FuNGI

A0A1X2GHK8

Protein Details

Accession

A0A1X2GHK8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
70-95	VQTQGFPKPARRSRFKQSRDNVNTSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, mito 8, cyto_nucl 7.5, nucl 4.5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MDLPGLESGDMPALESASDVTMDPVYDPHPNQPHVPAAKKMIDLTSMLGSILGEVKEHTVEKVEAPSLPVQTQGFPKPARRSRFKQSRDNVNTSQQPTTPPSTATTFTDENDSRIAAMSEQDIEAAQAEILATLNPASIAFLKKMKTSPSSSAAATSVEATLPTTASSELALQQNDASDLWSMREKYFSQVPLESDKLAWMDDRFKDLTKDKDDPNAKDTDPIYRKLRFDLHGRVIDETTANDRALHHHGDEPDKPGYTLAELFYLVRSQVPSQRALVLKVLTHILEQALHHISNAADSTSTDQKLQQQQILHVFRRADVAAVTYFRSALDDRHLIVVIQAVKATRALLQLDLLTSPSNEDSLGYFNTSYGHIRQPVLYQPPTTTRTWVKAFKQQQRGDDEDDERHQTDAQLAERDMAGALLKMDLLPRLRYLMDASSGLRKEDTTSIEGMMDILATLCKIKAQAAAGAVWDHGLMTMALDWVDTPEHQMMEAPASQRWAVMRLVVAMVQASRQAALDLKERLMPLTFSWLAVAPLTSKDGCVQLEAVKMLRLFACYGLVLPTMVELQETMLGWLQATAMVLKPDAQSAGKQKQQHDNDDASDDAFLIDRASTTIALMEVLLHGGADPHKTEPAHAVDWHQATSYLPVIILCLERAVVGSMLHASCLGYLATWASYLDKFPKDRERPLAQVWQVVQQQQVMPCMHSQQPLDCLLCSYWCLRSHQLTFSVSALLGVQQEELGVLAELVQHGGQHDDYYGRWLYYLDWQCTMMKSQAQTVQQQQRVDDVLVGKAVSSLHAGMMETWLAQALLQDCVLGVLPGAKTLASFYLGSTLMESKTSLAIKNMNGKQLDTLCYPRITSTTMTSASVSAADDKLTSVPIKVTTFLLCPVDELYYWDKSRVTQQLLFQTQQQQQLGTENNENDAGDPPSRRTTRSINDQMAEIVVESLQIGAAMDNTDGPVLLVTLMKIFLIGDREGQQQCDPMAPFGELFWNDKVADWIDACMDLLIARQWTDRLTKDALETAWVQSSHYTRRAHVPFYQFYQGFLAHYASVSLGHRAFSRLVAYVAQVVGSDPDYKHLLFSDYVDILPSLHRLGYSL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.09
4	0.07
5	0.08
6	0.07
7	0.08
8	0.09
9	0.09
10	0.1
11	0.1
12	0.12
13	0.18
14	0.2
15	0.27
16	0.34
17	0.36
18	0.38
19	0.41
20	0.47
21	0.49
22	0.52
23	0.48
24	0.48
25	0.49
26	0.48
27	0.46
28	0.39
29	0.34
30	0.3
31	0.27
32	0.22
33	0.18
34	0.16
35	0.14
36	0.12
37	0.11
38	0.13
39	0.1
40	0.09
41	0.09
42	0.11
43	0.14
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.16
48	0.18
49	0.22
50	0.22
51	0.2
52	0.22
53	0.25
54	0.24
55	0.23
56	0.25
57	0.22
58	0.24
59	0.29
60	0.3
61	0.33
62	0.35
63	0.43
64	0.5
65	0.58
66	0.64
67	0.67
68	0.7
69	0.74
70	0.81
71	0.81
72	0.81
73	0.81
74	0.83
75	0.83
76	0.84
77	0.77
78	0.75
79	0.75
80	0.68
81	0.62
82	0.52
83	0.48
84	0.45
85	0.46
86	0.39
87	0.32
88	0.32
89	0.32
90	0.33
91	0.31
92	0.32
93	0.27
94	0.27
95	0.33
96	0.31
97	0.29
98	0.27
99	0.25
100	0.19
101	0.19
102	0.19
103	0.11
104	0.12
105	0.11
106	0.11
107	0.11
108	0.11
109	0.1
110	0.09
111	0.09
112	0.08
113	0.07
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.06
118	0.05
119	0.05
120	0.05
121	0.05
122	0.05
123	0.05
124	0.06
125	0.09
126	0.11
127	0.14
128	0.18
129	0.19
130	0.23
131	0.26
132	0.3
133	0.34
134	0.37
135	0.4
136	0.41
137	0.42
138	0.39
139	0.38
140	0.33
141	0.28
142	0.23
143	0.18
144	0.13
145	0.1
146	0.1
147	0.09
148	0.09
149	0.08
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.12
157	0.16
158	0.16
159	0.15
160	0.15
161	0.16
162	0.16
163	0.15
164	0.12
165	0.09
166	0.1
167	0.11
168	0.16
169	0.18
170	0.17
171	0.21
172	0.21
173	0.24
174	0.3
175	0.31
176	0.29
177	0.3
178	0.32
179	0.34
180	0.35
181	0.31
182	0.25
183	0.24
184	0.2
185	0.18
186	0.17
187	0.14
188	0.18
189	0.19
190	0.23
191	0.23
192	0.24
193	0.29
194	0.33
195	0.38
196	0.39
197	0.43
198	0.41
199	0.49
200	0.55
201	0.52
202	0.51
203	0.48
204	0.41
205	0.41
206	0.39
207	0.4
208	0.37
209	0.39
210	0.41
211	0.42
212	0.43
213	0.42
214	0.47
215	0.4
216	0.43
217	0.46
218	0.48
219	0.48
220	0.48
221	0.46
222	0.4
223	0.37
224	0.31
225	0.24
226	0.2
227	0.17
228	0.16
229	0.15
230	0.15
231	0.18
232	0.22
233	0.23
234	0.2
235	0.22
236	0.25
237	0.3
238	0.31
239	0.31
240	0.29
241	0.28
242	0.26
243	0.22
244	0.2
245	0.17
246	0.16
247	0.12
248	0.11
249	0.11
250	0.11
251	0.11
252	0.11
253	0.09
254	0.09
255	0.1
256	0.11
257	0.17
258	0.19
259	0.21
260	0.22
261	0.27
262	0.27
263	0.27
264	0.27
265	0.23
266	0.2
267	0.2
268	0.2
269	0.15
270	0.14
271	0.13
272	0.1
273	0.1
274	0.1
275	0.12
276	0.14
277	0.13
278	0.13
279	0.13
280	0.13
281	0.12
282	0.13
283	0.09
284	0.07
285	0.07
286	0.11
287	0.15
288	0.16
289	0.16
290	0.17
291	0.24
292	0.32
293	0.35
294	0.34
295	0.31
296	0.34
297	0.43
298	0.47
299	0.41
300	0.37
301	0.34
302	0.31
303	0.32
304	0.28
305	0.2
306	0.14
307	0.14
308	0.12
309	0.13
310	0.13
311	0.1
312	0.11
313	0.1
314	0.12
315	0.1
316	0.1
317	0.14
318	0.15
319	0.16
320	0.17
321	0.17
322	0.15
323	0.14
324	0.17
325	0.13
326	0.11
327	0.11
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.11
332	0.09
333	0.1
334	0.1
335	0.1
336	0.11
337	0.11
338	0.11
339	0.1
340	0.09
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.07
348	0.07
349	0.09
350	0.1
351	0.09
352	0.09
353	0.09
354	0.1
355	0.11
356	0.12
357	0.12
358	0.15
359	0.17
360	0.17
361	0.18
362	0.19
363	0.24
364	0.28
365	0.27
366	0.24
367	0.24
368	0.29
369	0.31
370	0.3
371	0.29
372	0.26
373	0.29
374	0.34
375	0.39
376	0.37
377	0.42
378	0.51
379	0.56
380	0.63
381	0.62
382	0.62
383	0.61
384	0.61
385	0.56
386	0.51
387	0.45
388	0.37
389	0.36
390	0.33
391	0.28
392	0.25
393	0.2
394	0.17
395	0.16
396	0.16
397	0.15
398	0.14
399	0.14
400	0.14
401	0.13
402	0.13
403	0.11
404	0.08
405	0.06
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.07
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.11
417	0.11
418	0.11
419	0.12
420	0.11
421	0.11
422	0.11
423	0.12
424	0.15
425	0.16
426	0.16
427	0.14
428	0.13
429	0.14
430	0.16
431	0.18
432	0.14
433	0.15
434	0.15
435	0.14
436	0.14
437	0.12
438	0.09
439	0.06
440	0.04
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.04
447	0.04
448	0.05
449	0.07
450	0.08
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.1
457	0.08
458	0.07
459	0.05
460	0.04
461	0.04
462	0.03
463	0.03
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.03
469	0.03
470	0.04
471	0.04
472	0.06
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.07
477	0.07
478	0.08
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.1
483	0.1
484	0.1
485	0.1
486	0.11
487	0.09
488	0.09
489	0.09
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.07
494	0.05
495	0.05
496	0.04
497	0.05
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.05
502	0.06
503	0.08
504	0.11
505	0.12
506	0.12
507	0.14
508	0.14
509	0.14
510	0.13
511	0.12
512	0.08
513	0.13
514	0.13
515	0.11
516	0.11
517	0.11
518	0.11
519	0.1
520	0.1
521	0.05
522	0.05
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.07
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.09
531	0.09
532	0.1
533	0.1
534	0.09
535	0.09
536	0.09
537	0.09
538	0.08
539	0.08
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.05
548	0.05
549	0.05
550	0.04
551	0.04
552	0.04
553	0.03
554	0.03
555	0.04
556	0.04
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.04
561	0.05
562	0.04
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.05
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.07
573	0.07
574	0.09
575	0.16
576	0.21
577	0.24
578	0.28
579	0.32
580	0.4
581	0.44
582	0.46
583	0.44
584	0.4
585	0.37
586	0.34
587	0.3
588	0.21
589	0.17
590	0.12
591	0.08
592	0.06
593	0.05
594	0.04
595	0.04
596	0.04
597	0.04
598	0.05
599	0.05
600	0.04
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.04
613	0.05
614	0.06
615	0.06
616	0.09
617	0.09
618	0.1
619	0.13
620	0.16
621	0.17
622	0.16
623	0.18
624	0.2
625	0.21
626	0.2
627	0.16
628	0.14
629	0.12
630	0.13
631	0.12
632	0.07
633	0.07
634	0.06
635	0.06
636	0.07
637	0.07
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.04
646	0.05
647	0.06
648	0.06
649	0.06
650	0.06
651	0.05
652	0.05
653	0.06
654	0.05
655	0.03
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.05
661	0.06
662	0.06
663	0.08
664	0.12
665	0.15
666	0.16
667	0.21
668	0.31
669	0.35
670	0.4
671	0.46
672	0.47
673	0.47
674	0.5
675	0.53
676	0.44
677	0.42
678	0.37
679	0.36
680	0.33
681	0.3
682	0.26
683	0.2
684	0.21
685	0.19
686	0.23
687	0.17
688	0.16
689	0.15
690	0.18
691	0.19
692	0.2
693	0.19
694	0.17
695	0.19
696	0.21
697	0.21
698	0.18
699	0.17
700	0.14
701	0.14
702	0.14
703	0.12
704	0.14
705	0.16
706	0.19
707	0.21
708	0.27
709	0.29
710	0.3
711	0.32
712	0.29
713	0.28
714	0.25
715	0.22
716	0.16
717	0.14
718	0.11
719	0.08
720	0.08
721	0.07
722	0.06
723	0.05
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.04
728	0.03
729	0.03
730	0.03
731	0.04
732	0.04
733	0.04
734	0.04
735	0.04
736	0.04
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.06
741	0.07
742	0.07
743	0.11
744	0.11
745	0.1
746	0.1
747	0.1
748	0.11
749	0.19
750	0.25
751	0.23
752	0.23
753	0.25
754	0.25
755	0.26
756	0.27
757	0.2
758	0.17
759	0.16
760	0.19
761	0.23
762	0.25
763	0.28
764	0.35
765	0.42
766	0.43
767	0.44
768	0.4
769	0.37
770	0.36
771	0.32
772	0.25
773	0.18
774	0.14
775	0.13
776	0.13
777	0.1
778	0.09
779	0.09
780	0.07
781	0.07
782	0.07
783	0.06
784	0.07
785	0.07
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.06
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.06
795	0.06
796	0.07
797	0.07
798	0.07
799	0.07
800	0.07
801	0.07
802	0.05
803	0.04
804	0.06
805	0.06
806	0.06
807	0.07
808	0.06
809	0.06
810	0.07
811	0.08
812	0.08
813	0.08
814	0.08
815	0.11
816	0.12
817	0.12
818	0.12
819	0.13
820	0.11
821	0.12
822	0.12
823	0.09
824	0.12
825	0.14
826	0.13
827	0.14
828	0.18
829	0.2
830	0.3
831	0.32
832	0.34
833	0.33
834	0.33
835	0.35
836	0.33
837	0.34
838	0.27
839	0.28
840	0.26
841	0.26
842	0.26
843	0.23
844	0.22
845	0.21
846	0.2
847	0.19
848	0.2
849	0.21
850	0.21
851	0.21
852	0.19
853	0.17
854	0.16
855	0.13
856	0.11
857	0.1
858	0.09
859	0.09
860	0.09
861	0.1
862	0.11
863	0.11
864	0.09
865	0.11
866	0.14
867	0.15
868	0.15
869	0.16
870	0.16
871	0.17
872	0.19
873	0.19
874	0.15
875	0.15
876	0.15
877	0.14
878	0.13
879	0.15
880	0.17
881	0.2
882	0.21
883	0.22
884	0.22
885	0.22
886	0.29
887	0.33
888	0.35
889	0.34
890	0.38
891	0.46
892	0.5
893	0.49
894	0.45
895	0.46
896	0.45
897	0.48
898	0.43
899	0.34
900	0.31
901	0.35
902	0.35
903	0.31
904	0.31
905	0.25
906	0.26
907	0.26
908	0.25
909	0.21
910	0.2
911	0.19
912	0.17
913	0.18
914	0.2
915	0.28
916	0.3
917	0.31
918	0.33
919	0.39
920	0.44
921	0.53
922	0.59
923	0.56
924	0.55
925	0.53
926	0.49
927	0.41
928	0.33
929	0.22
930	0.13
931	0.07
932	0.06
933	0.05
934	0.05
935	0.04
936	0.04
937	0.04
938	0.04
939	0.04
940	0.05
941	0.05
942	0.05
943	0.06
944	0.06
945	0.06
946	0.05
947	0.05
948	0.05
949	0.05
950	0.05
951	0.05
952	0.06
953	0.06
954	0.06
955	0.06
956	0.06
957	0.07
958	0.1
959	0.11
960	0.13
961	0.16
962	0.23
963	0.24
964	0.26
965	0.25
966	0.25
967	0.25
968	0.26
969	0.25
970	0.19
971	0.2
972	0.18
973	0.17
974	0.15
975	0.2
976	0.17
977	0.19
978	0.19
979	0.2
980	0.19
981	0.19
982	0.21
983	0.17
984	0.18
985	0.15
986	0.15
987	0.13
988	0.13
989	0.13
990	0.11
991	0.09
992	0.07
993	0.07
994	0.08
995	0.09
996	0.09
997	0.1
998	0.11
999	0.14
1000	0.2
1001	0.21
1002	0.24
1003	0.26
1004	0.27
1005	0.28
1006	0.31
1007	0.28
1008	0.26
1009	0.25
1010	0.22
1011	0.24
1012	0.22
1013	0.21
1014	0.22
1015	0.27
1016	0.3
1017	0.36
1018	0.36
1019	0.34
1020	0.44
1021	0.48
1022	0.48
1023	0.5
1024	0.51
1025	0.49
1026	0.53
1027	0.59
1028	0.49
1029	0.46
1030	0.44
1031	0.38
1032	0.31
1033	0.28
1034	0.24
1035	0.15
1036	0.15
1037	0.14
1038	0.11
1039	0.13
1040	0.13
1041	0.16
1042	0.15
1043	0.16
1044	0.17
1045	0.2
1046	0.2
1047	0.2
1048	0.21
1049	0.18
1050	0.18
1051	0.18
1052	0.18
1053	0.18
1054	0.17
1055	0.15
1056	0.12
1057	0.11
1058	0.12
1059	0.12
1060	0.15
1061	0.12
1062	0.16
1063	0.19
1064	0.19
1065	0.2
1066	0.19
1067	0.21
1068	0.18
1069	0.21
1070	0.23
1071	0.21
1072	0.21
1073	0.2
1074	0.19
1075	0.17
1076	0.17
1077	0.16
1078	0.12
1079	0.12

A0A1X2GHK8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer