Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2GCC8

Protein Details
Accession A0A1X2GCC8    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
446-471ARERDELRRERQKRREREYRMQHMGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
386-419SRRPRRRSSSASSRGGRPRRGSHSSASSREERHR
454-460RERQKRR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, mito 3, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MATLSSLLPKPKHTLETVSNQRQSQTLNQQLISTTKSIPAYGQRQSYRPRFPEDFGNGGAFPEINIVQYPLDMGRKKSSETSGGTLTLEVDREGNVAYDAIARQGHAKDRIVHTSLKDMVPIRERKDVDVDKLVMDRPSEDEVMSVAEKTKAALERIVNGKIKAAQPKNVVSTSGGTNKDPTYIRYTPAQGGSNGATQRIIRMVDAPVDPMAPPSFQHKKIPRGPPSPPAPVMHSPPRKLTAEQQAEWIIPPCISNWKNTKGYTIPLDKRLAADGRGLQELTINDKFAKFSEALGAADRHAREEVRQRNLMQQKLAQKEKDVEEEKLRSLAQKAREERSGFKSAAADDVPPSTAQNRPSAASLMLNYDSSSGSDSGSDSEDDKNASRRPRRRSSSASSRGGRPRRGSHSSASSREERHRRQPSDSDDATPPRRTREQLEKVDDNMARERDELRRERQKRREREYRMQHMGTEARAKHLARQQNRDVSEKIALGLAKPSASSKESMYDARLFNQSAGLSSGFKDEESYSLYDKPLFNQTASSIYKFRGNTQDSEIFGSMDSDELEKSIHQDKFGVKHGFKGAEGGVAGSSSGPVEFEKEIKVTKSSKKQDDVYGLDTFLNKAKKGKRSHEDLDDSDDDRRHKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.44
3 0.53
4 0.6
5 0.63
6 0.64
7 0.6
8 0.58
9 0.53
10 0.5
11 0.49
12 0.49
13 0.48
14 0.46
15 0.46
16 0.46
17 0.45
18 0.44
19 0.38
20 0.3
21 0.22
22 0.22
23 0.23
24 0.22
25 0.24
26 0.3
27 0.34
28 0.37
29 0.45
30 0.44
31 0.49
32 0.58
33 0.64
34 0.65
35 0.63
36 0.66
37 0.61
38 0.6
39 0.63
40 0.6
41 0.55
42 0.46
43 0.45
44 0.36
45 0.32
46 0.3
47 0.2
48 0.14
49 0.13
50 0.11
51 0.09
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.18
59 0.2
60 0.23
61 0.3
62 0.32
63 0.34
64 0.38
65 0.4
66 0.39
67 0.4
68 0.41
69 0.36
70 0.35
71 0.33
72 0.28
73 0.25
74 0.19
75 0.16
76 0.12
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.14
91 0.17
92 0.23
93 0.25
94 0.29
95 0.33
96 0.37
97 0.43
98 0.41
99 0.42
100 0.37
101 0.39
102 0.39
103 0.33
104 0.32
105 0.29
106 0.31
107 0.36
108 0.41
109 0.38
110 0.43
111 0.43
112 0.42
113 0.49
114 0.48
115 0.44
116 0.44
117 0.41
118 0.34
119 0.35
120 0.34
121 0.26
122 0.23
123 0.19
124 0.16
125 0.19
126 0.18
127 0.16
128 0.14
129 0.13
130 0.15
131 0.14
132 0.11
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.19
141 0.19
142 0.24
143 0.28
144 0.33
145 0.32
146 0.29
147 0.3
148 0.3
149 0.34
150 0.37
151 0.37
152 0.38
153 0.4
154 0.43
155 0.46
156 0.42
157 0.38
158 0.3
159 0.29
160 0.27
161 0.29
162 0.27
163 0.23
164 0.25
165 0.24
166 0.27
167 0.26
168 0.24
169 0.26
170 0.26
171 0.27
172 0.28
173 0.31
174 0.3
175 0.33
176 0.32
177 0.23
178 0.24
179 0.24
180 0.24
181 0.22
182 0.19
183 0.16
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.14
188 0.1
189 0.11
190 0.12
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.08
200 0.09
201 0.15
202 0.22
203 0.24
204 0.33
205 0.39
206 0.47
207 0.56
208 0.65
209 0.66
210 0.66
211 0.67
212 0.66
213 0.65
214 0.61
215 0.55
216 0.46
217 0.43
218 0.4
219 0.41
220 0.43
221 0.43
222 0.4
223 0.4
224 0.43
225 0.4
226 0.38
227 0.4
228 0.41
229 0.41
230 0.39
231 0.39
232 0.35
233 0.34
234 0.32
235 0.27
236 0.16
237 0.11
238 0.1
239 0.08
240 0.16
241 0.16
242 0.22
243 0.26
244 0.32
245 0.37
246 0.37
247 0.4
248 0.33
249 0.35
250 0.35
251 0.38
252 0.35
253 0.35
254 0.37
255 0.33
256 0.32
257 0.32
258 0.27
259 0.19
260 0.18
261 0.16
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.13
266 0.14
267 0.13
268 0.16
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.13
273 0.14
274 0.12
275 0.14
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.2
291 0.27
292 0.29
293 0.32
294 0.32
295 0.4
296 0.45
297 0.44
298 0.37
299 0.35
300 0.36
301 0.4
302 0.43
303 0.35
304 0.31
305 0.33
306 0.33
307 0.35
308 0.3
309 0.26
310 0.26
311 0.27
312 0.26
313 0.24
314 0.23
315 0.17
316 0.18
317 0.2
318 0.22
319 0.28
320 0.32
321 0.33
322 0.38
323 0.38
324 0.4
325 0.42
326 0.39
327 0.32
328 0.29
329 0.27
330 0.23
331 0.23
332 0.19
333 0.13
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.11
341 0.12
342 0.15
343 0.15
344 0.16
345 0.17
346 0.17
347 0.16
348 0.14
349 0.13
350 0.12
351 0.11
352 0.1
353 0.1
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.12
370 0.15
371 0.19
372 0.27
373 0.34
374 0.41
375 0.5
376 0.59
377 0.65
378 0.68
379 0.71
380 0.72
381 0.74
382 0.75
383 0.74
384 0.66
385 0.66
386 0.68
387 0.67
388 0.64
389 0.58
390 0.56
391 0.56
392 0.59
393 0.55
394 0.51
395 0.54
396 0.54
397 0.52
398 0.49
399 0.46
400 0.44
401 0.49
402 0.54
403 0.51
404 0.56
405 0.62
406 0.61
407 0.63
408 0.66
409 0.64
410 0.63
411 0.58
412 0.52
413 0.46
414 0.48
415 0.47
416 0.45
417 0.4
418 0.36
419 0.39
420 0.38
421 0.4
422 0.46
423 0.51
424 0.54
425 0.6
426 0.56
427 0.54
428 0.58
429 0.53
430 0.44
431 0.39
432 0.32
433 0.25
434 0.24
435 0.25
436 0.24
437 0.31
438 0.34
439 0.38
440 0.48
441 0.55
442 0.65
443 0.73
444 0.78
445 0.8
446 0.84
447 0.86
448 0.85
449 0.87
450 0.87
451 0.87
452 0.84
453 0.75
454 0.66
455 0.59
456 0.52
457 0.43
458 0.4
459 0.3
460 0.26
461 0.29
462 0.29
463 0.31
464 0.36
465 0.42
466 0.43
467 0.51
468 0.55
469 0.58
470 0.61
471 0.59
472 0.53
473 0.47
474 0.43
475 0.35
476 0.28
477 0.22
478 0.19
479 0.15
480 0.16
481 0.14
482 0.11
483 0.11
484 0.12
485 0.13
486 0.14
487 0.15
488 0.14
489 0.17
490 0.19
491 0.21
492 0.23
493 0.25
494 0.25
495 0.26
496 0.28
497 0.25
498 0.23
499 0.24
500 0.2
501 0.16
502 0.17
503 0.15
504 0.13
505 0.13
506 0.15
507 0.13
508 0.12
509 0.13
510 0.12
511 0.13
512 0.15
513 0.17
514 0.17
515 0.19
516 0.2
517 0.22
518 0.22
519 0.23
520 0.28
521 0.27
522 0.25
523 0.25
524 0.25
525 0.29
526 0.31
527 0.31
528 0.25
529 0.24
530 0.3
531 0.29
532 0.33
533 0.36
534 0.36
535 0.36
536 0.42
537 0.45
538 0.4
539 0.44
540 0.39
541 0.29
542 0.26
543 0.24
544 0.17
545 0.12
546 0.12
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.11
553 0.19
554 0.2
555 0.2
556 0.24
557 0.28
558 0.33
559 0.41
560 0.46
561 0.38
562 0.43
563 0.48
564 0.46
565 0.41
566 0.39
567 0.31
568 0.25
569 0.24
570 0.19
571 0.13
572 0.11
573 0.11
574 0.08
575 0.08
576 0.06
577 0.05
578 0.06
579 0.06
580 0.09
581 0.1
582 0.12
583 0.14
584 0.17
585 0.2
586 0.21
587 0.27
588 0.31
589 0.39
590 0.48
591 0.55
592 0.62
593 0.66
594 0.69
595 0.71
596 0.72
597 0.67
598 0.61
599 0.53
600 0.45
601 0.4
602 0.35
603 0.29
604 0.27
605 0.26
606 0.24
607 0.31
608 0.38
609 0.45
610 0.54
611 0.63
612 0.66
613 0.71
614 0.76
615 0.78
616 0.77
617 0.71
618 0.69
619 0.62
620 0.55
621 0.51
622 0.47