Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4HB42

Protein Details
Accession A0A2T4HB42    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-72SGSTRARAQSQSQRRKKKKNRKKRNPGLTKKLEFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-65QRRKKKKNRKKRNPGL
Subcellular Location(s) plas 15, nucl 7.5, cyto_nucl 4.5, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038967  Dsc4-like  
IPR013715  DUF1746  
Gene Ontology GO:0044695  C:Dsc E3 ubiquitin ligase complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF08508  DUF1746  
Amino Acid Sequences MSDDASPSSTAPNDASPAEPANTSSGSRVTWNLPREQSGSTRARAQSQSQRRKKKKNRKKRNPGLTKKLEFVTHLLKSLDTLVFAELSALYYMECSMFRFILRSVGQYLYLTPKDESFPFLMPASPIHVCLVLIPNIICILLHILVSLPVGPDFHQGYMHGGLVIDFIGQKPPTSRIYYVLADVVILAVQCLMLTVHTERERLRVVLKTFRPMVPDVAQETTPTIEDLDAEERGVSRDMPGSLPIDEEDGIELQSLHRVSTTEEGNSTSGESEPSSAREQSIDEPTRSNLSDVLSSGNGIIGEYHVLHSLHNAALNIERTAAYSLRTIGYGATMASIEARRRATLNVPARAAQNDRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.19
4 0.2
5 0.2
6 0.19
7 0.18
8 0.19
9 0.2
10 0.19
11 0.18
12 0.17
13 0.17
14 0.19
15 0.21
16 0.23
17 0.28
18 0.31
19 0.37
20 0.38
21 0.4
22 0.41
23 0.41
24 0.39
25 0.41
26 0.42
27 0.37
28 0.42
29 0.4
30 0.44
31 0.45
32 0.49
33 0.51
34 0.57
35 0.66
36 0.68
37 0.78
38 0.82
39 0.9
40 0.93
41 0.94
42 0.94
43 0.95
44 0.96
45 0.96
46 0.97
47 0.97
48 0.97
49 0.97
50 0.96
51 0.96
52 0.94
53 0.86
54 0.78
55 0.7
56 0.6
57 0.5
58 0.44
59 0.4
60 0.31
61 0.3
62 0.26
63 0.24
64 0.23
65 0.24
66 0.2
67 0.13
68 0.12
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.06
74 0.07
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.17
89 0.17
90 0.18
91 0.19
92 0.19
93 0.2
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.19
98 0.18
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.2
104 0.16
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.15
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.05
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.11
160 0.14
161 0.17
162 0.17
163 0.18
164 0.22
165 0.22
166 0.21
167 0.18
168 0.15
169 0.12
170 0.11
171 0.08
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.02
176 0.02
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.04
182 0.05
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.16
188 0.18
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.21
193 0.28
194 0.29
195 0.31
196 0.32
197 0.32
198 0.32
199 0.29
200 0.3
201 0.23
202 0.23
203 0.21
204 0.2
205 0.19
206 0.17
207 0.16
208 0.13
209 0.11
210 0.09
211 0.08
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.12
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.05
241 0.09
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.15
248 0.16
249 0.14
250 0.14
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.15
255 0.11
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.13
262 0.16
263 0.15
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.2
268 0.28
269 0.29
270 0.27
271 0.28
272 0.3
273 0.32
274 0.31
275 0.27
276 0.2
277 0.18
278 0.18
279 0.16
280 0.18
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.12
296 0.14
297 0.13
298 0.15
299 0.14
300 0.13
301 0.16
302 0.18
303 0.17
304 0.16
305 0.15
306 0.14
307 0.17
308 0.16
309 0.14
310 0.14
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.1
323 0.14
324 0.15
325 0.2
326 0.22
327 0.23
328 0.24
329 0.28
330 0.3
331 0.37
332 0.44
333 0.45
334 0.46
335 0.47
336 0.48
337 0.49