Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4H1G8

Protein Details
Accession A0A2T4H1G8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
390-420KNETKRSGSPTRKQNKGEKRRRSESPNGAGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-269KKSRKSKE
378-446PRGPAGPSEKSQKNETKRSGSPTRKQNKGEKRRRSESPNGAGSPRRKAAALESKQDSKPVKEPVKEPVK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 11.833, mito 10, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02867  PseudoU_synth_TruB_4  
Amino Acid Sequences MATGIIREGVFAINKPCGQSSAQVIRECQQVFNPSEFFKPLIQSEVAKRMNENSGESARRKALKRASQVKIGHGGTLDPLATGVLILGIGCATKALPQFLECTKTYETTIVFGAATDSYDRVGRILTKRPYEHITRELVEKEIASFKGRQIQIPPLFSALKMNGKPSTSMRIEGREVDVKEIEMVEWYEPGEHNHRWPTEEAEAAERNLAEQVWRVKKQQESNKPLSPEEKQQDDKAIAAHETFKRNFEERQDALIKDAPSKKSRKSKEPRMMSGALGKLPQPTYSTKGQNLVPDAPDSSTPPPWNDQGPPACKVRLTVTSGFYVRSFCHDLGAKLDSAGLMAELSRTRQNHFEVGSENCLEYGDLAKEVERGLGAGPRGPAGPSEKSQKNETKRSGSPTRKQNKGEKRRRSESPNGAGSPRRKAAALESKQDSKPVKEPVKEPVKEAKEKATPDAGNRSDDEKSWNGIED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.24
4 0.24
5 0.25
6 0.26
7 0.31
8 0.36
9 0.41
10 0.41
11 0.42
12 0.43
13 0.49
14 0.46
15 0.38
16 0.34
17 0.34
18 0.35
19 0.37
20 0.36
21 0.31
22 0.33
23 0.33
24 0.31
25 0.27
26 0.27
27 0.24
28 0.26
29 0.26
30 0.27
31 0.31
32 0.38
33 0.39
34 0.37
35 0.36
36 0.36
37 0.4
38 0.38
39 0.36
40 0.32
41 0.34
42 0.39
43 0.4
44 0.41
45 0.41
46 0.46
47 0.46
48 0.49
49 0.53
50 0.56
51 0.64
52 0.7
53 0.69
54 0.71
55 0.7
56 0.66
57 0.64
58 0.55
59 0.46
60 0.36
61 0.31
62 0.23
63 0.22
64 0.17
65 0.09
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.05
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.07
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.16
86 0.18
87 0.23
88 0.2
89 0.23
90 0.24
91 0.24
92 0.25
93 0.24
94 0.22
95 0.19
96 0.19
97 0.15
98 0.13
99 0.11
100 0.11
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.07
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.14
111 0.18
112 0.26
113 0.32
114 0.38
115 0.39
116 0.43
117 0.47
118 0.47
119 0.47
120 0.43
121 0.41
122 0.36
123 0.38
124 0.35
125 0.32
126 0.26
127 0.21
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.16
133 0.16
134 0.24
135 0.25
136 0.25
137 0.25
138 0.33
139 0.35
140 0.36
141 0.35
142 0.29
143 0.29
144 0.27
145 0.27
146 0.2
147 0.22
148 0.21
149 0.24
150 0.23
151 0.23
152 0.25
153 0.25
154 0.29
155 0.24
156 0.27
157 0.25
158 0.27
159 0.27
160 0.27
161 0.28
162 0.26
163 0.25
164 0.23
165 0.22
166 0.18
167 0.17
168 0.16
169 0.12
170 0.08
171 0.08
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.13
179 0.14
180 0.17
181 0.21
182 0.22
183 0.23
184 0.24
185 0.25
186 0.22
187 0.22
188 0.2
189 0.19
190 0.19
191 0.17
192 0.17
193 0.13
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.06
198 0.07
199 0.15
200 0.2
201 0.22
202 0.24
203 0.28
204 0.34
205 0.42
206 0.49
207 0.52
208 0.54
209 0.59
210 0.61
211 0.59
212 0.55
213 0.5
214 0.42
215 0.4
216 0.35
217 0.34
218 0.31
219 0.3
220 0.31
221 0.29
222 0.26
223 0.19
224 0.16
225 0.12
226 0.1
227 0.14
228 0.14
229 0.18
230 0.19
231 0.2
232 0.22
233 0.24
234 0.25
235 0.25
236 0.29
237 0.26
238 0.3
239 0.31
240 0.28
241 0.28
242 0.3
243 0.26
244 0.25
245 0.29
246 0.27
247 0.31
248 0.35
249 0.41
250 0.47
251 0.52
252 0.57
253 0.63
254 0.7
255 0.74
256 0.78
257 0.74
258 0.71
259 0.67
260 0.57
261 0.51
262 0.41
263 0.32
264 0.24
265 0.2
266 0.17
267 0.16
268 0.15
269 0.13
270 0.15
271 0.18
272 0.23
273 0.27
274 0.26
275 0.29
276 0.3
277 0.3
278 0.31
279 0.29
280 0.24
281 0.21
282 0.2
283 0.17
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.17
288 0.18
289 0.18
290 0.2
291 0.21
292 0.23
293 0.22
294 0.26
295 0.29
296 0.31
297 0.33
298 0.33
299 0.31
300 0.29
301 0.29
302 0.26
303 0.24
304 0.26
305 0.26
306 0.26
307 0.28
308 0.29
309 0.28
310 0.25
311 0.22
312 0.17
313 0.18
314 0.2
315 0.17
316 0.2
317 0.21
318 0.21
319 0.23
320 0.24
321 0.19
322 0.15
323 0.15
324 0.11
325 0.1
326 0.09
327 0.06
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.08
333 0.13
334 0.14
335 0.16
336 0.21
337 0.24
338 0.26
339 0.27
340 0.27
341 0.25
342 0.27
343 0.28
344 0.25
345 0.22
346 0.18
347 0.17
348 0.15
349 0.12
350 0.12
351 0.09
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.13
368 0.14
369 0.16
370 0.2
371 0.22
372 0.3
373 0.35
374 0.38
375 0.45
376 0.52
377 0.56
378 0.62
379 0.65
380 0.64
381 0.64
382 0.69
383 0.72
384 0.73
385 0.72
386 0.73
387 0.76
388 0.77
389 0.79
390 0.81
391 0.82
392 0.83
393 0.85
394 0.86
395 0.86
396 0.85
397 0.86
398 0.84
399 0.84
400 0.83
401 0.81
402 0.77
403 0.7
404 0.66
405 0.66
406 0.61
407 0.59
408 0.52
409 0.44
410 0.37
411 0.36
412 0.42
413 0.45
414 0.47
415 0.46
416 0.49
417 0.54
418 0.54
419 0.6
420 0.54
421 0.48
422 0.49
423 0.52
424 0.54
425 0.54
426 0.56
427 0.59
428 0.66
429 0.61
430 0.6
431 0.6
432 0.59
433 0.61
434 0.61
435 0.6
436 0.56
437 0.58
438 0.57
439 0.56
440 0.5
441 0.49
442 0.55
443 0.49
444 0.45
445 0.45
446 0.44
447 0.37
448 0.36
449 0.37
450 0.3
451 0.31