Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2GAA2

Protein Details
Accession A0A1X2GAA2    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
68-93ESEPVAKPQDKKKKKRVYTYDEEVRTHydrophilic
213-241EKQPSTDKKQPAKNKAKKKLHQLNRKLDWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-83KKKKKR
219-233DKKQPAKNKAKKKLH
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 11.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12282  RRM2_TatSF1_like  
Amino Acid Sequences MNGPSIKKEDFDKDPRMSRNVQTGKWAFKGDDGIDFEFDENLNAWFPMYNETLIAQQQSAYAVEGVDESEPVAKPQDKKKKKRVYTYDEEVRTRRAIPVSLSIFLSLAEHVDKKPRKEPKNTSVYVTSVPPDATVQELNEVFSKCGVVMEDLETGEPKIKLYKDKDGNFQGDALVTYFREESIALAINLLDDSDLRPGDKSTRINVQKAVFKEKQPSTDKKQPAKNKAKKKLHQLNRKLDWIEEETGKKSEKFAKIVILKNMYTQQELDDDPTLILELKEDIREECERLGEVTNVILYDKSPGGIVSVRFGEPKVAKACVLLMNNRYFAGKQISAEIYDGKTKYQKSGNTAEDDEDEKQRLERYAKWLEQGADDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.64
3 0.65
4 0.63
5 0.59
6 0.62
7 0.6
8 0.54
9 0.56
10 0.56
11 0.55
12 0.54
13 0.51
14 0.41
15 0.37
16 0.41
17 0.32
18 0.33
19 0.31
20 0.29
21 0.27
22 0.27
23 0.25
24 0.21
25 0.19
26 0.14
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.09
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.15
40 0.16
41 0.17
42 0.13
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.12
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.08
57 0.09
58 0.09
59 0.14
60 0.18
61 0.23
62 0.34
63 0.45
64 0.53
65 0.63
66 0.74
67 0.8
68 0.85
69 0.9
70 0.9
71 0.88
72 0.86
73 0.85
74 0.84
75 0.78
76 0.74
77 0.64
78 0.57
79 0.5
80 0.42
81 0.36
82 0.29
83 0.25
84 0.23
85 0.29
86 0.28
87 0.27
88 0.26
89 0.23
90 0.21
91 0.19
92 0.17
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.09
98 0.19
99 0.23
100 0.27
101 0.36
102 0.45
103 0.51
104 0.6
105 0.69
106 0.69
107 0.75
108 0.72
109 0.68
110 0.6
111 0.54
112 0.45
113 0.37
114 0.28
115 0.19
116 0.17
117 0.14
118 0.12
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.14
127 0.14
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.11
146 0.12
147 0.19
148 0.23
149 0.32
150 0.38
151 0.41
152 0.47
153 0.48
154 0.48
155 0.42
156 0.38
157 0.29
158 0.21
159 0.18
160 0.12
161 0.08
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.1
186 0.15
187 0.16
188 0.17
189 0.26
190 0.29
191 0.31
192 0.34
193 0.35
194 0.35
195 0.35
196 0.41
197 0.35
198 0.34
199 0.4
200 0.38
201 0.43
202 0.45
203 0.5
204 0.5
205 0.57
206 0.63
207 0.62
208 0.69
209 0.7
210 0.74
211 0.79
212 0.8
213 0.81
214 0.83
215 0.86
216 0.84
217 0.86
218 0.85
219 0.84
220 0.86
221 0.85
222 0.84
223 0.79
224 0.77
225 0.67
226 0.57
227 0.5
228 0.43
229 0.36
230 0.29
231 0.26
232 0.23
233 0.25
234 0.26
235 0.22
236 0.22
237 0.27
238 0.28
239 0.29
240 0.29
241 0.35
242 0.4
243 0.44
244 0.46
245 0.42
246 0.37
247 0.37
248 0.41
249 0.34
250 0.28
251 0.24
252 0.2
253 0.18
254 0.19
255 0.19
256 0.15
257 0.14
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.09
262 0.08
263 0.06
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.14
270 0.16
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.15
275 0.16
276 0.17
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.22
299 0.2
300 0.26
301 0.26
302 0.25
303 0.25
304 0.25
305 0.27
306 0.26
307 0.28
308 0.28
309 0.3
310 0.32
311 0.33
312 0.33
313 0.32
314 0.26
315 0.26
316 0.28
317 0.24
318 0.21
319 0.25
320 0.26
321 0.26
322 0.27
323 0.26
324 0.21
325 0.25
326 0.25
327 0.23
328 0.28
329 0.29
330 0.34
331 0.39
332 0.42
333 0.42
334 0.51
335 0.52
336 0.52
337 0.52
338 0.48
339 0.44
340 0.42
341 0.38
342 0.33
343 0.3
344 0.25
345 0.25
346 0.27
347 0.3
348 0.31
349 0.33
350 0.38
351 0.46
352 0.48
353 0.49
354 0.51
355 0.47