FuNGI

A0A1X2GJA0

Protein Details

Accession

A0A1X2GJA0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1032-1053	NANARKPTRGAKKKVKVFTVRN	Hydrophilic
1194-1217	RDDVPAKTPVKKTKPAREPEEQDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1036-1045	RKPTRGAKKK

Subcellular Location(s)

mito 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR002885 Pentatricopeptide_repeat IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51375 PPR PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MSLPLVRQATSANKGRWSWLPRSRSLLFNQDRSSRVLRASYATTTLAKPTDQTQEAAHKHIILPNPSHPDFKTQARVVPTGIAEQFAVLHACIQSGAMDRAQRMLNELYRNRSDEMRVFVDTQMYNTFLNGFVSGSSPPSTDDCLAWFDRMKSYGVTPDANTYAILVKGFLKNQSYRTVKILLQDMRTNTPIPIKDVLGSNFLQPEQVADFSKVVQEYQQNQQTDIQELLSELQQATETLASREPQSTPIPSTPAPSPSMLDSSRPLYKDVPSANPTKAVGVKFLQEQLSALGNTNEVMKMDPVDLQMELERQGYEVALQRLVHEREAHRERGDTLNAMHLSPLKKVLWKWHRDMIPMIEKEIEACTQITDKRDPERKMYGPFLSLLPPEKLSIIAILELLKLHNSSGISDGMKTARAVIEVGKAVEAEYNATYMKRNKTVRQQELRQLYSSGKLLNLTVRKAYQRQQEELQRQQSGSTVPTIITGDQTMDLGGGPGAAWHPVWPNTIRAKLGSVLTSMVIDAAKIPIPSHNPETGEKIIEQIPAFFHTYQYVRGKRVGIIRFSDQLTNIVAREPLRDTLHPRLMPMIVHPRAWLSYNDGGYLSAKSMCMRVKDSPEQLVYLAKASENNNIDHVLKGLDVLGSTKWRVNKQVFDVILEAWNSGKAIADIPPALSESQPLPPKPENYDSDPKAKFLWVSRVKEIQTNEKNYHSLRCDVNYKVETARAFLNLPMYFPHNMDFRGRAYPIPPTLNHLGNDLCRGLLCFDEAKPLGERGWRWLKIHMANLYGYDKHSFSEREQFTLDNLDNIIDSVKNPLTGRKWWLAAEDPWQCLAACYEVAAAVESGDPLTYGSRLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDLAGAQAVNLAPGDRPADVYTGVADLVNKLVEQEAAKGDELAKLLVGKISRKVVKQTVMTNVYGVTFIGAKAQIESRLKERGDLPPEKIYILSGYLAKKVFASLGEMFNGARQIQDWLTDSARRIARSIPKETLQESGMIPFDSPDDEAAHAQRLANANANARKPTRGAKKKVKVFTVRNPSANQMTSVIWTTPLGLPIVQPYRRHGKKQVTTLLQTVFIEDPDASRPVNAMKQSTAFPPNFIHSLDATHMLMSASACYEQGLTFASVHDSYWTHACDVDAMNKVIRDQFIELHSQPIMSNLFDEFQERYKNYKLPVTHERDDVPAKTPVKKTKPAREPEEQDPSQLSAQEAMFGSSLLDDVDEDLADDDVDEEAEDTSPSSQRRYTYGWEDLTFAPLPAKGEFDINQVKESDYFFH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.47
3	0.51
4	0.51
5	0.53
6	0.54
7	0.57
8	0.56
9	0.63
10	0.62
11	0.59
12	0.58
13	0.59
14	0.56
15	0.57
16	0.59
17	0.57
18	0.55
19	0.55
20	0.55
21	0.47
22	0.44
23	0.4
24	0.36
25	0.34
26	0.36
27	0.33
28	0.31
29	0.3
30	0.29
31	0.27
32	0.29
33	0.26
34	0.23
35	0.22
36	0.24
37	0.3
38	0.29
39	0.29
40	0.3
41	0.38
42	0.4
43	0.43
44	0.4
45	0.33
46	0.33
47	0.37
48	0.38
49	0.34
50	0.36
51	0.39
52	0.46
53	0.46
54	0.48
55	0.44
56	0.45
57	0.45
58	0.47
59	0.49
60	0.43
61	0.46
62	0.47
63	0.48
64	0.41
65	0.41
66	0.35
67	0.31
68	0.28
69	0.24
70	0.19
71	0.17
72	0.16
73	0.13
74	0.13
75	0.08
76	0.1
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.09
82	0.12
83	0.14
84	0.15
85	0.18
86	0.18
87	0.22
88	0.24
89	0.22
90	0.23
91	0.26
92	0.29
93	0.36
94	0.4
95	0.43
96	0.45
97	0.48
98	0.46
99	0.44
100	0.43
101	0.39
102	0.4
103	0.36
104	0.35
105	0.33
106	0.32
107	0.34
108	0.3
109	0.27
110	0.23
111	0.22
112	0.19
113	0.18
114	0.18
115	0.13
116	0.14
117	0.12
118	0.1
119	0.08
120	0.1
121	0.1
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.13
126	0.15
127	0.19
128	0.18
129	0.18
130	0.18
131	0.21
132	0.22
133	0.23
134	0.23
135	0.21
136	0.24
137	0.25
138	0.25
139	0.22
140	0.23
141	0.26
142	0.27
143	0.27
144	0.24
145	0.27
146	0.27
147	0.26
148	0.23
149	0.18
150	0.17
151	0.15
152	0.14
153	0.11
154	0.13
155	0.16
156	0.18
157	0.21
158	0.25
159	0.28
160	0.31
161	0.4
162	0.41
163	0.4
164	0.42
165	0.42
166	0.38
167	0.39
168	0.44
169	0.39
170	0.39
171	0.41
172	0.41
173	0.41
174	0.41
175	0.38
176	0.31
177	0.33
178	0.3
179	0.29
180	0.29
181	0.25
182	0.26
183	0.29
184	0.29
185	0.26
186	0.25
187	0.23
188	0.22
189	0.21
190	0.19
191	0.15
192	0.15
193	0.13
194	0.15
195	0.15
196	0.15
197	0.15
198	0.15
199	0.18
200	0.17
201	0.15
202	0.17
203	0.21
204	0.24
205	0.32
206	0.38
207	0.36
208	0.38
209	0.42
210	0.4
211	0.36
212	0.32
213	0.23
214	0.17
215	0.16
216	0.16
217	0.12
218	0.12
219	0.09
220	0.09
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.12
228	0.13
229	0.15
230	0.17
231	0.17
232	0.19
233	0.21
234	0.23
235	0.25
236	0.26
237	0.29
238	0.27
239	0.3
240	0.29
241	0.29
242	0.28
243	0.25
244	0.24
245	0.21
246	0.26
247	0.23
248	0.22
249	0.21
250	0.24
251	0.27
252	0.27
253	0.27
254	0.25
255	0.26
256	0.31
257	0.32
258	0.34
259	0.34
260	0.37
261	0.35
262	0.36
263	0.34
264	0.3
265	0.31
266	0.25
267	0.24
268	0.22
269	0.23
270	0.22
271	0.25
272	0.23
273	0.19
274	0.18
275	0.16
276	0.18
277	0.16
278	0.14
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.1
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.08
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.11
297	0.11
298	0.1
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.09
303	0.13
304	0.14
305	0.15
306	0.15
307	0.17
308	0.23
309	0.25
310	0.25
311	0.25
312	0.25
313	0.33
314	0.38
315	0.4
316	0.34
317	0.34
318	0.35
319	0.35
320	0.35
321	0.27
322	0.22
323	0.25
324	0.25
325	0.23
326	0.21
327	0.2
328	0.2
329	0.19
330	0.23
331	0.17
332	0.2
333	0.22
334	0.32
335	0.38
336	0.43
337	0.47
338	0.5
339	0.52
340	0.5
341	0.52
342	0.48
343	0.47
344	0.41
345	0.38
346	0.31
347	0.28
348	0.26
349	0.25
350	0.18
351	0.1
352	0.1
353	0.09
354	0.11
355	0.14
356	0.17
357	0.2
358	0.23
359	0.3
360	0.39
361	0.4
362	0.43
363	0.49
364	0.49
365	0.5
366	0.51
367	0.44
368	0.37
369	0.36
370	0.31
371	0.25
372	0.23
373	0.21
374	0.17
375	0.16
376	0.16
377	0.15
378	0.14
379	0.12
380	0.11
381	0.09
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.08
392	0.08
393	0.08
394	0.1
395	0.12
396	0.12
397	0.12
398	0.13
399	0.12
400	0.13
401	0.12
402	0.11
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.09
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.1
411	0.1
412	0.09
413	0.1
414	0.09
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.12
421	0.16
422	0.21
423	0.27
424	0.31
425	0.36
426	0.47
427	0.57
428	0.64
429	0.67
430	0.68
431	0.69
432	0.72
433	0.68
434	0.58
435	0.5
436	0.41
437	0.34
438	0.3
439	0.22
440	0.15
441	0.13
442	0.13
443	0.17
444	0.18
445	0.17
446	0.18
447	0.2
448	0.23
449	0.26
450	0.32
451	0.35
452	0.37
453	0.39
454	0.43
455	0.5
456	0.54
457	0.57
458	0.56
459	0.49
460	0.44
461	0.41
462	0.35
463	0.28
464	0.22
465	0.16
466	0.11
467	0.1
468	0.11
469	0.11
470	0.1
471	0.09
472	0.08
473	0.07
474	0.07
475	0.07
476	0.06
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.03
483	0.03
484	0.03
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.07
489	0.08
490	0.11
491	0.11
492	0.16
493	0.2
494	0.22
495	0.22
496	0.21
497	0.21
498	0.21
499	0.21
500	0.16
501	0.13
502	0.11
503	0.1
504	0.1
505	0.08
506	0.07
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.06
512	0.06
513	0.07
514	0.09
515	0.12
516	0.15
517	0.18
518	0.2
519	0.21
520	0.22
521	0.27
522	0.26
523	0.24
524	0.2
525	0.19
526	0.18
527	0.18
528	0.16
529	0.12
530	0.11
531	0.12
532	0.15
533	0.13
534	0.12
535	0.12
536	0.13
537	0.18
538	0.25
539	0.26
540	0.25
541	0.28
542	0.29
543	0.29
544	0.36
545	0.34
546	0.29
547	0.29
548	0.3
549	0.3
550	0.3
551	0.27
552	0.2
553	0.18
554	0.16
555	0.14
556	0.11
557	0.09
558	0.1
559	0.09
560	0.1
561	0.11
562	0.13
563	0.14
564	0.16
565	0.2
566	0.26
567	0.31
568	0.3
569	0.29
570	0.27
571	0.25
572	0.24
573	0.22
574	0.25
575	0.2
576	0.2
577	0.2
578	0.19
579	0.19
580	0.21
581	0.18
582	0.14
583	0.17
584	0.17
585	0.17
586	0.16
587	0.16
588	0.15
589	0.15
590	0.1
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.1
595	0.11
596	0.12
597	0.15
598	0.18
599	0.23
600	0.27
601	0.29
602	0.29
603	0.27
604	0.26
605	0.23
606	0.21
607	0.16
608	0.12
609	0.1
610	0.07
611	0.09
612	0.1
613	0.15
614	0.16
615	0.16
616	0.16
617	0.17
618	0.18
619	0.15
620	0.14
621	0.09
622	0.07
623	0.07
624	0.06
625	0.05
626	0.04
627	0.05
628	0.05
629	0.06
630	0.07
631	0.09
632	0.12
633	0.13
634	0.2
635	0.22
636	0.25
637	0.27
638	0.32
639	0.31
640	0.29
641	0.28
642	0.22
643	0.2
644	0.17
645	0.13
646	0.07
647	0.07
648	0.06
649	0.05
650	0.05
651	0.04
652	0.05
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.07
658	0.07
659	0.07
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.12
664	0.15
665	0.15
666	0.2
667	0.22
668	0.24
669	0.27
670	0.31
671	0.29
672	0.33
673	0.41
674	0.38
675	0.44
676	0.42
677	0.39
678	0.34
679	0.31
680	0.26
681	0.2
682	0.28
683	0.28
684	0.31
685	0.33
686	0.36
687	0.37
688	0.39
689	0.39
690	0.38
691	0.37
692	0.39
693	0.38
694	0.36
695	0.38
696	0.35
697	0.38
698	0.3
699	0.27
700	0.23
701	0.24
702	0.26
703	0.24
704	0.29
705	0.25
706	0.24
707	0.21
708	0.22
709	0.2
710	0.17
711	0.17
712	0.13
713	0.13
714	0.12
715	0.15
716	0.13
717	0.13
718	0.12
719	0.14
720	0.14
721	0.14
722	0.15
723	0.12
724	0.13
725	0.15
726	0.15
727	0.15
728	0.17
729	0.17
730	0.16
731	0.15
732	0.18
733	0.2
734	0.21
735	0.19
736	0.21
737	0.24
738	0.26
739	0.25
740	0.23
741	0.21
742	0.19
743	0.2
744	0.15
745	0.11
746	0.09
747	0.09
748	0.08
749	0.07
750	0.08
751	0.07
752	0.07
753	0.12
754	0.12
755	0.13
756	0.13
757	0.14
758	0.14
759	0.15
760	0.16
761	0.18
762	0.27
763	0.28
764	0.28
765	0.3
766	0.35
767	0.35
768	0.4
769	0.35
770	0.28
771	0.26
772	0.27
773	0.26
774	0.21
775	0.18
776	0.15
777	0.13
778	0.12
779	0.14
780	0.14
781	0.14
782	0.24
783	0.23
784	0.24
785	0.24
786	0.24
787	0.22
788	0.25
789	0.23
790	0.13
791	0.13
792	0.11
793	0.1
794	0.1
795	0.1
796	0.05
797	0.05
798	0.08
799	0.09
800	0.11
801	0.11
802	0.15
803	0.18
804	0.21
805	0.26
806	0.25
807	0.26
808	0.25
809	0.27
810	0.26
811	0.24
812	0.28
813	0.27
814	0.25
815	0.24
816	0.24
817	0.21
818	0.18
819	0.17
820	0.11
821	0.07
822	0.07
823	0.06
824	0.06
825	0.06
826	0.06
827	0.05
828	0.04
829	0.04
830	0.04
831	0.04
832	0.04
833	0.04
834	0.04
835	0.04
836	0.05
837	0.05
838	0.06
839	0.08
840	0.09
841	0.13
842	0.16
843	0.18
844	0.18
845	0.2
846	0.2
847	0.23
848	0.23
849	0.2
850	0.17
851	0.16
852	0.14
853	0.13
854	0.12
855	0.08
856	0.07
857	0.06
858	0.06
859	0.04
860	0.05
861	0.04
862	0.03
863	0.03
864	0.03
865	0.02
866	0.03
867	0.03
868	0.03
869	0.03
870	0.04
871	0.04
872	0.05
873	0.07
874	0.06
875	0.08
876	0.08
877	0.1
878	0.1
879	0.1
880	0.09
881	0.08
882	0.08
883	0.07
884	0.06
885	0.06
886	0.06
887	0.06
888	0.05
889	0.05
890	0.05
891	0.07
892	0.07
893	0.09
894	0.1
895	0.11
896	0.11
897	0.12
898	0.12
899	0.12
900	0.12
901	0.11
902	0.09
903	0.08
904	0.08
905	0.1
906	0.11
907	0.1
908	0.14
909	0.21
910	0.24
911	0.26
912	0.32
913	0.35
914	0.39
915	0.41
916	0.41
917	0.43
918	0.42
919	0.41
920	0.35
921	0.3
922	0.25
923	0.21
924	0.17
925	0.09
926	0.06
927	0.06
928	0.07
929	0.08
930	0.07
931	0.08
932	0.1
933	0.15
934	0.18
935	0.2
936	0.21
937	0.27
938	0.27
939	0.29
940	0.31
941	0.33
942	0.38
943	0.4
944	0.41
945	0.39
946	0.4
947	0.38
948	0.35
949	0.27
950	0.2
951	0.17
952	0.15
953	0.13
954	0.14
955	0.17
956	0.17
957	0.17
958	0.16
959	0.15
960	0.15
961	0.11
962	0.15
963	0.14
964	0.15
965	0.15
966	0.16
967	0.15
968	0.15
969	0.16
970	0.11
971	0.09
972	0.08
973	0.1
974	0.1
975	0.12
976	0.14
977	0.15
978	0.17
979	0.2
980	0.2
981	0.25
982	0.27
983	0.26
984	0.25
985	0.29
986	0.36
987	0.4
988	0.44
989	0.42
990	0.42
991	0.45
992	0.45
993	0.41
994	0.32
995	0.28
996	0.23
997	0.2
998	0.18
999	0.15
1000	0.14
1001	0.11
1002	0.11
1003	0.1
1004	0.1
1005	0.09
1006	0.09
1007	0.1
1008	0.12
1009	0.13
1010	0.15
1011	0.15
1012	0.14
1013	0.17
1014	0.18
1015	0.19
1016	0.23
1017	0.24
1018	0.28
1019	0.33
1020	0.35
1021	0.36
1022	0.35
1023	0.35
1024	0.33
1025	0.4
1026	0.44
1027	0.49
1028	0.57
1029	0.63
1030	0.72
1031	0.79
1032	0.83
1033	0.83
1034	0.81
1035	0.79
1036	0.8
1037	0.8
1038	0.75
1039	0.7
1040	0.65
1041	0.6
1042	0.56
1043	0.48
1044	0.39
1045	0.3
1046	0.25
1047	0.23
1048	0.23
1049	0.18
1050	0.14
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.13
1054	0.14
1055	0.13
1056	0.11
1057	0.11
1058	0.17
1059	0.25
1060	0.26
1061	0.27
1062	0.31
1063	0.41
1064	0.47
1065	0.53
1066	0.55
1067	0.58
1068	0.62
1069	0.7
1070	0.74
1071	0.7
1072	0.68
1073	0.65
1074	0.58
1075	0.49
1076	0.42
1077	0.35
1078	0.26
1079	0.19
1080	0.17
1081	0.13
1082	0.12
1083	0.13
1084	0.14
1085	0.12
1086	0.12
1087	0.13
1088	0.15
1089	0.2
1090	0.22
1091	0.22
1092	0.22
1093	0.25
1094	0.26
1095	0.31
1096	0.34
1097	0.29
1098	0.29
1099	0.29
1100	0.31
1101	0.3
1102	0.29
1103	0.26
1104	0.19
1105	0.21
1106	0.2
1107	0.21
1108	0.17
1109	0.15
1110	0.15
1111	0.13
1112	0.13
1113	0.11
1114	0.1
1115	0.08
1116	0.08
1117	0.08
1118	0.08
1119	0.09
1120	0.08
1121	0.08
1122	0.1
1123	0.1
1124	0.1
1125	0.1
1126	0.13
1127	0.13
1128	0.13
1129	0.15
1130	0.13
1131	0.14
1132	0.18
1133	0.19
1134	0.16
1135	0.17
1136	0.17
1137	0.17
1138	0.18
1139	0.22
1140	0.22
1141	0.22
1142	0.23
1143	0.23
1144	0.24
1145	0.25
1146	0.23
1147	0.21
1148	0.19
1149	0.21
1150	0.22
1151	0.28
1152	0.27
1153	0.27
1154	0.26
1155	0.23
1156	0.21
1157	0.21
1158	0.2
1159	0.14
1160	0.14
1161	0.12
1162	0.13
1163	0.13
1164	0.15
1165	0.14
1166	0.17
1167	0.24
1168	0.25
1169	0.29
1170	0.34
1171	0.38
1172	0.39
1173	0.44
1174	0.43
1175	0.43
1176	0.52
1177	0.56
1178	0.54
1179	0.54
1180	0.52
1181	0.5
1182	0.52
1183	0.46
1184	0.4
1185	0.39
1186	0.38
1187	0.42
1188	0.49
1189	0.54
1190	0.57
1191	0.65
1192	0.71
1193	0.74
1194	0.8
1195	0.82
1196	0.82
1197	0.82
1198	0.8
1199	0.79
1200	0.79
1201	0.69
1202	0.61
1203	0.54
1204	0.49
1205	0.41
1206	0.35
1207	0.27
1208	0.21
1209	0.2
1210	0.21
1211	0.19
1212	0.17
1213	0.16
1214	0.14
1215	0.14
1216	0.1
1217	0.1
1218	0.06
1219	0.06
1220	0.05
1221	0.06
1222	0.07
1223	0.06
1224	0.07
1225	0.07
1226	0.07
1227	0.07
1228	0.07
1229	0.06
1230	0.06
1231	0.06
1232	0.05
1233	0.05
1234	0.06
1235	0.07
1236	0.07
1237	0.07
1238	0.09
1239	0.14
1240	0.16
1241	0.19
1242	0.22
1243	0.24
1244	0.29
1245	0.33
1246	0.38
1247	0.41
1248	0.47
1249	0.48
1250	0.45
1251	0.47
1252	0.42
1253	0.42
1254	0.35
1255	0.28
1256	0.22
1257	0.19
1258	0.2
1259	0.17
1260	0.19
1261	0.15
1262	0.19
1263	0.2
1264	0.25
1265	0.32
1266	0.31
1267	0.33
1268	0.31
1269	0.32
1270	0.3

A0A1X2GJA0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer