Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4A2M6

Protein Details
Accession A0A2T4A2M6    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-69DPEPRSEADGPRRRKKRNRWGDASENKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-60KRGRDPEPRSEADGPRRRKKRNR
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
Amino Acid Sequences MSWRSQGITGSNNIPLGKSRRFGGEEEEDGFVEERDLKRGRDPEPRSEADGPRRRKKRNRWGDASENKAAGLMGLPTAILSSMTSEQLEAYTLHLRIEEISQKLRIDDVVPADGDRSPSPPPQYDNHGRRINTREYRYRKRLEDERHKLVEKAMKTIPNYHPPQDYRRPTKTQEKVYVPVNDYPEINFSMIANPLTLTTNSPFLSFNLDYDQTLATMPICGVVRGSGFFRRLIVPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.3
4 0.31
5 0.31
6 0.3
7 0.34
8 0.36
9 0.37
10 0.38
11 0.38
12 0.36
13 0.36
14 0.35
15 0.29
16 0.27
17 0.26
18 0.19
19 0.13
20 0.15
21 0.14
22 0.19
23 0.21
24 0.22
25 0.28
26 0.34
27 0.38
28 0.44
29 0.48
30 0.51
31 0.57
32 0.58
33 0.57
34 0.58
35 0.59
36 0.59
37 0.63
38 0.63
39 0.65
40 0.72
41 0.76
42 0.8
43 0.85
44 0.85
45 0.88
46 0.89
47 0.87
48 0.86
49 0.87
50 0.84
51 0.8
52 0.71
53 0.6
54 0.49
55 0.41
56 0.32
57 0.22
58 0.14
59 0.07
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.03
67 0.03
68 0.05
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.12
85 0.13
86 0.13
87 0.14
88 0.16
89 0.16
90 0.16
91 0.15
92 0.14
93 0.11
94 0.11
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.13
106 0.15
107 0.16
108 0.18
109 0.19
110 0.26
111 0.33
112 0.35
113 0.42
114 0.45
115 0.44
116 0.46
117 0.49
118 0.51
119 0.48
120 0.5
121 0.51
122 0.55
123 0.64
124 0.67
125 0.68
126 0.63
127 0.63
128 0.66
129 0.67
130 0.69
131 0.68
132 0.67
133 0.66
134 0.63
135 0.56
136 0.51
137 0.47
138 0.36
139 0.33
140 0.29
141 0.28
142 0.29
143 0.36
144 0.37
145 0.41
146 0.43
147 0.42
148 0.44
149 0.43
150 0.5
151 0.52
152 0.56
153 0.55
154 0.59
155 0.61
156 0.62
157 0.69
158 0.7
159 0.69
160 0.68
161 0.65
162 0.62
163 0.62
164 0.62
165 0.54
166 0.5
167 0.44
168 0.37
169 0.32
170 0.29
171 0.25
172 0.21
173 0.19
174 0.14
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.11
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.17
187 0.17
188 0.18
189 0.18
190 0.16
191 0.23
192 0.21
193 0.21
194 0.22
195 0.22
196 0.21
197 0.22
198 0.22
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.17
213 0.19
214 0.2
215 0.21
216 0.22