Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2G4C7

Protein Details
Accession A0A1X2G4C7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MKEREPRRPRDNKQRRDKTKDTAPRILEBasic
341-364MVMAAPRRRGRKNHLSEKEWFKNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-20REPRRPRDNKQRRDKTK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, cyto 3.5, plas 3, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR039177  SMG9  
Gene Ontology GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Amino Acid Sequences MKEREPRRPRDNKQRRDKTKDTAPRILERRPTQEPKVLAINNTVNTQDCRPGPAPQSQLPPQSSIQEKTKSDSPPTGTVPFYRRQDQFQMEAVMKVLTDHPGHFVVGVVGQQGVGKSTILSAFTDRPAEAFPTQSNDLFLAHGHKTLGIDMYACPERVLLLDTEPLLCWTVLEKALQHTSLQGTSPDAWLEMDSLYQLVFLLSVCNVVLVVMEGTDVDMDMLQCLRRAELLKFRIPDFPLLNTNMFGPHDMNYYPDIMFVCNKCQESEWTRSNYLQVQSMLDQTFQDTQMKIKGTGSLASVLPGFNTAEAVVSPLNLYFLPWKHQTQMESFEVLVQSLRDMVMAAPRRRGRKNHLSEKEWFKNAVKVYDMVRRSEYIRDYTKSIRKLRDP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.94
3 0.93
4 0.9
5 0.88
6 0.88
7 0.87
8 0.85
9 0.82
10 0.77
11 0.77
12 0.75
13 0.73
14 0.71
15 0.67
16 0.66
17 0.66
18 0.69
19 0.65
20 0.66
21 0.61
22 0.55
23 0.58
24 0.52
25 0.44
26 0.43
27 0.42
28 0.37
29 0.36
30 0.33
31 0.27
32 0.27
33 0.28
34 0.28
35 0.23
36 0.28
37 0.29
38 0.34
39 0.35
40 0.4
41 0.43
42 0.42
43 0.5
44 0.48
45 0.53
46 0.49
47 0.48
48 0.43
49 0.43
50 0.42
51 0.4
52 0.42
53 0.42
54 0.41
55 0.42
56 0.47
57 0.45
58 0.45
59 0.46
60 0.44
61 0.42
62 0.45
63 0.43
64 0.38
65 0.39
66 0.39
67 0.4
68 0.4
69 0.42
70 0.4
71 0.42
72 0.48
73 0.47
74 0.46
75 0.42
76 0.41
77 0.35
78 0.33
79 0.28
80 0.21
81 0.16
82 0.14
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.14
88 0.14
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.16
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.17
120 0.19
121 0.18
122 0.18
123 0.15
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.07
136 0.08
137 0.07
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.02
199 0.02
200 0.02
201 0.03
202 0.03
203 0.02
204 0.02
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.04
209 0.04
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.1
215 0.13
216 0.21
217 0.25
218 0.28
219 0.3
220 0.31
221 0.33
222 0.32
223 0.34
224 0.27
225 0.25
226 0.24
227 0.25
228 0.24
229 0.2
230 0.19
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.11
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.11
240 0.13
241 0.11
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.14
246 0.14
247 0.17
248 0.19
249 0.2
250 0.2
251 0.21
252 0.26
253 0.27
254 0.34
255 0.35
256 0.36
257 0.37
258 0.38
259 0.39
260 0.38
261 0.34
262 0.3
263 0.25
264 0.22
265 0.21
266 0.24
267 0.22
268 0.18
269 0.16
270 0.15
271 0.16
272 0.15
273 0.17
274 0.14
275 0.15
276 0.19
277 0.21
278 0.2
279 0.19
280 0.21
281 0.19
282 0.21
283 0.2
284 0.18
285 0.16
286 0.16
287 0.15
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.06
302 0.08
303 0.07
304 0.08
305 0.12
306 0.13
307 0.19
308 0.23
309 0.25
310 0.28
311 0.32
312 0.33
313 0.32
314 0.37
315 0.35
316 0.32
317 0.3
318 0.28
319 0.25
320 0.22
321 0.19
322 0.12
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.15
330 0.23
331 0.26
332 0.34
333 0.4
334 0.48
335 0.54
336 0.62
337 0.64
338 0.66
339 0.75
340 0.77
341 0.8
342 0.78
343 0.8
344 0.82
345 0.8
346 0.73
347 0.66
348 0.57
349 0.55
350 0.53
351 0.48
352 0.4
353 0.35
354 0.35
355 0.4
356 0.4
357 0.37
358 0.36
359 0.34
360 0.34
361 0.39
362 0.39
363 0.38
364 0.42
365 0.42
366 0.44
367 0.51
368 0.57
369 0.59
370 0.64