Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2GC48

Protein Details
Accession A0A1X2GC48    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-258LPLTAAKRRKIDKQNQKKPTHAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-251RKKREADERHARGELPLTAAKRRKIDKQNQ
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039136  NUFIP1-like  
IPR019496  NUFIP1_cons_dom  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10453  NUFIP1  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSYHWQMPPPWNRPPQRPATSQSISPHLQQIQQRNHERQALGSAAAAALSNVFNPHLQPPQPHSPYYHPANPAYPAYPAYTDYMDSSHQPHAYPDPYSPPPPLSALARAPASTPDQRQMIAYDDIQVQPKGKTCCDRWYKSDLAYQQHCKQHVKCPDCHDFYGIPAMIASHQAQAHGKNDNEKKKPDGIVPLNAPKLQTQEEIDAWIAARKRNWPSSQNVERKKREADERHARGELPLTAAKRRKIDKQNQKKPTHAVPGLVDYAATDEDEDGIMDLEADAVSSKDPTSMGKLPEHDTPKKPICKYFLRGKCRNTANCRFSHERPAKVYIPFPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.76
3 0.74
4 0.73
5 0.7
6 0.69
7 0.65
8 0.61
9 0.57
10 0.53
11 0.48
12 0.44
13 0.45
14 0.38
15 0.4
16 0.41
17 0.47
18 0.5
19 0.57
20 0.64
21 0.63
22 0.66
23 0.67
24 0.61
25 0.53
26 0.48
27 0.4
28 0.32
29 0.26
30 0.2
31 0.14
32 0.13
33 0.12
34 0.07
35 0.06
36 0.05
37 0.06
38 0.06
39 0.07
40 0.08
41 0.09
42 0.13
43 0.18
44 0.21
45 0.24
46 0.31
47 0.41
48 0.44
49 0.43
50 0.44
51 0.45
52 0.5
53 0.52
54 0.51
55 0.44
56 0.43
57 0.43
58 0.42
59 0.38
60 0.32
61 0.26
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.18
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.14
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.19
78 0.22
79 0.23
80 0.23
81 0.21
82 0.24
83 0.26
84 0.28
85 0.28
86 0.25
87 0.24
88 0.24
89 0.24
90 0.2
91 0.2
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.2
99 0.2
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.21
106 0.2
107 0.18
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.16
112 0.18
113 0.17
114 0.15
115 0.14
116 0.19
117 0.2
118 0.21
119 0.25
120 0.26
121 0.35
122 0.42
123 0.45
124 0.44
125 0.47
126 0.47
127 0.44
128 0.46
129 0.41
130 0.38
131 0.4
132 0.42
133 0.42
134 0.44
135 0.45
136 0.45
137 0.43
138 0.45
139 0.49
140 0.47
141 0.45
142 0.48
143 0.53
144 0.51
145 0.49
146 0.43
147 0.34
148 0.3
149 0.3
150 0.22
151 0.14
152 0.11
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.16
164 0.15
165 0.21
166 0.28
167 0.36
168 0.39
169 0.4
170 0.41
171 0.42
172 0.44
173 0.38
174 0.4
175 0.34
176 0.35
177 0.36
178 0.37
179 0.34
180 0.33
181 0.31
182 0.23
183 0.23
184 0.2
185 0.18
186 0.15
187 0.16
188 0.15
189 0.16
190 0.15
191 0.13
192 0.11
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.13
197 0.18
198 0.23
199 0.3
200 0.34
201 0.36
202 0.41
203 0.49
204 0.58
205 0.61
206 0.66
207 0.68
208 0.69
209 0.69
210 0.67
211 0.63
212 0.63
213 0.61
214 0.62
215 0.63
216 0.64
217 0.63
218 0.59
219 0.54
220 0.45
221 0.39
222 0.3
223 0.22
224 0.21
225 0.19
226 0.25
227 0.3
228 0.33
229 0.37
230 0.4
231 0.47
232 0.54
233 0.63
234 0.67
235 0.74
236 0.8
237 0.84
238 0.85
239 0.81
240 0.76
241 0.73
242 0.72
243 0.62
244 0.54
245 0.46
246 0.44
247 0.4
248 0.33
249 0.25
250 0.15
251 0.15
252 0.12
253 0.1
254 0.07
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.16
276 0.2
277 0.24
278 0.27
279 0.3
280 0.33
281 0.4
282 0.46
283 0.47
284 0.46
285 0.52
286 0.57
287 0.62
288 0.64
289 0.63
290 0.62
291 0.64
292 0.67
293 0.68
294 0.69
295 0.7
296 0.74
297 0.73
298 0.75
299 0.76
300 0.78
301 0.77
302 0.78
303 0.75
304 0.72
305 0.75
306 0.73
307 0.67
308 0.69
309 0.67
310 0.63
311 0.61
312 0.63
313 0.6
314 0.56