Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HDM9

Protein Details
Accession A0A1X2HDM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MPQPIKKRSRSQSKTDFKETRQKIHydrophilic
195-220TQQKDESKPEKKKQKTAAKPKPQGDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-215KPEKKKQKTAAKPK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 9.5, mito 4, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPQPIKKRSRSQSKTDFKETRQKIRTLEASLSDKSNLNNLVVLLDIAQDDASTAQGIHAAIHALFRVYTRLIQAGDLGKKKDKGAHVAVTQWLRDQYKTYLRYLQSLLKHEEPGLQVSALNILMTNLKVQSEYQRNFTDVYYRPVIEAVVWQKQLSDPLFKEFLEKYVNAYDDLRFHFYTDVAEIITAARPQQQTQQKDESKPEKKKQKTAAKPKPQGDLARLAQTVFRFVEGIRSTPTEPEEIDEFFCITPATERKQTKKNTTSPSGIDEDDMMLLGEGLDDEDEDENDEQKPKEKQSYILQLKNHKRAFADCWINLLRLPLSEEIYKKTLLILHKRILPHMMHPNVLMDFLSDSYEVGGSVSLLALNGLFVLITEHSLEFPDFYPKLYNLLDRDVMHVKYRSRFFRLLDIFLSSTLLPVGLVAAFVKRLARLSLTAPPAAIVIIIPFIYNLMRRHPTCMTMIHRNDAVGEAEDPYVYEEKDPYKCKAMESSLWEVQTLAEHYYANVSTLAKIFSDKFLKPKYDLEDFMDHTYTTFFDNEVNRKQKKAPALAFEKPGECTWEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.83
4 0.78
5 0.81
6 0.79
7 0.79
8 0.75
9 0.72
10 0.65
11 0.66
12 0.66
13 0.6
14 0.56
15 0.52
16 0.49
17 0.46
18 0.45
19 0.39
20 0.34
21 0.3
22 0.32
23 0.27
24 0.23
25 0.22
26 0.2
27 0.18
28 0.16
29 0.15
30 0.1
31 0.08
32 0.08
33 0.07
34 0.06
35 0.05
36 0.06
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.05
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.08
51 0.08
52 0.09
53 0.11
54 0.11
55 0.13
56 0.14
57 0.17
58 0.17
59 0.17
60 0.2
61 0.24
62 0.3
63 0.32
64 0.34
65 0.37
66 0.39
67 0.41
68 0.44
69 0.42
70 0.43
71 0.45
72 0.48
73 0.44
74 0.45
75 0.48
76 0.44
77 0.39
78 0.34
79 0.33
80 0.28
81 0.27
82 0.27
83 0.28
84 0.35
85 0.38
86 0.39
87 0.41
88 0.41
89 0.44
90 0.44
91 0.44
92 0.4
93 0.43
94 0.45
95 0.4
96 0.4
97 0.37
98 0.37
99 0.32
100 0.29
101 0.25
102 0.19
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.12
107 0.1
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.19
118 0.27
119 0.29
120 0.33
121 0.34
122 0.35
123 0.35
124 0.35
125 0.34
126 0.26
127 0.3
128 0.28
129 0.26
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.17
134 0.2
135 0.18
136 0.21
137 0.21
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.26
142 0.23
143 0.25
144 0.2
145 0.24
146 0.26
147 0.25
148 0.28
149 0.24
150 0.25
151 0.22
152 0.21
153 0.2
154 0.22
155 0.23
156 0.2
157 0.21
158 0.19
159 0.19
160 0.22
161 0.23
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.17
167 0.14
168 0.12
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.22
180 0.29
181 0.32
182 0.38
183 0.47
184 0.47
185 0.5
186 0.58
187 0.59
188 0.61
189 0.67
190 0.7
191 0.71
192 0.73
193 0.77
194 0.79
195 0.8
196 0.81
197 0.83
198 0.85
199 0.85
200 0.87
201 0.82
202 0.77
203 0.71
204 0.63
205 0.54
206 0.51
207 0.41
208 0.37
209 0.33
210 0.28
211 0.25
212 0.23
213 0.22
214 0.15
215 0.13
216 0.1
217 0.09
218 0.17
219 0.15
220 0.16
221 0.15
222 0.17
223 0.17
224 0.18
225 0.19
226 0.13
227 0.12
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.06
238 0.08
239 0.11
240 0.14
241 0.21
242 0.25
243 0.3
244 0.39
245 0.45
246 0.52
247 0.57
248 0.62
249 0.61
250 0.62
251 0.6
252 0.53
253 0.5
254 0.43
255 0.34
256 0.26
257 0.2
258 0.15
259 0.11
260 0.1
261 0.06
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.02
266 0.02
267 0.02
268 0.02
269 0.02
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.05
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.08
279 0.13
280 0.16
281 0.17
282 0.23
283 0.24
284 0.27
285 0.31
286 0.42
287 0.45
288 0.46
289 0.47
290 0.51
291 0.57
292 0.62
293 0.57
294 0.48
295 0.42
296 0.4
297 0.41
298 0.39
299 0.38
300 0.28
301 0.32
302 0.31
303 0.3
304 0.28
305 0.24
306 0.16
307 0.11
308 0.13
309 0.1
310 0.11
311 0.13
312 0.14
313 0.16
314 0.17
315 0.17
316 0.15
317 0.15
318 0.17
319 0.2
320 0.26
321 0.29
322 0.3
323 0.34
324 0.34
325 0.34
326 0.34
327 0.3
328 0.27
329 0.31
330 0.3
331 0.27
332 0.26
333 0.27
334 0.23
335 0.22
336 0.16
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.16
374 0.16
375 0.19
376 0.19
377 0.22
378 0.18
379 0.21
380 0.24
381 0.22
382 0.26
383 0.26
384 0.26
385 0.26
386 0.28
387 0.28
388 0.32
389 0.38
390 0.38
391 0.41
392 0.44
393 0.41
394 0.47
395 0.47
396 0.43
397 0.38
398 0.36
399 0.3
400 0.26
401 0.26
402 0.16
403 0.13
404 0.1
405 0.09
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.09
419 0.11
420 0.12
421 0.15
422 0.22
423 0.24
424 0.23
425 0.22
426 0.21
427 0.19
428 0.17
429 0.14
430 0.07
431 0.04
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.04
436 0.05
437 0.07
438 0.11
439 0.12
440 0.18
441 0.25
442 0.26
443 0.32
444 0.33
445 0.35
446 0.33
447 0.39
448 0.38
449 0.42
450 0.44
451 0.42
452 0.41
453 0.38
454 0.36
455 0.3
456 0.25
457 0.17
458 0.14
459 0.12
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.12
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.13
468 0.18
469 0.26
470 0.3
471 0.31
472 0.38
473 0.38
474 0.4
475 0.43
476 0.43
477 0.42
478 0.45
479 0.49
480 0.45
481 0.44
482 0.41
483 0.34
484 0.29
485 0.26
486 0.21
487 0.15
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.15
492 0.15
493 0.13
494 0.14
495 0.13
496 0.13
497 0.15
498 0.15
499 0.13
500 0.15
501 0.16
502 0.21
503 0.26
504 0.27
505 0.34
506 0.4
507 0.44
508 0.45
509 0.5
510 0.49
511 0.5
512 0.5
513 0.48
514 0.47
515 0.46
516 0.46
517 0.41
518 0.34
519 0.28
520 0.26
521 0.21
522 0.17
523 0.14
524 0.11
525 0.15
526 0.22
527 0.29
528 0.38
529 0.47
530 0.48
531 0.52
532 0.57
533 0.59
534 0.62
535 0.65
536 0.62
537 0.62
538 0.67
539 0.68
540 0.69
541 0.66
542 0.58
543 0.51
544 0.45