Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4GNV2

Protein Details
Accession A0A2T4GNV2    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-38VDEGDTLKPKPKRSKKHGGKARQHQNSGIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-31KPKPKRSKKHGGKAR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MATKREFEDVDEGDTLKPKPKRSKKHGGKARQHQNSGIDPTWGQKYVFADNEHATTIPAGEESDFEDDADAMAYLNSVRQQAAGIPHLLVAPKVQIGPQLPAELRGDDQDDGEGPIDRTIYSDGVGDSRGWYEDGAYMAMPDNADDEGNYKGEYSEDDDDDYDEEVAIHEAYFASVMDQYHHLRTILHASPPQNARSRLAKAQLKTEAPADNQTSVIATWSRLLRDTDPHPLQIAHMSKDTTLRILRIMLGGKFLRRGYTLPERTSRWIWALLARLPDRGELNYAEIGWIRDLGRRAVLLGRSLSEMAALREELAEGGLGAHEAVDRSSSDEDIMADLEDLEIEGAVSAEEDEEASTPPEAEQKAEQPPEAAEPTTTSPPKPDTEEGEIDEEEDVAMDTASDSDAEEGEVAAPEPEESLKAAKERLLAQINHRAASEDDEEATKEAAKQRLRANLRATLNMILTVAGEFYGQRDLLEFREPFVGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.28
4 0.32
5 0.37
6 0.48
7 0.57
8 0.67
9 0.73
10 0.83
11 0.86
12 0.92
13 0.93
14 0.93
15 0.93
16 0.93
17 0.94
18 0.92
19 0.84
20 0.78
21 0.73
22 0.68
23 0.64
24 0.54
25 0.46
26 0.37
27 0.37
28 0.36
29 0.33
30 0.26
31 0.22
32 0.25
33 0.28
34 0.32
35 0.31
36 0.31
37 0.31
38 0.32
39 0.29
40 0.26
41 0.21
42 0.16
43 0.15
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.07
48 0.08
49 0.1
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.08
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.09
67 0.1
68 0.13
69 0.17
70 0.18
71 0.17
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.14
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.13
83 0.15
84 0.18
85 0.18
86 0.21
87 0.2
88 0.22
89 0.23
90 0.2
91 0.19
92 0.17
93 0.18
94 0.14
95 0.14
96 0.12
97 0.12
98 0.12
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.1
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.08
128 0.06
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.1
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.12
171 0.13
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.21
176 0.21
177 0.27
178 0.29
179 0.32
180 0.31
181 0.31
182 0.32
183 0.33
184 0.36
185 0.34
186 0.39
187 0.4
188 0.36
189 0.4
190 0.41
191 0.37
192 0.34
193 0.33
194 0.27
195 0.23
196 0.26
197 0.22
198 0.18
199 0.17
200 0.16
201 0.13
202 0.11
203 0.11
204 0.07
205 0.06
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.13
212 0.16
213 0.19
214 0.25
215 0.25
216 0.25
217 0.24
218 0.23
219 0.22
220 0.23
221 0.23
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.17
228 0.14
229 0.13
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.1
237 0.12
238 0.13
239 0.12
240 0.15
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.13
245 0.16
246 0.26
247 0.3
248 0.3
249 0.34
250 0.35
251 0.38
252 0.39
253 0.34
254 0.26
255 0.23
256 0.2
257 0.19
258 0.19
259 0.18
260 0.21
261 0.2
262 0.2
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.15
267 0.15
268 0.11
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.08
276 0.09
277 0.07
278 0.1
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.11
283 0.12
284 0.14
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.1
293 0.1
294 0.08
295 0.09
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.05
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.03
329 0.03
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.14
350 0.18
351 0.25
352 0.27
353 0.27
354 0.23
355 0.24
356 0.25
357 0.25
358 0.21
359 0.14
360 0.15
361 0.18
362 0.24
363 0.25
364 0.22
365 0.23
366 0.26
367 0.29
368 0.32
369 0.32
370 0.3
371 0.35
372 0.37
373 0.36
374 0.36
375 0.33
376 0.28
377 0.25
378 0.19
379 0.12
380 0.1
381 0.08
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.1
406 0.12
407 0.14
408 0.16
409 0.17
410 0.2
411 0.22
412 0.28
413 0.33
414 0.34
415 0.38
416 0.46
417 0.46
418 0.43
419 0.41
420 0.36
421 0.29
422 0.32
423 0.28
424 0.2
425 0.19
426 0.19
427 0.2
428 0.19
429 0.19
430 0.15
431 0.16
432 0.21
433 0.27
434 0.3
435 0.35
436 0.4
437 0.5
438 0.54
439 0.58
440 0.57
441 0.58
442 0.58
443 0.55
444 0.52
445 0.45
446 0.39
447 0.33
448 0.27
449 0.19
450 0.16
451 0.12
452 0.1
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.12
461 0.14
462 0.16
463 0.24
464 0.23
465 0.21