Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HTL1

Protein Details
Accession A0A1X2HTL1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-254EMQPKNPTIPAKPKKQKVKYVRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-249KPKKQK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002778  Signal_recog_particle_SRP19  
IPR036521  SRP19-like_sf  
Gene Ontology GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF01922  SRP19  
Amino Acid Sequences MSMLNKLKETQKNPVFMEEDDDIDNMDFPLPGADERSSASSSSAAGPPNMDQLQNLMRNLSTGAAGGPQATQRPQEQNPIAVAQTPQGVRRLDPSQYKDWVCIYPCYIDATKSVQDGRKISKEKCIENPNAYHMAVAVQQLGLSVVYETKRHPRDWSNPGRVRVQLKGPNNFFVNSNVTTRRQLCKAIAERMPQVQKDTQPPKNIITPLTSLKEVEDIVNEQRKAQGLPPLSEMQPKNPTIPAKPKKQKVKYVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.53
3 0.44
4 0.45
5 0.35
6 0.31
7 0.25
8 0.23
9 0.18
10 0.16
11 0.16
12 0.1
13 0.1
14 0.07
15 0.06
16 0.07
17 0.07
18 0.08
19 0.1
20 0.11
21 0.11
22 0.13
23 0.16
24 0.16
25 0.15
26 0.16
27 0.13
28 0.14
29 0.16
30 0.17
31 0.15
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.21
36 0.21
37 0.18
38 0.15
39 0.17
40 0.23
41 0.26
42 0.25
43 0.2
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.16
48 0.1
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.1
58 0.13
59 0.16
60 0.22
61 0.24
62 0.31
63 0.31
64 0.32
65 0.32
66 0.31
67 0.27
68 0.22
69 0.21
70 0.13
71 0.15
72 0.14
73 0.14
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.2
78 0.22
79 0.23
80 0.29
81 0.33
82 0.33
83 0.37
84 0.38
85 0.35
86 0.34
87 0.32
88 0.27
89 0.23
90 0.2
91 0.16
92 0.16
93 0.18
94 0.16
95 0.14
96 0.14
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.19
101 0.18
102 0.2
103 0.22
104 0.25
105 0.3
106 0.33
107 0.32
108 0.38
109 0.39
110 0.39
111 0.44
112 0.46
113 0.42
114 0.41
115 0.41
116 0.36
117 0.34
118 0.31
119 0.24
120 0.17
121 0.14
122 0.12
123 0.11
124 0.08
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.05
133 0.06
134 0.07
135 0.09
136 0.17
137 0.2
138 0.22
139 0.26
140 0.31
141 0.39
142 0.48
143 0.57
144 0.59
145 0.62
146 0.64
147 0.62
148 0.59
149 0.54
150 0.47
151 0.45
152 0.41
153 0.42
154 0.47
155 0.46
156 0.45
157 0.44
158 0.42
159 0.35
160 0.3
161 0.28
162 0.22
163 0.24
164 0.23
165 0.24
166 0.29
167 0.32
168 0.33
169 0.31
170 0.33
171 0.32
172 0.37
173 0.4
174 0.42
175 0.43
176 0.42
177 0.42
178 0.46
179 0.48
180 0.4
181 0.39
182 0.36
183 0.36
184 0.43
185 0.49
186 0.48
187 0.5
188 0.52
189 0.51
190 0.53
191 0.5
192 0.42
193 0.37
194 0.34
195 0.33
196 0.34
197 0.31
198 0.25
199 0.24
200 0.24
201 0.21
202 0.18
203 0.15
204 0.14
205 0.2
206 0.27
207 0.27
208 0.26
209 0.28
210 0.29
211 0.28
212 0.29
213 0.29
214 0.26
215 0.28
216 0.32
217 0.34
218 0.33
219 0.4
220 0.38
221 0.38
222 0.41
223 0.41
224 0.39
225 0.41
226 0.44
227 0.45
228 0.54
229 0.56
230 0.6
231 0.69
232 0.76
233 0.81
234 0.86