Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4AP88

Protein Details
Accession A0A2T4AP88    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-97PSSARSRFPGQGRKRKRPGEDDTBasic
248-273EELRQLRKEEHRDRHSHRHRGREGREBasic
278-338SDSRRRDSSRGRHKDDSERRERHDDHRERRRHKEEERRRRHGDSRSRSPDRRRHRHRRDERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-91FPGQGRKRKR
251-338RQLRKEEHRDRHSHRHRGREGREGRNNSDSRRRDSSRGRHKDDSERRERHDDHRERRRHKEEERRRRHGDSRSRSPDRRRHRHRRDER
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNADNIARVRRDEAAAKATEEEEERRMQEVDAQRRLAILRGESPPPIEDERDAEPEKTDGAPSSARSRFPGQGRKRKRPGEDDTEFELRLAQERSNATYSVVESSRKPASSAPIVDSAGHIDLFGDERARAHAERNEEAEAEKKKKEKEYEDQYTMRFSNAAGKDGISKPWYSQREGVAPDASSKDVWGNNNPDRKTRDTQRINSNDPLAMMKKGASQIRDLKKERMRIQAERDEELRQLRKEEHRDRHSHRHRGREGREGRNNSDSRRRDSSRGRHKDDSERRERHDDHRERRRHKEEERRRRHGDSRSRSPDRRRHRHRRDER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.43
3 0.41
4 0.41
5 0.38
6 0.4
7 0.39
8 0.38
9 0.32
10 0.3
11 0.31
12 0.31
13 0.33
14 0.33
15 0.32
16 0.31
17 0.3
18 0.27
19 0.26
20 0.24
21 0.23
22 0.2
23 0.22
24 0.22
25 0.23
26 0.23
27 0.21
28 0.26
29 0.32
30 0.38
31 0.41
32 0.41
33 0.38
34 0.39
35 0.39
36 0.35
37 0.29
38 0.22
39 0.22
40 0.24
41 0.26
42 0.26
43 0.27
44 0.24
45 0.25
46 0.25
47 0.21
48 0.19
49 0.2
50 0.23
51 0.28
52 0.29
53 0.25
54 0.24
55 0.23
56 0.23
57 0.2
58 0.18
59 0.12
60 0.13
61 0.14
62 0.16
63 0.23
64 0.25
65 0.25
66 0.28
67 0.32
68 0.36
69 0.42
70 0.5
71 0.52
72 0.6
73 0.69
74 0.76
75 0.82
76 0.83
77 0.82
78 0.81
79 0.79
80 0.77
81 0.71
82 0.65
83 0.61
84 0.55
85 0.48
86 0.39
87 0.32
88 0.22
89 0.22
90 0.19
91 0.14
92 0.15
93 0.17
94 0.2
95 0.2
96 0.21
97 0.18
98 0.17
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.15
103 0.14
104 0.18
105 0.2
106 0.19
107 0.2
108 0.18
109 0.21
110 0.24
111 0.25
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.22
116 0.21
117 0.17
118 0.13
119 0.11
120 0.09
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.07
129 0.1
130 0.1
131 0.12
132 0.15
133 0.18
134 0.2
135 0.22
136 0.21
137 0.19
138 0.19
139 0.21
140 0.23
141 0.22
142 0.24
143 0.25
144 0.28
145 0.34
146 0.39
147 0.4
148 0.45
149 0.51
150 0.55
151 0.57
152 0.55
153 0.5
154 0.47
155 0.4
156 0.31
157 0.21
158 0.14
159 0.17
160 0.16
161 0.17
162 0.15
163 0.15
164 0.19
165 0.19
166 0.21
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.21
171 0.24
172 0.22
173 0.25
174 0.25
175 0.28
176 0.29
177 0.3
178 0.23
179 0.2
180 0.19
181 0.17
182 0.16
183 0.12
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.14
188 0.17
189 0.23
190 0.28
191 0.35
192 0.36
193 0.39
194 0.41
195 0.45
196 0.47
197 0.48
198 0.53
199 0.54
200 0.6
201 0.65
202 0.67
203 0.66
204 0.62
205 0.56
206 0.46
207 0.38
208 0.34
209 0.25
210 0.19
211 0.15
212 0.12
213 0.13
214 0.17
215 0.19
216 0.18
217 0.22
218 0.3
219 0.38
220 0.46
221 0.47
222 0.51
223 0.55
224 0.62
225 0.63
226 0.63
227 0.62
228 0.59
229 0.63
230 0.62
231 0.59
232 0.53
233 0.49
234 0.41
235 0.38
236 0.38
237 0.36
238 0.3
239 0.3
240 0.33
241 0.4
242 0.48
243 0.56
244 0.6
245 0.62
246 0.7
247 0.76
248 0.81
249 0.83
250 0.83
251 0.8
252 0.8
253 0.81
254 0.82
255 0.79
256 0.78
257 0.77
258 0.77
259 0.8
260 0.75
261 0.71
262 0.7
263 0.68
264 0.63
265 0.65
266 0.59
267 0.56
268 0.59
269 0.59
270 0.58
271 0.65
272 0.7
273 0.71
274 0.77
275 0.78
276 0.77
277 0.78
278 0.81
279 0.81
280 0.81
281 0.8
282 0.77
283 0.75
284 0.77
285 0.75
286 0.73
287 0.74
288 0.74
289 0.74
290 0.77
291 0.81
292 0.8
293 0.87
294 0.87
295 0.85
296 0.85
297 0.86
298 0.87
299 0.88
300 0.91
301 0.89
302 0.87
303 0.86
304 0.84
305 0.83
306 0.83
307 0.81
308 0.82
309 0.83
310 0.85
311 0.85
312 0.87
313 0.87
314 0.87
315 0.89
316 0.89
317 0.9
318 0.91