Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2GIT0

Protein Details
Accession A0A1X2GIT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-404FAVIISKSNRKSRKHNKKAKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-404SNRKSRKHNKKAKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003892  CUE  
IPR045124  Su(sable)-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF02845  CUE  
PF18345  zf_CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51140  CUE  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd14279  CUE  
Amino Acid Sequences MSPPQKEDLVLSSPGSPLTSTTSPPTTPFQHLSTAETHRMDQFDPFNSESFQQEDFDNLSNLLSRELLEDVESASSLPSPQPLKRSLPHPAILSTSSSSSTNTNHSPLPPPPSSTAFSSHRPASTSHSYSPIINTIKDTSTLTTAWSNHRLDTTTWTYPPRNVTTVTAVPTVSSPQRANDTHWHRFDPYGSEAEFDPTLPPDQPDNLPSSPLTNFVVLAGSGLAAHAPPLSPSTTETLATTQIIHQLMTLLPEKSEQDIAQTLASCDYDLERTMDDLLGASANRPSYLSPRLKAARSSLMATPPSTPRRRQVCRHYLAGECYRKDCWFSHDLEVKPCKFWLQGSCLKGNTCEFSHNIQVQPQPQQPAREEHLAISAQQPTVADFAVIISKSNRKSRKHNKKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.16
4 0.13
5 0.18
6 0.19
7 0.2
8 0.24
9 0.27
10 0.27
11 0.3
12 0.35
13 0.33
14 0.37
15 0.39
16 0.36
17 0.39
18 0.39
19 0.39
20 0.4
21 0.41
22 0.41
23 0.38
24 0.38
25 0.34
26 0.35
27 0.32
28 0.32
29 0.3
30 0.28
31 0.31
32 0.31
33 0.29
34 0.29
35 0.29
36 0.26
37 0.25
38 0.21
39 0.18
40 0.16
41 0.17
42 0.18
43 0.19
44 0.17
45 0.15
46 0.14
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.12
66 0.15
67 0.18
68 0.23
69 0.28
70 0.34
71 0.37
72 0.42
73 0.46
74 0.47
75 0.48
76 0.45
77 0.41
78 0.38
79 0.35
80 0.32
81 0.25
82 0.21
83 0.18
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.17
88 0.19
89 0.2
90 0.21
91 0.22
92 0.23
93 0.27
94 0.28
95 0.34
96 0.3
97 0.31
98 0.32
99 0.34
100 0.34
101 0.32
102 0.34
103 0.31
104 0.33
105 0.35
106 0.34
107 0.31
108 0.3
109 0.29
110 0.3
111 0.34
112 0.35
113 0.32
114 0.33
115 0.33
116 0.33
117 0.32
118 0.32
119 0.25
120 0.22
121 0.22
122 0.2
123 0.19
124 0.2
125 0.2
126 0.14
127 0.15
128 0.14
129 0.14
130 0.15
131 0.16
132 0.2
133 0.25
134 0.25
135 0.23
136 0.24
137 0.24
138 0.22
139 0.26
140 0.28
141 0.24
142 0.25
143 0.29
144 0.29
145 0.3
146 0.34
147 0.3
148 0.27
149 0.25
150 0.25
151 0.26
152 0.27
153 0.26
154 0.22
155 0.19
156 0.17
157 0.16
158 0.16
159 0.13
160 0.14
161 0.12
162 0.13
163 0.18
164 0.19
165 0.22
166 0.29
167 0.37
168 0.41
169 0.42
170 0.42
171 0.38
172 0.38
173 0.35
174 0.3
175 0.24
176 0.19
177 0.17
178 0.16
179 0.15
180 0.16
181 0.15
182 0.11
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.15
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.15
197 0.14
198 0.15
199 0.14
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.05
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.02
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.08
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.09
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.12
236 0.13
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.13
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.11
252 0.08
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.13
274 0.22
275 0.27
276 0.26
277 0.33
278 0.38
279 0.4
280 0.41
281 0.41
282 0.39
283 0.35
284 0.37
285 0.32
286 0.33
287 0.32
288 0.3
289 0.3
290 0.3
291 0.37
292 0.4
293 0.41
294 0.45
295 0.54
296 0.61
297 0.67
298 0.71
299 0.72
300 0.72
301 0.74
302 0.68
303 0.62
304 0.6
305 0.61
306 0.56
307 0.47
308 0.45
309 0.42
310 0.39
311 0.39
312 0.34
313 0.31
314 0.29
315 0.31
316 0.37
317 0.42
318 0.43
319 0.48
320 0.55
321 0.5
322 0.47
323 0.43
324 0.37
325 0.31
326 0.33
327 0.31
328 0.32
329 0.38
330 0.41
331 0.45
332 0.45
333 0.44
334 0.43
335 0.39
336 0.35
337 0.29
338 0.28
339 0.26
340 0.29
341 0.36
342 0.36
343 0.35
344 0.36
345 0.39
346 0.4
347 0.45
348 0.45
349 0.45
350 0.45
351 0.49
352 0.47
353 0.5
354 0.51
355 0.49
356 0.45
357 0.39
358 0.39
359 0.35
360 0.32
361 0.29
362 0.27
363 0.2
364 0.2
365 0.19
366 0.16
367 0.17
368 0.16
369 0.12
370 0.08
371 0.09
372 0.13
373 0.13
374 0.13
375 0.16
376 0.23
377 0.3
378 0.4
379 0.47
380 0.5
381 0.62
382 0.72
383 0.79
384 0.83