Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2GBY3

Protein Details
Accession A0A1X2GBY3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-89GLTLISRKNKTDKKNRTRFDVTNHydrophilic
279-300TTTESASKKRRKRAAANTSNTQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-291KKRRKR
Subcellular Location(s) nucl 13, extr 5, mito 4.5, cyto_mito 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006941  RNase_CAF1  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04857  CAF1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSVSYTEVTNDNFASLLDPLLAAIAEADYIAFDSEFSGFCSKITKHMEQRYVELCQVIQTHSLFSFGLTLISRKNKTDKKNRTRFDVTNVEFLTSNQNTFQVDPKNMRFLAESGLDFGRIFRVGIPFHDGSLLDLTSYGDDPDHPTLLIRRFWFSVLKIVHDKKIPLVVHNGLLDVMYLYQSFFATLPAKLGTFVADLDLMFPGGFYDTKYLSTAVAGEQVSYLAYVYGKCLRLGQPLLKIKTKPSLAPADPTDAPASSFAVDLSGLLAPIPANPCRPTTTESASKKRRKRAAANTSNTQAKKTKLDICSQYASHGYCRLGNGCPMTHDMDRILDRDLGTTDSTTAKVQANDNDDLADPPMSSAKRLHSSHFDAYMTAYAFCYFITTLPEQDVQDALNKINLMRLDIPLRIMPSHYSSPSQSWQRLKSFLWP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.1
4 0.08
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.05
10 0.05
11 0.04
12 0.04
13 0.04
14 0.04
15 0.03
16 0.04
17 0.05
18 0.04
19 0.04
20 0.06
21 0.07
22 0.07
23 0.1
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.18
28 0.18
29 0.26
30 0.33
31 0.39
32 0.46
33 0.55
34 0.63
35 0.59
36 0.64
37 0.6
38 0.55
39 0.48
40 0.39
41 0.3
42 0.26
43 0.25
44 0.21
45 0.21
46 0.18
47 0.19
48 0.18
49 0.19
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.1
54 0.12
55 0.1
56 0.12
57 0.17
58 0.25
59 0.27
60 0.29
61 0.39
62 0.45
63 0.55
64 0.64
65 0.7
66 0.73
67 0.82
68 0.82
69 0.81
70 0.82
71 0.74
72 0.71
73 0.7
74 0.62
75 0.59
76 0.55
77 0.47
78 0.39
79 0.36
80 0.36
81 0.27
82 0.25
83 0.18
84 0.19
85 0.19
86 0.2
87 0.25
88 0.22
89 0.25
90 0.31
91 0.33
92 0.37
93 0.36
94 0.36
95 0.32
96 0.27
97 0.26
98 0.23
99 0.2
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.15
104 0.14
105 0.12
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.2
113 0.18
114 0.18
115 0.19
116 0.17
117 0.15
118 0.16
119 0.15
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.05
127 0.06
128 0.1
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.16
134 0.19
135 0.22
136 0.2
137 0.21
138 0.21
139 0.23
140 0.24
141 0.21
142 0.25
143 0.21
144 0.24
145 0.29
146 0.31
147 0.33
148 0.32
149 0.32
150 0.26
151 0.32
152 0.29
153 0.23
154 0.26
155 0.24
156 0.24
157 0.23
158 0.22
159 0.15
160 0.14
161 0.12
162 0.07
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.05
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.18
221 0.2
222 0.22
223 0.26
224 0.31
225 0.35
226 0.36
227 0.36
228 0.34
229 0.38
230 0.36
231 0.3
232 0.28
233 0.32
234 0.29
235 0.32
236 0.31
237 0.29
238 0.27
239 0.28
240 0.24
241 0.17
242 0.16
243 0.13
244 0.12
245 0.08
246 0.08
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.05
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.06
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.13
262 0.15
263 0.17
264 0.2
265 0.22
266 0.24
267 0.28
268 0.35
269 0.41
270 0.49
271 0.57
272 0.64
273 0.68
274 0.73
275 0.75
276 0.75
277 0.78
278 0.8
279 0.81
280 0.82
281 0.81
282 0.76
283 0.73
284 0.71
285 0.61
286 0.54
287 0.46
288 0.39
289 0.37
290 0.38
291 0.41
292 0.37
293 0.45
294 0.46
295 0.47
296 0.47
297 0.43
298 0.39
299 0.35
300 0.32
301 0.27
302 0.26
303 0.22
304 0.2
305 0.22
306 0.22
307 0.2
308 0.22
309 0.23
310 0.19
311 0.2
312 0.21
313 0.23
314 0.22
315 0.21
316 0.18
317 0.2
318 0.21
319 0.2
320 0.2
321 0.17
322 0.17
323 0.17
324 0.17
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.13
330 0.14
331 0.13
332 0.15
333 0.17
334 0.18
335 0.21
336 0.25
337 0.29
338 0.29
339 0.29
340 0.27
341 0.24
342 0.22
343 0.2
344 0.16
345 0.1
346 0.1
347 0.15
348 0.14
349 0.15
350 0.18
351 0.22
352 0.3
353 0.32
354 0.36
355 0.38
356 0.45
357 0.47
358 0.48
359 0.42
360 0.34
361 0.34
362 0.32
363 0.25
364 0.19
365 0.15
366 0.13
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.09
371 0.09
372 0.14
373 0.15
374 0.16
375 0.19
376 0.22
377 0.2
378 0.21
379 0.21
380 0.16
381 0.2
382 0.21
383 0.18
384 0.18
385 0.18
386 0.17
387 0.2
388 0.2
389 0.19
390 0.19
391 0.23
392 0.23
393 0.24
394 0.27
395 0.25
396 0.27
397 0.23
398 0.23
399 0.22
400 0.25
401 0.3
402 0.3
403 0.31
404 0.32
405 0.37
406 0.44
407 0.49
408 0.5
409 0.53
410 0.58
411 0.6
412 0.62