Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HUA3

Protein Details
Accession A0A1X2HUA3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
78-104DDDFEGKKRTSKVRRRHPQQQQEATATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-92KRTSKVRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015350  Beta-trefoil_DNA-bd_dom  
IPR036358  BTD_sf  
IPR040159  CLS_fam  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
IPR015351  RBP-J/Cbf11/Cbf12_DNA-bd  
IPR037095  RBP-J/Cbf11_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09270  BTD  
PF09271  LAG1-DNAbind  
Amino Acid Sequences MDQDSSPIVSQRAFGSSKKIQFIDISQHNPRNAHRRDNQAMSIESLLDSNGEQRQYHDQHKYRRPGEELDTSKRRWTDDDFEGKKRTSKVRRRHPQQQQEATATTLTCYHAAVAQKSYGSEKRFLCPPPVVSVRDVTSPMTVSLSVLCETSAQDTPLEHRTQLNAATPSSSFKYLHVTGTAKAKQFALRVSLASEPTTAPFATFLSNPISIISKPSKKTSKARNASTCILTHQPVALFNRINSQTVRTKYLTSEDKQLCAKNGNWSPFEIHIRRQPTPAVAPALSPNASSSSSSSHQRLQQQHHHSSTSAVTAVTYGTEIILRDCKSGVTSPPVIVRKVDKGRIAACAYGPVSQMQKIALQLASTATYQQQLNPQPPIYLSAASAISASSPHVDNGPAWIEYATSRLVRPTTPLDLAYEEVDDYLCWTIVGISKFEYSFSPTSMTTSTTNTPRSKSDGSSEEKHTSSTFPSTSLPSSSSSSPSLASADSSSPLSSTTVASVSAASALLEYDPQRHALLLKNSNLAESVGDCYVGLHGPLPVQRTDLFLIMTLPSGAELVAANHEQFIITPDQHRYLELPILFKQQEEMQPTNKLLACDIVDKSARWSLTLASAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.29
3 0.36
4 0.41
5 0.46
6 0.44
7 0.41
8 0.41
9 0.43
10 0.45
11 0.44
12 0.45
13 0.48
14 0.53
15 0.54
16 0.55
17 0.59
18 0.6
19 0.58
20 0.61
21 0.6
22 0.64
23 0.68
24 0.71
25 0.68
26 0.63
27 0.58
28 0.5
29 0.44
30 0.34
31 0.27
32 0.2
33 0.16
34 0.11
35 0.1
36 0.11
37 0.14
38 0.16
39 0.16
40 0.19
41 0.29
42 0.34
43 0.42
44 0.49
45 0.53
46 0.61
47 0.71
48 0.78
49 0.73
50 0.74
51 0.7
52 0.66
53 0.64
54 0.64
55 0.61
56 0.6
57 0.61
58 0.57
59 0.58
60 0.54
61 0.49
62 0.44
63 0.44
64 0.42
65 0.44
66 0.53
67 0.53
68 0.57
69 0.6
70 0.57
71 0.56
72 0.54
73 0.56
74 0.56
75 0.61
76 0.65
77 0.72
78 0.81
79 0.86
80 0.91
81 0.91
82 0.91
83 0.92
84 0.9
85 0.85
86 0.78
87 0.7
88 0.6
89 0.51
90 0.39
91 0.29
92 0.21
93 0.17
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.13
98 0.16
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.19
104 0.25
105 0.27
106 0.26
107 0.31
108 0.31
109 0.33
110 0.39
111 0.4
112 0.39
113 0.38
114 0.37
115 0.38
116 0.41
117 0.39
118 0.35
119 0.36
120 0.32
121 0.3
122 0.29
123 0.23
124 0.19
125 0.17
126 0.16
127 0.14
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.12
142 0.15
143 0.2
144 0.21
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.21
149 0.22
150 0.24
151 0.21
152 0.2
153 0.2
154 0.19
155 0.21
156 0.21
157 0.21
158 0.17
159 0.16
160 0.22
161 0.22
162 0.23
163 0.24
164 0.23
165 0.23
166 0.31
167 0.34
168 0.29
169 0.29
170 0.29
171 0.28
172 0.28
173 0.28
174 0.23
175 0.2
176 0.19
177 0.2
178 0.21
179 0.18
180 0.17
181 0.16
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.11
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.12
194 0.12
195 0.12
196 0.13
197 0.12
198 0.17
199 0.22
200 0.25
201 0.27
202 0.34
203 0.41
204 0.45
205 0.54
206 0.6
207 0.64
208 0.67
209 0.73
210 0.73
211 0.72
212 0.69
213 0.63
214 0.52
215 0.44
216 0.38
217 0.3
218 0.23
219 0.19
220 0.16
221 0.16
222 0.18
223 0.19
224 0.17
225 0.16
226 0.22
227 0.22
228 0.23
229 0.21
230 0.23
231 0.26
232 0.27
233 0.32
234 0.27
235 0.27
236 0.26
237 0.32
238 0.33
239 0.28
240 0.36
241 0.32
242 0.33
243 0.35
244 0.35
245 0.3
246 0.28
247 0.28
248 0.27
249 0.3
250 0.31
251 0.29
252 0.29
253 0.29
254 0.29
255 0.34
256 0.27
257 0.26
258 0.28
259 0.32
260 0.32
261 0.31
262 0.29
263 0.25
264 0.26
265 0.25
266 0.22
267 0.17
268 0.16
269 0.16
270 0.17
271 0.14
272 0.12
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.12
279 0.14
280 0.17
281 0.18
282 0.2
283 0.24
284 0.3
285 0.36
286 0.39
287 0.46
288 0.5
289 0.54
290 0.53
291 0.49
292 0.42
293 0.38
294 0.32
295 0.23
296 0.16
297 0.1
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.15
319 0.2
320 0.22
321 0.21
322 0.21
323 0.22
324 0.25
325 0.28
326 0.31
327 0.28
328 0.28
329 0.29
330 0.32
331 0.31
332 0.24
333 0.19
334 0.18
335 0.16
336 0.15
337 0.15
338 0.12
339 0.12
340 0.12
341 0.13
342 0.11
343 0.12
344 0.1
345 0.12
346 0.1
347 0.09
348 0.08
349 0.08
350 0.09
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.17
358 0.2
359 0.23
360 0.25
361 0.24
362 0.22
363 0.23
364 0.24
365 0.19
366 0.16
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.11
371 0.11
372 0.08
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.11
384 0.1
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.09
393 0.11
394 0.12
395 0.12
396 0.15
397 0.17
398 0.19
399 0.19
400 0.2
401 0.19
402 0.19
403 0.2
404 0.17
405 0.14
406 0.1
407 0.09
408 0.08
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.1
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.13
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.15
426 0.15
427 0.16
428 0.15
429 0.17
430 0.17
431 0.19
432 0.15
433 0.18
434 0.21
435 0.24
436 0.31
437 0.31
438 0.33
439 0.33
440 0.38
441 0.38
442 0.35
443 0.36
444 0.36
445 0.4
446 0.43
447 0.46
448 0.44
449 0.41
450 0.4
451 0.35
452 0.3
453 0.26
454 0.26
455 0.21
456 0.18
457 0.2
458 0.21
459 0.22
460 0.22
461 0.2
462 0.19
463 0.21
464 0.21
465 0.22
466 0.21
467 0.2
468 0.19
469 0.18
470 0.17
471 0.14
472 0.14
473 0.12
474 0.12
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.11
479 0.11
480 0.11
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.06
492 0.05
493 0.05
494 0.05
495 0.07
496 0.08
497 0.11
498 0.12
499 0.13
500 0.14
501 0.14
502 0.16
503 0.21
504 0.29
505 0.33
506 0.35
507 0.38
508 0.38
509 0.37
510 0.36
511 0.29
512 0.21
513 0.16
514 0.15
515 0.11
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.09
522 0.07
523 0.07
524 0.1
525 0.13
526 0.15
527 0.14
528 0.17
529 0.17
530 0.2
531 0.21
532 0.2
533 0.18
534 0.16
535 0.16
536 0.14
537 0.14
538 0.1
539 0.08
540 0.07
541 0.07
542 0.06
543 0.06
544 0.05
545 0.06
546 0.09
547 0.1
548 0.1
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.1
553 0.12
554 0.14
555 0.15
556 0.19
557 0.23
558 0.27
559 0.28
560 0.29
561 0.27
562 0.26
563 0.31
564 0.29
565 0.29
566 0.27
567 0.34
568 0.33
569 0.31
570 0.31
571 0.3
572 0.34
573 0.37
574 0.39
575 0.36
576 0.4
577 0.41
578 0.45
579 0.41
580 0.36
581 0.3
582 0.29
583 0.27
584 0.27
585 0.27
586 0.27
587 0.26
588 0.26
589 0.3
590 0.31
591 0.29
592 0.25
593 0.25
594 0.22