FuNGI

G3AGU6

Protein Details

Accession

G3AGU6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-33	VDNFVKPVRLHRKDPRNIQFHL	Hydrophilic
86-112	APDGGARKQKKNLFKRKTRQINLMDDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
92-102	RKQKKNLFKRK
329-337	DKEGKKLRK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	spaa:SPAPADRAFT_58648 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MKFISKQDVDIVDNFVKPVRLHRKDPRNIQFHLTRRELDIRKRENEELKREKQEQQDGEVPAENNGEVAPDKPMVTPGGANLAQVAPDGGARKQKKNLFKRKTRQINLMDDAKRKLRYEEHYPWVIEDYDGKNVFVGNYEAGSSESQHVLFVFDKDGFKMVPAEKVYRFTPRNKYATLTLEEAEAKMERNATVPRWLMKHMEDRSTSDTIPDQRFRNSSAANGGSTFNRAIQPGPSSSRPRLRTVIGGSASRESNDRDSDHDDLDYDEEFADDEEAPIMDGDEEENKLSERKIKKEMLKAAHFDGKSDVEGDLDDLDDLFETEKTRKVDKEGKKLRKVLNKREGGVYDDDDDDEEGLLPYLSKSDLESNDESDDEDEVVVKKEDEVKLENNQTAQHYHRTIYVHHIDSGYVTIKAPASFLSTLPKGEWNPQVRRRPTPDITSPKKKIKLEEKSESPLTDIAASPTKSPSPIDTATTTTTTTTTTTTIDLNSSGPDNVLVTVNDVLDIVRNNPLTTKELLVGLKSRVSAHKDNKQRIITIVKQNLKLVDGKLVLKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.24
3	0.24
4	0.22
5	0.31
6	0.36
7	0.4
8	0.49
9	0.59
10	0.68
11	0.75
12	0.85
13	0.85
14	0.8
15	0.76
16	0.75
17	0.73
18	0.71
19	0.7
20	0.63
21	0.55
22	0.54
23	0.61
24	0.6
25	0.61
26	0.63
27	0.63
28	0.65
29	0.69
30	0.71
31	0.71
32	0.73
33	0.74
34	0.73
35	0.74
36	0.75
37	0.74
38	0.74
39	0.73
40	0.73
41	0.66
42	0.62
43	0.61
44	0.54
45	0.51
46	0.48
47	0.39
48	0.31
49	0.29
50	0.22
51	0.15
52	0.13
53	0.12
54	0.09
55	0.09
56	0.11
57	0.11
58	0.12
59	0.12
60	0.14
61	0.14
62	0.15
63	0.14
64	0.12
65	0.18
66	0.17
67	0.17
68	0.16
69	0.15
70	0.14
71	0.13
72	0.13
73	0.06
74	0.08
75	0.1
76	0.11
77	0.21
78	0.26
79	0.32
80	0.4
81	0.47
82	0.56
83	0.65
84	0.74
85	0.75
86	0.81
87	0.86
88	0.89
89	0.92
90	0.88
91	0.87
92	0.83
93	0.81
94	0.76
95	0.74
96	0.68
97	0.61
98	0.59
99	0.55
100	0.51
101	0.44
102	0.43
103	0.41
104	0.42
105	0.48
106	0.52
107	0.53
108	0.53
109	0.52
110	0.48
111	0.43
112	0.37
113	0.28
114	0.24
115	0.2
116	0.22
117	0.23
118	0.22
119	0.2
120	0.2
121	0.19
122	0.16
123	0.15
124	0.08
125	0.08
126	0.08
127	0.09
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.11
132	0.11
133	0.11
134	0.11
135	0.11
136	0.12
137	0.12
138	0.11
139	0.11
140	0.12
141	0.13
142	0.13
143	0.14
144	0.12
145	0.12
146	0.16
147	0.15
148	0.18
149	0.2
150	0.24
151	0.24
152	0.27
153	0.28
154	0.32
155	0.35
156	0.37
157	0.45
158	0.49
159	0.52
160	0.5
161	0.51
162	0.47
163	0.48
164	0.43
165	0.35
166	0.27
167	0.24
168	0.23
169	0.21
170	0.17
171	0.13
172	0.11
173	0.09
174	0.1
175	0.09
176	0.11
177	0.13
178	0.13
179	0.18
180	0.19
181	0.21
182	0.22
183	0.24
184	0.24
185	0.25
186	0.33
187	0.3
188	0.34
189	0.32
190	0.34
191	0.37
192	0.36
193	0.33
194	0.25
195	0.25
196	0.26
197	0.3
198	0.31
199	0.28
200	0.29
201	0.3
202	0.32
203	0.33
204	0.27
205	0.24
206	0.24
207	0.24
208	0.21
209	0.21
210	0.19
211	0.14
212	0.15
213	0.14
214	0.11
215	0.11
216	0.11
217	0.11
218	0.11
219	0.13
220	0.14
221	0.17
222	0.21
223	0.25
224	0.29
225	0.37
226	0.38
227	0.4
228	0.4
229	0.38
230	0.37
231	0.35
232	0.35
233	0.29
234	0.27
235	0.24
236	0.23
237	0.22
238	0.18
239	0.17
240	0.13
241	0.14
242	0.15
243	0.15
244	0.16
245	0.19
246	0.21
247	0.2
248	0.18
249	0.16
250	0.14
251	0.14
252	0.11
253	0.08
254	0.06
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.04
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.14
277	0.17
278	0.21
279	0.28
280	0.35
281	0.4
282	0.47
283	0.54
284	0.53
285	0.53
286	0.5
287	0.47
288	0.46
289	0.4
290	0.33
291	0.28
292	0.22
293	0.18
294	0.17
295	0.14
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.04
304	0.03
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.06
309	0.07
310	0.12
311	0.14
312	0.17
313	0.18
314	0.23
315	0.33
316	0.4
317	0.5
318	0.56
319	0.64
320	0.68
321	0.75
322	0.76
323	0.76
324	0.77
325	0.77
326	0.76
327	0.71
328	0.66
329	0.62
330	0.56
331	0.49
332	0.42
333	0.32
334	0.24
335	0.19
336	0.18
337	0.14
338	0.13
339	0.1
340	0.08
341	0.07
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.11
352	0.12
353	0.17
354	0.18
355	0.19
356	0.2
357	0.2
358	0.19
359	0.15
360	0.14
361	0.09
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.08
369	0.14
370	0.15
371	0.17
372	0.2
373	0.22
374	0.28
375	0.31
376	0.31
377	0.26
378	0.27
379	0.26
380	0.26
381	0.26
382	0.26
383	0.24
384	0.24
385	0.27
386	0.27
387	0.26
388	0.31
389	0.34
390	0.29
391	0.29
392	0.29
393	0.25
394	0.24
395	0.24
396	0.18
397	0.12
398	0.11
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.12
403	0.1
404	0.13
405	0.13
406	0.14
407	0.18
408	0.18
409	0.18
410	0.19
411	0.23
412	0.2
413	0.26
414	0.33
415	0.36
416	0.44
417	0.53
418	0.62
419	0.63
420	0.69
421	0.71
422	0.72
423	0.69
424	0.67
425	0.68
426	0.69
427	0.73
428	0.75
429	0.75
430	0.75
431	0.77
432	0.73
433	0.73
434	0.73
435	0.74
436	0.73
437	0.74
438	0.71
439	0.7
440	0.69
441	0.6
442	0.51
443	0.41
444	0.32
445	0.25
446	0.2
447	0.16
448	0.2
449	0.2
450	0.19
451	0.21
452	0.22
453	0.21
454	0.22
455	0.22
456	0.23
457	0.24
458	0.26
459	0.26
460	0.27
461	0.29
462	0.29
463	0.27
464	0.21
465	0.2
466	0.17
467	0.16
468	0.15
469	0.13
470	0.13
471	0.14
472	0.14
473	0.14
474	0.14
475	0.14
476	0.13
477	0.13
478	0.14
479	0.13
480	0.12
481	0.11
482	0.11
483	0.11
484	0.12
485	0.1
486	0.11
487	0.12
488	0.12
489	0.12
490	0.11
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.11
495	0.15
496	0.16
497	0.16
498	0.19
499	0.22
500	0.23
501	0.24
502	0.25
503	0.21
504	0.24
505	0.25
506	0.26
507	0.26
508	0.25
509	0.25
510	0.24
511	0.26
512	0.28
513	0.34
514	0.41
515	0.47
516	0.54
517	0.62
518	0.7
519	0.75
520	0.73
521	0.68
522	0.64
523	0.63
524	0.62
525	0.63
526	0.64
527	0.62
528	0.61
529	0.62
530	0.58
531	0.52
532	0.47
533	0.38
534	0.36
535	0.32

G3AGU6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer