Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1X2GRM6

Protein Details
Accession A0A1X2GRM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-30HFYVPRKRKYCSLKTRPGNQYCGEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, cyto 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007871  Methyltransferase_TRM13  
IPR039044  Trm13  
IPR022776  TRM13/UPF0224_CHHC_Znf_dom  
IPR021721  Znf_CCCH-type_TRM13  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0106050  F:tRNA 2'-O-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF05206  TRM13  
PF11722  zf-TRM13_CCCH  
PF05253  zf-U11-48K  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51800  ZF_CHHC_U11_48K  
Amino Acid Sequences MFFSSGHFYVPRKRKYCSLKTRPGNQYCGEHLPDDQRDGNENTRRVPCPFDPNHTVAIKDLVSHKARCNSRPLPPPVYHSLNLNVTLPLSPEELAFQQNIFSHKELKSQPWIARVQLDQLPDGELQALLQKIQHTASSLLPSIPTQILSHPSLVSDATSLKTCRHLDQQSSLIGHMKENGMLDHKDTCYAEFGAGKGRELAHHVKNALTEENGRPTFVLVDRKSVRNKFDKVLLGTSGADSEVQRVLIDIKDLDFSKIPSIKDQHDHTKKIVCISKHLCGSATDITLKCLMNYVQQEKNAGQPSSIQGIVIALCCHQLCRYEMYPNTAYLDQLGLDKQDFDRLCKVSSWAVCGKRSTDDGHPQAKEDAVDAQANHYSGCTHQQREQLGYQCKRLLDMGRVNYLKQHGFDARLVYYADATDTLENCALIAIPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.68
3 0.76
4 0.77
5 0.78
6 0.78
7 0.84
8 0.9
9 0.91
10 0.88
11 0.83
12 0.76
13 0.7
14 0.65
15 0.62
16 0.54
17 0.44
18 0.4
19 0.41
20 0.39
21 0.39
22 0.36
23 0.32
24 0.34
25 0.38
26 0.43
27 0.43
28 0.43
29 0.45
30 0.48
31 0.49
32 0.47
33 0.49
34 0.45
35 0.48
36 0.5
37 0.52
38 0.51
39 0.51
40 0.55
41 0.49
42 0.45
43 0.35
44 0.35
45 0.26
46 0.22
47 0.23
48 0.24
49 0.28
50 0.31
51 0.36
52 0.41
53 0.46
54 0.47
55 0.53
56 0.52
57 0.56
58 0.63
59 0.64
60 0.63
61 0.6
62 0.63
63 0.6
64 0.61
65 0.52
66 0.45
67 0.43
68 0.38
69 0.37
70 0.31
71 0.25
72 0.19
73 0.19
74 0.17
75 0.13
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.12
85 0.14
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.22
90 0.22
91 0.3
92 0.31
93 0.34
94 0.39
95 0.42
96 0.44
97 0.44
98 0.46
99 0.4
100 0.4
101 0.36
102 0.33
103 0.29
104 0.27
105 0.22
106 0.2
107 0.2
108 0.17
109 0.16
110 0.12
111 0.08
112 0.07
113 0.09
114 0.09
115 0.07
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.14
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.11
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.11
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.17
149 0.19
150 0.2
151 0.27
152 0.3
153 0.31
154 0.35
155 0.36
156 0.33
157 0.32
158 0.3
159 0.25
160 0.22
161 0.19
162 0.16
163 0.14
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.1
180 0.15
181 0.15
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.13
186 0.17
187 0.23
188 0.18
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.21
193 0.22
194 0.18
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.18
199 0.18
200 0.17
201 0.15
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.22
206 0.16
207 0.23
208 0.25
209 0.3
210 0.36
211 0.38
212 0.41
213 0.4
214 0.42
215 0.37
216 0.4
217 0.4
218 0.35
219 0.33
220 0.29
221 0.23
222 0.2
223 0.18
224 0.13
225 0.09
226 0.08
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.06
237 0.06
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.15
244 0.18
245 0.18
246 0.2
247 0.24
248 0.25
249 0.3
250 0.34
251 0.39
252 0.43
253 0.45
254 0.43
255 0.46
256 0.43
257 0.45
258 0.45
259 0.35
260 0.37
261 0.38
262 0.42
263 0.37
264 0.37
265 0.31
266 0.27
267 0.3
268 0.24
269 0.21
270 0.19
271 0.17
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.16
279 0.21
280 0.25
281 0.26
282 0.27
283 0.29
284 0.28
285 0.34
286 0.34
287 0.29
288 0.24
289 0.22
290 0.24
291 0.24
292 0.24
293 0.17
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.11
298 0.09
299 0.06
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.11
305 0.12
306 0.18
307 0.2
308 0.26
309 0.28
310 0.34
311 0.34
312 0.32
313 0.34
314 0.28
315 0.26
316 0.19
317 0.18
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.09
322 0.09
323 0.11
324 0.1
325 0.17
326 0.17
327 0.19
328 0.26
329 0.26
330 0.27
331 0.27
332 0.29
333 0.28
334 0.29
335 0.31
336 0.32
337 0.35
338 0.36
339 0.37
340 0.37
341 0.34
342 0.35
343 0.34
344 0.34
345 0.39
346 0.43
347 0.49
348 0.47
349 0.46
350 0.45
351 0.42
352 0.35
353 0.26
354 0.21
355 0.16
356 0.18
357 0.16
358 0.17
359 0.18
360 0.18
361 0.17
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.21
366 0.25
367 0.27
368 0.32
369 0.38
370 0.42
371 0.46
372 0.51
373 0.51
374 0.54
375 0.55
376 0.55
377 0.53
378 0.5
379 0.46
380 0.45
381 0.4
382 0.38
383 0.42
384 0.41
385 0.46
386 0.47
387 0.46
388 0.47
389 0.47
390 0.42
391 0.34
392 0.36
393 0.3
394 0.33
395 0.35
396 0.35
397 0.3
398 0.29
399 0.29
400 0.23
401 0.2
402 0.16
403 0.15
404 0.11
405 0.12
406 0.14
407 0.14
408 0.16
409 0.16
410 0.15
411 0.14
412 0.14