Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4A180

Protein Details
Accession A0A2T4A180    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-172DEKPSFRAKSPPKGNKNLKRKAPPSHydrophilic
283-308SDSDDDKKKKTTKKTKPVNGVVKKEQHydrophilic
375-402LIVTKGKGFTKEKNKKKRGNFRAGVIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-169RAKSPPKGNKNLKRKA
290-296KKKTTKK
381-393KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSSASAKPPAWLFSNNTNNNPTDKVLTSTSSATTSTNDEMVKSKPSASNGVESQSQPPAQLLDLVEQFLSDNAFTSALSAFKKQRSKKGWGEASEASSGDTLVGVFQSWENAAKAPADRDVDMEDSSSSSSSSDSSSSSESSDSESEDEKPSFRAKSPPKGNKNLKRKAPPSSSSSSSSSSDSSSSDSSSDSSSEDEKPSPKKQKVAAPSAKKQKVASPASSESESDSDSSDSSSESSSSDESSSSDESSDSESEVDAAEAAKVPLPESDSDSSSSSSSDSDSDSDDDKKKKTTKKTKPVNGVVKKEQSTDESSPSDSSVTIDSLPNPPLPPNPRDKKVKVEPFSRIPKDIKVDPKFASNEYVPLSYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGNFRAGVIDIDEKKSIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.5
3 0.53
4 0.54
5 0.52
6 0.51
7 0.48
8 0.4
9 0.34
10 0.3
11 0.3
12 0.28
13 0.28
14 0.28
15 0.27
16 0.26
17 0.22
18 0.22
19 0.19
20 0.18
21 0.2
22 0.19
23 0.21
24 0.2
25 0.19
26 0.21
27 0.23
28 0.26
29 0.23
30 0.26
31 0.26
32 0.29
33 0.34
34 0.34
35 0.38
36 0.35
37 0.37
38 0.36
39 0.34
40 0.34
41 0.32
42 0.3
43 0.24
44 0.23
45 0.21
46 0.17
47 0.19
48 0.17
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.11
56 0.11
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.16
67 0.21
68 0.28
69 0.38
70 0.43
71 0.52
72 0.56
73 0.64
74 0.68
75 0.73
76 0.73
77 0.68
78 0.67
79 0.6
80 0.56
81 0.48
82 0.39
83 0.29
84 0.21
85 0.18
86 0.12
87 0.09
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.11
101 0.12
102 0.13
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.16
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.08
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.17
135 0.17
136 0.15
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.19
141 0.27
142 0.3
143 0.4
144 0.5
145 0.58
146 0.63
147 0.72
148 0.81
149 0.81
150 0.85
151 0.84
152 0.82
153 0.81
154 0.77
155 0.76
156 0.73
157 0.66
158 0.62
159 0.58
160 0.53
161 0.47
162 0.46
163 0.39
164 0.33
165 0.31
166 0.25
167 0.21
168 0.19
169 0.15
170 0.15
171 0.13
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.1
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.17
185 0.22
186 0.3
187 0.38
188 0.38
189 0.42
190 0.45
191 0.5
192 0.53
193 0.58
194 0.58
195 0.56
196 0.61
197 0.67
198 0.65
199 0.6
200 0.54
201 0.48
202 0.49
203 0.46
204 0.4
205 0.36
206 0.35
207 0.35
208 0.35
209 0.3
210 0.22
211 0.19
212 0.17
213 0.12
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.12
237 0.11
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.09
255 0.14
256 0.15
257 0.15
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.17
262 0.16
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.11
270 0.12
271 0.13
272 0.18
273 0.23
274 0.26
275 0.27
276 0.34
277 0.4
278 0.47
279 0.56
280 0.62
281 0.68
282 0.75
283 0.84
284 0.86
285 0.88
286 0.9
287 0.89
288 0.87
289 0.83
290 0.79
291 0.76
292 0.68
293 0.6
294 0.52
295 0.44
296 0.43
297 0.38
298 0.35
299 0.29
300 0.29
301 0.28
302 0.26
303 0.23
304 0.16
305 0.15
306 0.12
307 0.11
308 0.11
309 0.12
310 0.13
311 0.16
312 0.17
313 0.18
314 0.17
315 0.18
316 0.24
317 0.29
318 0.32
319 0.4
320 0.46
321 0.52
322 0.61
323 0.63
324 0.65
325 0.7
326 0.76
327 0.72
328 0.71
329 0.7
330 0.7
331 0.77
332 0.71
333 0.65
334 0.58
335 0.56
336 0.56
337 0.56
338 0.57
339 0.53
340 0.54
341 0.5
342 0.54
343 0.51
344 0.46
345 0.45
346 0.35
347 0.33
348 0.3
349 0.3
350 0.24
351 0.24
352 0.26
353 0.25
354 0.26
355 0.25
356 0.27
357 0.28
358 0.29
359 0.29
360 0.28
361 0.27
362 0.31
363 0.32
364 0.28
365 0.27
366 0.3
367 0.3
368 0.35
369 0.37
370 0.4
371 0.48
372 0.59
373 0.67
374 0.74
375 0.82
376 0.85
377 0.91
378 0.92
379 0.92
380 0.92
381 0.87
382 0.83
383 0.82
384 0.74
385 0.65
386 0.56
387 0.53
388 0.45
389 0.42
390 0.36
391 0.27
392 0.26