Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2HIV4

Protein Details
Accession A0A1X2HIV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-126ESDPRRKRKRLDDTINHQTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-115RRKRK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037802  SGF29  
IPR010750  SGF29_tudor-like_dom  
IPR047288  Tudor_SGF29_rpt1  
IPR047287  Tudor_SGF29_rpt2  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000124  C:SAGA complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF07039  DUF1325  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51518  SGF29_C  
CDD cd20393  Tudor_SGF29_rpt1  
cd20394  Tudor_SGF29_rpt2  
Amino Acid Sequences MADRKAPRSSRSTATLEESSEEHSLWKQICTSLADLEDTQERSALVLEKINAITRSTDFNRGISASLKQQLGTLYQEAIELADKETLLNLDTREKISVLLALREASESDPRRKRKRLDDTINHQTTRKKNKTSSGTLLPGTSVAARQPNQKGKSEEWILAVVLGFQPDKNKYFVEDVDQDETGKKQQVSLYFGRRNIIPIPDRKDEAIATNHSDFPVGQKVLALYPGTTCFYRATVIVPPIKNEDINFSTHYRVRFDDDNDDAKYVMPEHVLRI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.45
3 0.4
4 0.36
5 0.31
6 0.28
7 0.25
8 0.22
9 0.17
10 0.16
11 0.2
12 0.19
13 0.2
14 0.18
15 0.18
16 0.21
17 0.22
18 0.23
19 0.21
20 0.2
21 0.21
22 0.19
23 0.2
24 0.22
25 0.2
26 0.18
27 0.16
28 0.15
29 0.13
30 0.15
31 0.15
32 0.12
33 0.13
34 0.14
35 0.16
36 0.17
37 0.2
38 0.19
39 0.18
40 0.18
41 0.17
42 0.23
43 0.23
44 0.3
45 0.28
46 0.27
47 0.28
48 0.27
49 0.27
50 0.22
51 0.21
52 0.18
53 0.22
54 0.22
55 0.2
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.17
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.13
84 0.15
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.11
92 0.08
93 0.15
94 0.18
95 0.26
96 0.34
97 0.42
98 0.51
99 0.57
100 0.63
101 0.66
102 0.74
103 0.76
104 0.78
105 0.79
106 0.79
107 0.82
108 0.79
109 0.69
110 0.6
111 0.55
112 0.53
113 0.55
114 0.53
115 0.49
116 0.49
117 0.57
118 0.61
119 0.61
120 0.58
121 0.52
122 0.47
123 0.42
124 0.38
125 0.29
126 0.22
127 0.17
128 0.12
129 0.07
130 0.06
131 0.09
132 0.1
133 0.16
134 0.22
135 0.3
136 0.32
137 0.37
138 0.39
139 0.37
140 0.42
141 0.4
142 0.35
143 0.28
144 0.26
145 0.21
146 0.17
147 0.15
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.08
154 0.1
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.18
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.22
164 0.23
165 0.23
166 0.21
167 0.19
168 0.2
169 0.17
170 0.18
171 0.15
172 0.15
173 0.17
174 0.21
175 0.26
176 0.31
177 0.38
178 0.38
179 0.4
180 0.39
181 0.36
182 0.35
183 0.32
184 0.33
185 0.29
186 0.32
187 0.37
188 0.39
189 0.41
190 0.38
191 0.38
192 0.32
193 0.3
194 0.28
195 0.24
196 0.25
197 0.26
198 0.26
199 0.24
200 0.23
201 0.19
202 0.19
203 0.23
204 0.19
205 0.17
206 0.17
207 0.18
208 0.18
209 0.2
210 0.17
211 0.1
212 0.11
213 0.14
214 0.15
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.17
223 0.23
224 0.29
225 0.29
226 0.3
227 0.34
228 0.36
229 0.35
230 0.3
231 0.32
232 0.26
233 0.28
234 0.3
235 0.27
236 0.3
237 0.32
238 0.34
239 0.29
240 0.3
241 0.33
242 0.35
243 0.37
244 0.39
245 0.41
246 0.44
247 0.42
248 0.41
249 0.35
250 0.3
251 0.28
252 0.22
253 0.18
254 0.17