FuNGI

A0A1X2GEP7

Protein Details

Accession

A0A1X2GEP7

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
364-385	DQEKSAKKKLLKKGLKKKEGLS	Basic
490-514	MTTKEFLLHFRKRIKKNEQNKTIVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
367-398	KSAKKKLLKKGLKKKEGLSKPIGRPGSPSLHH

Subcellular Location(s)

nucl 24.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MNQFARPVKLHRKDPNVLYYERVYQNRQNNNYQGRQQESSNDPNTPATPAGNDVKDANGQPSTSAPASSNNRSSFPYHSRYERQNGPRTGADTSLIAPMGGAIKHKQLLFKKRTRQIYLSKDDTRDLKEQEYRPWVLEDYDAQHSFTGSLEGGQRSDYVLFVLTDNGFKVVSLDRWYKFQQRRNIRTMTADEAEEQMKKEKKLARHESTRWMMIDRLEGEDEPVLQPTTKRFRVADTDGPKVKREDGEDRTRDDSDIDDIDFDDVFQDDEEVAHDVEVEDDDVKEGRQRIKKEIKGYGPNGDQDDDDDDMAEEKLTSEGKQLRKLVRDLEKNRAYESDEERDPYASSADDMDTDVEEESEKEDDQEKSAKKKLLKKGLKKKEGLSKPIGRPGSPSLHHVKREHGTALGKRSLTQSASRSGSSSPSRNNARSPAGSLPSSPLGALSSSGKDVRKRKVDDQDGNRATKLAAPDDPTIITEAEVIDVLRNKPMTTKEFLLHFRKRIKKNEQNKTIVASLLKKIARRINTDDPNVKSLELKPEYA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.78
3	0.72
4	0.65
5	0.59
6	0.53
7	0.52
8	0.52
9	0.49
10	0.46
11	0.49
12	0.57
13	0.63
14	0.65
15	0.65
16	0.67
17	0.71
18	0.72
19	0.71
20	0.69
21	0.65
22	0.61
23	0.55
24	0.53
25	0.51
26	0.53
27	0.5
28	0.44
29	0.4
30	0.4
31	0.39
32	0.34
33	0.29
34	0.21
35	0.19
36	0.22
37	0.26
38	0.24
39	0.24
40	0.22
41	0.23
42	0.25
43	0.25
44	0.24
45	0.2
46	0.19
47	0.18
48	0.19
49	0.22
50	0.19
51	0.19
52	0.16
53	0.23
54	0.3
55	0.35
56	0.41
57	0.38
58	0.4
59	0.42
60	0.44
61	0.43
62	0.43
63	0.43
64	0.41
65	0.47
66	0.51
67	0.56
68	0.61
69	0.63
70	0.65
71	0.69
72	0.67
73	0.64
74	0.6
75	0.55
76	0.49
77	0.4
78	0.32
79	0.23
80	0.21
81	0.18
82	0.15
83	0.12
84	0.1
85	0.1
86	0.1
87	0.1
88	0.11
89	0.11
90	0.14
91	0.18
92	0.19
93	0.26
94	0.32
95	0.42
96	0.5
97	0.58
98	0.64
99	0.69
100	0.77
101	0.77
102	0.76
103	0.75
104	0.75
105	0.74
106	0.72
107	0.69
108	0.62
109	0.58
110	0.55
111	0.5
112	0.45
113	0.4
114	0.38
115	0.41
116	0.41
117	0.45
118	0.48
119	0.44
120	0.4
121	0.39
122	0.34
123	0.27
124	0.26
125	0.21
126	0.18
127	0.23
128	0.22
129	0.2
130	0.2
131	0.19
132	0.18
133	0.16
134	0.13
135	0.07
136	0.08
137	0.11
138	0.12
139	0.12
140	0.12
141	0.12
142	0.11
143	0.12
144	0.1
145	0.07
146	0.08
147	0.08
148	0.08
149	0.09
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.09
157	0.08
158	0.1
159	0.14
160	0.19
161	0.19
162	0.24
163	0.28
164	0.36
165	0.42
166	0.48
167	0.53
168	0.59
169	0.65
170	0.68
171	0.68
172	0.6
173	0.56
174	0.52
175	0.47
176	0.37
177	0.3
178	0.24
179	0.22
180	0.22
181	0.18
182	0.16
183	0.18
184	0.2
185	0.2
186	0.26
187	0.29
188	0.35
189	0.45
190	0.55
191	0.56
192	0.61
193	0.64
194	0.66
195	0.65
196	0.6
197	0.49
198	0.41
199	0.34
200	0.26
201	0.26
202	0.18
203	0.16
204	0.14
205	0.13
206	0.13
207	0.12
208	0.12
209	0.09
210	0.09
211	0.07
212	0.07
213	0.08
214	0.13
215	0.2
216	0.21
217	0.23
218	0.23
219	0.25
220	0.31
221	0.36
222	0.39
223	0.35
224	0.4
225	0.42
226	0.43
227	0.42
228	0.37
229	0.34
230	0.27
231	0.28
232	0.29
233	0.31
234	0.39
235	0.4
236	0.42
237	0.42
238	0.41
239	0.36
240	0.29
241	0.23
242	0.15
243	0.14
244	0.11
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.07
249	0.06
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.03
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.04
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.04
271	0.07
272	0.09
273	0.16
274	0.21
275	0.24
276	0.32
277	0.42
278	0.46
279	0.5
280	0.54
281	0.54
282	0.56
283	0.55
284	0.52
285	0.44
286	0.42
287	0.37
288	0.31
289	0.24
290	0.18
291	0.18
292	0.13
293	0.11
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.05
300	0.04
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.1
305	0.17
306	0.2
307	0.26
308	0.3
309	0.34
310	0.37
311	0.38
312	0.41
313	0.43
314	0.5
315	0.48
316	0.53
317	0.55
318	0.52
319	0.51
320	0.45
321	0.39
322	0.34
323	0.35
324	0.3
325	0.26
326	0.27
327	0.26
328	0.25
329	0.23
330	0.19
331	0.14
332	0.09
333	0.09
334	0.08
335	0.08
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.06
344	0.05
345	0.06
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.11
350	0.12
351	0.14
352	0.21
353	0.23
354	0.28
355	0.34
356	0.38
357	0.41
358	0.5
359	0.57
360	0.61
361	0.68
362	0.73
363	0.78
364	0.84
365	0.86
366	0.81
367	0.78
368	0.77
369	0.75
370	0.71
371	0.68
372	0.66
373	0.62
374	0.66
375	0.6
376	0.5
377	0.46
378	0.45
379	0.43
380	0.35
381	0.36
382	0.37
383	0.41
384	0.47
385	0.45
386	0.46
387	0.42
388	0.44
389	0.41
390	0.36
391	0.36
392	0.35
393	0.4
394	0.38
395	0.35
396	0.33
397	0.34
398	0.33
399	0.3
400	0.3
401	0.27
402	0.29
403	0.32
404	0.31
405	0.29
406	0.27
407	0.31
408	0.31
409	0.34
410	0.32
411	0.37
412	0.44
413	0.46
414	0.49
415	0.48
416	0.48
417	0.44
418	0.44
419	0.41
420	0.38
421	0.35
422	0.32
423	0.3
424	0.26
425	0.25
426	0.2
427	0.15
428	0.12
429	0.12
430	0.12
431	0.11
432	0.11
433	0.13
434	0.17
435	0.21
436	0.28
437	0.35
438	0.43
439	0.5
440	0.55
441	0.62
442	0.68
443	0.75
444	0.77
445	0.78
446	0.8
447	0.76
448	0.72
449	0.63
450	0.53
451	0.42
452	0.36
453	0.31
454	0.23
455	0.21
456	0.23
457	0.25
458	0.26
459	0.26
460	0.23
461	0.22
462	0.19
463	0.15
464	0.12
465	0.1
466	0.09
467	0.09
468	0.08
469	0.09
470	0.13
471	0.14
472	0.17
473	0.18
474	0.18
475	0.22
476	0.28
477	0.3
478	0.32
479	0.36
480	0.35
481	0.41
482	0.48
483	0.53
484	0.54
485	0.57
486	0.61
487	0.67
488	0.72
489	0.76
490	0.8
491	0.81
492	0.85
493	0.88
494	0.88
495	0.85
496	0.8
497	0.74
498	0.65
499	0.57
500	0.5
501	0.44
502	0.37
503	0.37
504	0.38
505	0.35
506	0.4
507	0.45
508	0.48
509	0.5
510	0.55
511	0.58
512	0.64
513	0.7
514	0.71
515	0.67
516	0.64
517	0.58
518	0.51
519	0.44
520	0.39
521	0.41

A0A1X2GEP7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer