Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1X2HTI1

Protein Details
Accession A0A1X2HTI1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-65DEGSSKKRVRFDTKRDSPSTHydrophilic
273-300KIPAWKQKLLDKKNKNKKKPETAATTATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
276-292AWKQKLLDKKNKNKKKP
Subcellular Location(s) mito 12.5, mito_nucl 10.832, cyto_mito 9.499, nucl 7.5, cyto_nucl 6.999, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Amino Acid Sequences MRQRRITPVFHASNAAHDTQAFLAHLFVLIAMAGSKRRDTIFGDPDEGSSKKRVRFDTKRDSPSTDFEIDHTDALETKKQRRGAVNTEDLSDEEEVGGGIYSESDEDDEEEEQKPKPPADDFDMFAEEAPALPEKKKSRKLGLSDIEGQEMQSRGDESDEDEEGKEGGEPKLTAFNMRQEFEEGSFDQQGNYIRNKEDPQAFHDRWLEGVTKKDMRAAHDAQERRERAEQLREAERQADMPQTQTDIYRELIQYLEPGDNVREALTKLSGGAKIPAWKQKLLDKKNKNKKKPETAATTATLTPEQEAERKHKVERITGLADQMMALGHFNVYDDTYEQMARHIRRPGAES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.36
3 0.27
4 0.22
5 0.23
6 0.18
7 0.2
8 0.14
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.08
14 0.07
15 0.05
16 0.05
17 0.04
18 0.05
19 0.06
20 0.09
21 0.11
22 0.12
23 0.14
24 0.16
25 0.18
26 0.22
27 0.3
28 0.34
29 0.35
30 0.38
31 0.36
32 0.37
33 0.38
34 0.35
35 0.28
36 0.29
37 0.32
38 0.34
39 0.4
40 0.47
41 0.53
42 0.62
43 0.7
44 0.73
45 0.77
46 0.8
47 0.77
48 0.76
49 0.68
50 0.63
51 0.59
52 0.5
53 0.41
54 0.33
55 0.35
56 0.3
57 0.27
58 0.22
59 0.16
60 0.16
61 0.18
62 0.23
63 0.22
64 0.28
65 0.34
66 0.38
67 0.43
68 0.48
69 0.53
70 0.55
71 0.59
72 0.59
73 0.54
74 0.51
75 0.46
76 0.39
77 0.34
78 0.25
79 0.17
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.06
85 0.04
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.03
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.09
97 0.1
98 0.12
99 0.12
100 0.17
101 0.18
102 0.17
103 0.19
104 0.2
105 0.21
106 0.26
107 0.28
108 0.25
109 0.25
110 0.26
111 0.23
112 0.21
113 0.18
114 0.11
115 0.09
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.15
121 0.22
122 0.31
123 0.39
124 0.44
125 0.51
126 0.57
127 0.61
128 0.65
129 0.62
130 0.58
131 0.55
132 0.49
133 0.42
134 0.35
135 0.3
136 0.22
137 0.18
138 0.13
139 0.08
140 0.08
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.11
159 0.11
160 0.13
161 0.12
162 0.18
163 0.2
164 0.21
165 0.21
166 0.19
167 0.19
168 0.18
169 0.2
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.14
178 0.16
179 0.16
180 0.15
181 0.18
182 0.2
183 0.22
184 0.25
185 0.23
186 0.27
187 0.34
188 0.34
189 0.35
190 0.35
191 0.31
192 0.27
193 0.27
194 0.24
195 0.16
196 0.19
197 0.2
198 0.21
199 0.21
200 0.25
201 0.25
202 0.26
203 0.32
204 0.3
205 0.33
206 0.37
207 0.39
208 0.39
209 0.46
210 0.43
211 0.4
212 0.41
213 0.38
214 0.35
215 0.41
216 0.41
217 0.37
218 0.42
219 0.4
220 0.37
221 0.35
222 0.31
223 0.24
224 0.22
225 0.21
226 0.16
227 0.16
228 0.15
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.14
235 0.16
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.15
259 0.15
260 0.2
261 0.25
262 0.31
263 0.32
264 0.33
265 0.34
266 0.4
267 0.49
268 0.53
269 0.59
270 0.63
271 0.71
272 0.8
273 0.88
274 0.9
275 0.91
276 0.92
277 0.92
278 0.91
279 0.89
280 0.86
281 0.81
282 0.76
283 0.68
284 0.6
285 0.49
286 0.41
287 0.33
288 0.25
289 0.2
290 0.17
291 0.16
292 0.17
293 0.21
294 0.26
295 0.33
296 0.36
297 0.38
298 0.41
299 0.42
300 0.46
301 0.48
302 0.48
303 0.45
304 0.43
305 0.41
306 0.37
307 0.33
308 0.25
309 0.2
310 0.13
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.09
321 0.11
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.18
326 0.25
327 0.28
328 0.33
329 0.38
330 0.4