Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4GDC8

Protein Details
Accession A0A2T4GDC8    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-201EKEAEERRKKRRDEMERKRLKQEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-51GKEREAKEKEEGKARYEAK
183-198ERRKKRRDEMERKRLK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040107  Snu23  
IPR022755  Znf_C2H2_jaz  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12171  zf-C2H2_jaz  
Amino Acid Sequences MSDSKKEGAYGGAPSGDTDFRKTWDLEEYAAKGKEREAKEKEEGKARYEAKLAGKKYFKPLTGDETYTSARRHVIDFTQQIGKTQLVPGGAGVGKRGRGAGQYCEACDLTFKDNRQYIEHITTPQHLMNTGQTMNVKRATAEEVHERIEAYIRRQEDLEKEKQTSLHERLQLREEEAEKEAEERRKKRRDEMERKRLKQEEATKVKTEYGEDVRIEGEHDEDDMMASMGFVGFGTSKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.19
4 0.18
5 0.2
6 0.2
7 0.22
8 0.25
9 0.25
10 0.25
11 0.27
12 0.27
13 0.25
14 0.28
15 0.28
16 0.31
17 0.33
18 0.32
19 0.26
20 0.29
21 0.35
22 0.35
23 0.42
24 0.4
25 0.45
26 0.53
27 0.59
28 0.59
29 0.6
30 0.57
31 0.51
32 0.54
33 0.49
34 0.43
35 0.38
36 0.38
37 0.38
38 0.43
39 0.42
40 0.41
41 0.44
42 0.45
43 0.51
44 0.52
45 0.46
46 0.43
47 0.44
48 0.43
49 0.42
50 0.41
51 0.34
52 0.32
53 0.32
54 0.3
55 0.28
56 0.21
57 0.2
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.19
62 0.23
63 0.24
64 0.26
65 0.3
66 0.28
67 0.28
68 0.27
69 0.25
70 0.19
71 0.18
72 0.17
73 0.11
74 0.11
75 0.09
76 0.1
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.11
86 0.13
87 0.14
88 0.19
89 0.19
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.16
94 0.15
95 0.14
96 0.12
97 0.15
98 0.15
99 0.19
100 0.22
101 0.23
102 0.24
103 0.25
104 0.24
105 0.25
106 0.25
107 0.22
108 0.2
109 0.2
110 0.19
111 0.18
112 0.15
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.12
117 0.11
118 0.1
119 0.12
120 0.13
121 0.15
122 0.16
123 0.15
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.14
128 0.15
129 0.19
130 0.18
131 0.2
132 0.2
133 0.19
134 0.17
135 0.2
136 0.19
137 0.16
138 0.19
139 0.18
140 0.19
141 0.19
142 0.22
143 0.24
144 0.3
145 0.34
146 0.32
147 0.34
148 0.34
149 0.36
150 0.37
151 0.38
152 0.36
153 0.35
154 0.38
155 0.38
156 0.4
157 0.42
158 0.39
159 0.34
160 0.32
161 0.27
162 0.24
163 0.23
164 0.22
165 0.18
166 0.19
167 0.23
168 0.27
169 0.35
170 0.39
171 0.48
172 0.56
173 0.6
174 0.67
175 0.73
176 0.76
177 0.79
178 0.83
179 0.84
180 0.86
181 0.86
182 0.86
183 0.8
184 0.73
185 0.7
186 0.69
187 0.69
188 0.67
189 0.68
190 0.62
191 0.58
192 0.57
193 0.49
194 0.41
195 0.36
196 0.32
197 0.32
198 0.29
199 0.28
200 0.26
201 0.25
202 0.24
203 0.18
204 0.14
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.05