0.53
47 0.44
48 0.37
49 0.33
50 0.29
51 0.25
52 0.2
53 0.17
54 0.16
55 0.16
56 0.18
57 0.17
58 0.23
59 0.27
60 0.28
61 0.31
62 0.36
63 0.42
64 0.42
65 0.49
66 0.48
67 0.43
68 0.45
69 0.42
70 0.36
71 0.32
72 0.3
73 0.26
74 0.24
75 0.26
76 0.26
77 0.25
78 0.23
79 0.22
80 0.23
81 0.19
82 0.16
83 0.2
84 0.17
85 0.18
86 0.19
87 0.18
88 0.22
89 0.23
90 0.28
91 0.26
92 0.26
93 0.27
94 0.27
95 0.31
96 0.25
97 0.27
98 0.26
99 0.24
100 0.28
101 0.34
102 0.35
103 0.34
104 0.39
105 0.39
106 0.4
107 0.4
108 0.37
109 0.3
110 0.31
111 0.32
112 0.32
113 0.33
114 0.32
115 0.32
116 0.32
117 0.31
118 0.28
119 0.31
120 0.27
121 0.25
122 0.24
123 0.22
124 0.22
125 0.23
126 0.21
127 0.15
128 0.15
129 0.16
130 0.15
131 0.18
132 0.22
133 0.23
134 0.26
135 0.28
136 0.27
137 0.27
138 0.32
139 0.3
140 0.28
141 0.28
142 0.34
143 0.39
144 0.39
145 0.38
146 0.36
147 0.36
148 0.38
149 0.43
150 0.44
151 0.42
152 0.5
153 0.56
154 0.58
155 0.59
156 0.63
157 0.63
158 0.61
159 0.6
160 0.61
161 0.57
162 0.57
163 0.6
164 0.55
165 0.53
166 0.45
167 0.4
168 0.31
169 0.27
170 0.22
171 0.19
172 0.15
173 0.14
174 0.25
175 0.33
176 0.34
177 0.33
178 0.34
179 0.38
180 0.44
181 0.46
182 0.44
183 0.42
184 0.45
185 0.52
186 0.55
187 0.52
188 0.47
189 0.43
190 0.39
191 0.41
192 0.39
193 0.37
194 0.36
195 0.38
196 0.43
197 0.45
198 0.44
199 0.37
200 0.35
201 0.31
202 0.33
203 0.34
204 0.34
205 0.37
206 0.37
207 0.39
208 0.42
209 0.45
210 0.43
211 0.41
212 0.36
213 0.38
214 0.41
215 0.43
216 0.43
217 0.39
218 0.36
219 0.35
220 0.31
221 0.25
222 0.29
223 0.29
224 0.29
225 0.31
226 0.31
227 0.31
228 0.36
229 0.34
230 0.34
231 0.34
232 0.33
233 0.31
234 0.31
235 0.3
236 0.25
237 0.26
238 0.19
239 0.17
240 0.21
241 0.25
242 0.27
243 0.29
244 0.3
245 0.32
246 0.33
247 0.34
248 0.35
249 0.38
250 0.35
251 0.34
252 0.32
253 0.28
254 0.24
255 0.2
256 0.15
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.12
263 0.13
264 0.1
265 0.14
266 0.14
267 0.18
268 0.22
269 0.26
270 0.27
271 0.33
272 0.34
273 0.34
274 0.34
275 0.29
276 0.26
277 0.22
278 0.19
279 0.14
280 0.13
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.08
294 0.09
295 0.12
296 0.14
297 0.14
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.1
304 0.09
305 0.08
306 0.1
307 0.12
308 0.12
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.1
316 0.13
317 0.12
318 0.13
319 0.11
320 0.11
321 0.14
322 0.11
323 0.11
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.09
330 0.11
331 0.15
332 0.15
333 0.16
334 0.16
335 0.17
336 0.17
337 0.16
338 0.17
339 0.11
340 0.13
341 0.15
342 0.15
343 0.14
344 0.12
345 0.13
346 0.09
347 0.09
348 0.07
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.1
372 0.08
373 0.07
374 0.11
375 0.11
376 0.12
377 0.19
378 0.22
379 0.24
380 0.3
381 0.33
382 0.37
383 0.36
384 0.38
385 0.34
386 0.36
387 0.33
388 0.28
389 0.27
390 0.19
391 0.19
392 0.16
393 0.15
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.08
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.16
403 0.2
404 0.21
405 0.28
406 0.32
407 0.35
408 0.37
409 0.37
410 0.35
411 0.34
412 0.34
413 0.3
414 0.3
415 0.26
416 0.26
417 0.27
418 0.25
419 0.22
420 0.21
421 0.17
422 0.13
423 0.12
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.08
428 0.09
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.11
435 0.12
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.07
441 0.06
442 0.06
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.08
447 0.1
448 0.11
449 0.13
450 0.14
451 0.23
452 0.25
453 0.26
454 0.3
455 0.32
456 0.34
457 0.34
458 0.39
459 0.3
460 0.27
461 0.26
462 0.2
463 0.17
464 0.14
465 0.17
466 0.11
467 0.11
468 0.12
469 0.12
470 0.13
471 0.14
472 0.14
473 0.09
474 0.1
475 0.15
476 0.17
477 0.18
478 0.2
479 0.22
480 0.23
481 0.26
482 0.26
483 0.25
484 0.24
485 0.24
486 0.26
487 0.25
488 0.25
489 0.25
490 0.24
491 0.19
492 0.18
493 0.18
494 0.13
495 0.12
496 0.1
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.08
502 0.07
503 0.09
504 0.09
505 0.1
506 0.09
507 0.09
508 0.1
509 0.12
510 0.19
511 0.28
512 0.37
513 0.44
514 0.53
515 0.6
516 0.68
517 0.73
518 0.74
519 0.74
520 0.76
521 0.79
522 0.8
523 0.81
524 0.83
525 0.78
526 0.75
527 0.69
528 0.65
529 0.59
530 0.55
531 0.49
532 0.39
533 0.37
534 0.34
535 0.3
536 0.24
537 0.2
538 0.17
539 0.15
540 0.14
541 0.13
542 0.13
543 0.12
544 0.11
545 0.1
546 0.09
547 0.14
548 0.15
549 0.14
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.15
554 0.19
555 0.15
556 0.14
557 0.13
558 0.15
559 0.18
560 0.18
561 0.18
562 0.15
563 0.15
564 0.17
565 0.19
566 0.19
567 0.17
568 0.17
569 0.16
570 0.16
571 0.16
572 0.14
573 0.11
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.09
578 0.08
579 0.07
580 0.07
581 0.1
582 0.11
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.1
587 0.11
588 0.12
589 0.08
590 0.08
591 0.13
592 0.15
593 0.16
594 0.17
595 0.22
596 0.26
597 0.31
598 0.35
599 0.34
600 0.36
601 0.44
602 0.53
603 0.53
604 0.57
605 0.57
606 0.61
607 0.66
608 0.68
609 0.66
610 0.68
611 0.73
612 0.71
613 0.71
614 0.66
615 0.67
616 0.63
617 0.58
618 0.49
619 0.44