FuNGI

A0A2H9TLS1

Protein Details

Accession

A0A2H9TLS1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
56-85	DGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKERRDKTEKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-80	RSRRFRAAKERRD
353-369	KRREKEERRDANIKRRK

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 8, cyto 5, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSSKYPKTVGNVAAPETEEEMMVEIFKYIDRIFAMIRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAKERRDKTEKDAEIRSELGTEAEDSGDYFDYNCITPGTKFMALIASSIKYYIVERMNREPAWRNVKVIFSDANVPGEGEHKIMDYIRRQRLDPDYDPHTKHVIYGLDADLIMLSMATHEPYFKVLREDVFSEEQVKYTPCGHCGVKGHAADSCVERAKNDPTFTMAPIKEKPFIFLDVSILREYLEAELKPSTQLPFKWDLERAIDDWIFMCFFVGNDFLPHLPCLEIREGAIDILLDSYKANLPRMGGFICHNGTVELSRAQYILDDVGKVEEMIFQKRREKEERRDANIKRRKMADAEREMVHSQTPTPPSGEFANGNALLEMRDANRVAAQAFKTHLEASLQDDEPVDDVRLWERGCKGRYYRSKFHIEPDNQEFIAQVVKSYVEGLCWVMAYYYQGCPSWKWFYPYHFAPFASDLTGIGELDISFELGEPFRPFDQLMGVFPADSRMLVPEPFRRLMTEDDSEVIDFYPTDFAIDLNGKKQAWQGVVLLPFIDEERLLGALEKVYPELDPTDQQMNIRGEDRVFFSIWHPVTRHLVKRLEEGKHSASLDPAETDGLAGGVMKDADFPGLGSTYSTPLPEQGCVDVEDVQVACFVYFVPYHDRKHLRHKATLLPEAQPPSRILTPEDISAVQSGMASRRMPGRLQLERPGHHSMHQEHGRDYERRDSGRKREYQSDGQRRGNGGQWEGYQQRGQGRQGGQRGYQQEYQRDSYQRDSHQQDSYQRDSYQQEAYQRDSHQQDSYQRNPYQQPPQRDSHHQGDSRPYDSQHYQPHQPHQPHQSYQQGQYPFAAPQGNPFHVLSGPPRPMQPSMGAFHRGPPPNRRVEDLYGRYPPPPSNPNSRE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.49
3	0.51
4	0.55
5	0.53
6	0.51
7	0.48
8	0.45
9	0.41
10	0.38
11	0.34
12	0.29
13	0.24
14	0.16
15	0.14
16	0.13
17	0.11
18	0.1
19	0.09
20	0.07
21	0.07
22	0.07
23	0.1
24	0.09
25	0.11
26	0.12
27	0.13
28	0.15
29	0.19
30	0.29
31	0.34
32	0.37
33	0.4
34	0.4
35	0.41
36	0.41
37	0.41
38	0.32
39	0.29
40	0.28
41	0.23
42	0.24
43	0.22
44	0.23
45	0.19
46	0.17
47	0.13
48	0.14
49	0.21
50	0.28
51	0.38
52	0.46
53	0.56
54	0.67
55	0.75
56	0.8
57	0.84
58	0.83
59	0.82
60	0.83
61	0.84
62	0.84
63	0.87
64	0.86
65	0.85
66	0.86
67	0.8
68	0.76
69	0.76
70	0.71
71	0.67
72	0.64
73	0.58
74	0.53
75	0.51
76	0.43
77	0.33
78	0.27
79	0.21
80	0.16
81	0.13
82	0.1
83	0.09
84	0.09
85	0.08
86	0.1
87	0.1
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.1
92	0.1
93	0.11
94	0.1
95	0.12
96	0.12
97	0.15
98	0.19
99	0.19
100	0.18
101	0.18
102	0.21
103	0.2
104	0.2
105	0.19
106	0.15
107	0.14
108	0.14
109	0.14
110	0.1
111	0.11
112	0.16
113	0.21
114	0.25
115	0.3
116	0.37
117	0.44
118	0.44
119	0.47
120	0.48
121	0.5
122	0.54
123	0.51
124	0.47
125	0.43
126	0.46
127	0.43
128	0.39
129	0.32
130	0.24
131	0.29
132	0.27
133	0.25
134	0.21
135	0.2
136	0.17
137	0.17
138	0.16
139	0.11
140	0.1
141	0.09
142	0.1
143	0.12
144	0.16
145	0.23
146	0.32
147	0.39
148	0.41
149	0.41
150	0.47
151	0.53
152	0.56
153	0.52
154	0.48
155	0.47
156	0.52
157	0.53
158	0.5
159	0.46
160	0.38
161	0.34
162	0.33
163	0.27
164	0.21
165	0.22
166	0.2
167	0.17
168	0.16
169	0.15
170	0.11
171	0.09
172	0.07
173	0.04
174	0.03
175	0.04
176	0.04
177	0.05
178	0.05
179	0.06
180	0.07
181	0.1
182	0.12
183	0.13
184	0.16
185	0.17
186	0.19
187	0.22
188	0.23
189	0.24
190	0.25
191	0.25
192	0.25
193	0.23
194	0.21
195	0.2
196	0.19
197	0.16
198	0.19
199	0.2
200	0.18
201	0.22
202	0.22
203	0.25
204	0.28
205	0.32
206	0.33
207	0.32
208	0.31
209	0.28
210	0.29
211	0.26
212	0.24
213	0.22
214	0.19
215	0.18
216	0.18
217	0.2
218	0.26
219	0.29
220	0.28
221	0.25
222	0.26
223	0.28
224	0.29
225	0.34
226	0.28
227	0.28
228	0.31
229	0.34
230	0.34
231	0.32
232	0.33
233	0.28
234	0.29
235	0.27
236	0.22
237	0.23
238	0.19
239	0.21
240	0.18
241	0.16
242	0.14
243	0.12
244	0.12
245	0.1
246	0.12
247	0.1
248	0.11
249	0.12
250	0.12
251	0.13
252	0.14
253	0.14
254	0.15
255	0.16
256	0.19
257	0.25
258	0.27
259	0.3
260	0.31
261	0.31
262	0.31
263	0.32
264	0.27
265	0.25
266	0.22
267	0.19
268	0.17
269	0.16
270	0.12
271	0.1
272	0.09
273	0.05
274	0.05
275	0.06
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.08
280	0.08
281	0.09
282	0.09
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.11
287	0.12
288	0.12
289	0.11
290	0.12
291	0.12
292	0.11
293	0.11
294	0.07
295	0.05
296	0.06
297	0.06
298	0.04
299	0.04
300	0.05
301	0.08
302	0.1
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.13
307	0.15
308	0.15
309	0.13
310	0.13
311	0.16
312	0.16
313	0.15
314	0.14
315	0.12
316	0.12
317	0.11
318	0.11
319	0.1
320	0.09
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.08
326	0.09
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.06
334	0.09
335	0.1
336	0.16
337	0.19
338	0.22
339	0.29
340	0.33
341	0.39
342	0.45
343	0.52
344	0.56
345	0.64
346	0.7
347	0.7
348	0.75
349	0.74
350	0.76
351	0.75
352	0.69
353	0.62
354	0.56
355	0.51
356	0.48
357	0.51
358	0.49
359	0.47
360	0.47
361	0.43
362	0.42
363	0.4
364	0.35
365	0.27
366	0.18
367	0.13
368	0.14
369	0.15
370	0.14
371	0.14
372	0.14
373	0.15
374	0.16
375	0.17
376	0.13
377	0.12
378	0.15
379	0.13
380	0.13
381	0.11
382	0.1
383	0.09
384	0.08
385	0.08
386	0.05
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.08
391	0.08
392	0.08
393	0.11
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.12
398	0.12
399	0.12
400	0.12
401	0.1
402	0.1
403	0.13
404	0.16
405	0.15
406	0.14
407	0.14
408	0.14
409	0.14
410	0.14
411	0.1
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.09
416	0.09
417	0.1
418	0.13
419	0.19
420	0.2
421	0.24
422	0.26
423	0.33
424	0.43
425	0.49
426	0.52
427	0.53
428	0.59
429	0.56
430	0.58
431	0.58
432	0.5
433	0.48
434	0.46
435	0.43
436	0.35
437	0.34
438	0.28
439	0.19
440	0.19
441	0.13
442	0.08
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.06
448	0.04
449	0.05
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.05
454	0.04
455	0.04
456	0.05
457	0.06
458	0.07
459	0.08
460	0.08
461	0.09
462	0.1
463	0.14
464	0.18
465	0.18
466	0.21
467	0.22
468	0.25
469	0.3
470	0.32
471	0.32
472	0.29
473	0.27
474	0.24
475	0.24
476	0.21
477	0.16
478	0.14
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.07
483	0.06
484	0.05
485	0.04
486	0.05
487	0.05
488	0.04
489	0.03
490	0.04
491	0.04
492	0.04
493	0.06
494	0.05
495	0.07
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.08
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.09
506	0.09
507	0.1
508	0.08
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.08
514	0.11
515	0.14
516	0.18
517	0.19
518	0.19
519	0.19
520	0.2
521	0.22
522	0.24
523	0.21
524	0.18
525	0.17
526	0.18
527	0.17
528	0.15
529	0.12
530	0.07
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.07
539	0.1
540	0.1
541	0.11
542	0.14
543	0.13
544	0.14
545	0.16
546	0.18
547	0.16
548	0.16
549	0.16
550	0.17
551	0.18
552	0.17
553	0.15
554	0.12
555	0.11
556	0.1
557	0.09
558	0.05
559	0.04
560	0.04
561	0.05
562	0.05
563	0.05
564	0.05
565	0.05
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.11
576	0.14
577	0.14
578	0.15
579	0.2
580	0.2
581	0.2
582	0.2
583	0.19
584	0.16
585	0.17
586	0.19
587	0.15
588	0.13
589	0.13
590	0.13
591	0.19
592	0.2
593	0.21
594	0.2
595	0.2
596	0.27
597	0.32
598	0.35
599	0.34
600	0.39
601	0.38
602	0.45
603	0.49
604	0.46
605	0.43
606	0.43
607	0.39
608	0.37
609	0.37
610	0.29
611	0.23
612	0.21
613	0.19
614	0.15
615	0.13
616	0.09
617	0.08
618	0.07
619	0.06
620	0.05
621	0.04
622	0.04
623	0.03
624	0.03
625	0.04
626	0.03
627	0.04
628	0.04
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.07
637	0.09
638	0.09
639	0.1
640	0.09
641	0.12
642	0.13
643	0.13
644	0.13
645	0.13
646	0.13
647	0.14
648	0.15
649	0.13
650	0.12
651	0.12
652	0.11
653	0.1
654	0.1
655	0.08
656	0.07
657	0.06
658	0.06
659	0.06
660	0.06
661	0.08
662	0.16
663	0.22
664	0.24
665	0.33
666	0.4
667	0.42
668	0.53
669	0.61
670	0.58
671	0.59
672	0.62
673	0.61
674	0.62
675	0.64
676	0.55
677	0.48
678	0.46
679	0.44
680	0.41
681	0.34
682	0.28
683	0.26
684	0.26
685	0.24
686	0.22
687	0.23
688	0.24
689	0.23
690	0.24
691	0.2
692	0.18
693	0.18
694	0.15
695	0.1
696	0.09
697	0.09
698	0.09
699	0.12
700	0.11
701	0.12
702	0.17
703	0.2
704	0.2
705	0.26
706	0.32
707	0.36
708	0.4
709	0.48
710	0.49
711	0.49
712	0.53
713	0.52
714	0.45
715	0.42
716	0.44
717	0.39
718	0.43
719	0.47
720	0.43
721	0.39
722	0.43
723	0.44
724	0.41
725	0.41
726	0.4
727	0.4
728	0.42
729	0.49
730	0.52
731	0.56
732	0.63
733	0.67
734	0.64
735	0.67
736	0.7
737	0.72
738	0.75
739	0.76
740	0.75
741	0.73
742	0.71
743	0.65
744	0.6
745	0.56
746	0.48
747	0.4
748	0.34
749	0.3
750	0.32
751	0.31
752	0.31
753	0.27
754	0.26
755	0.3
756	0.32
757	0.32
758	0.33
759	0.37
760	0.41
761	0.46
762	0.47
763	0.43
764	0.45
765	0.47
766	0.46
767	0.47
768	0.45
769	0.46
770	0.48
771	0.5
772	0.5
773	0.5
774	0.49
775	0.51
776	0.52
777	0.51
778	0.54
779	0.55
780	0.54
781	0.55
782	0.56
783	0.56
784	0.56
785	0.56
786	0.52
787	0.47
788	0.46
789	0.44
790	0.42
791	0.4
792	0.36
793	0.38
794	0.37
795	0.41
796	0.42
797	0.41
798	0.45
799	0.43
800	0.43
801	0.39
802	0.41
803	0.45
804	0.48
805	0.53
806	0.55
807	0.53
808	0.56
809	0.59
810	0.61
811	0.64
812	0.63
813	0.65
814	0.62
815	0.67
816	0.67
817	0.71
818	0.7
819	0.67
820	0.69
821	0.62
822	0.6
823	0.63
824	0.61
825	0.56
826	0.51
827	0.44
828	0.42
829	0.43
830	0.46
831	0.47
832	0.47
833	0.53
834	0.57
835	0.64
836	0.67
837	0.7
838	0.7
839	0.7
840	0.72
841	0.68
842	0.68
843	0.7
844	0.65
845	0.64
846	0.63
847	0.55
848	0.49
849	0.47
850	0.41
851	0.32
852	0.3
853	0.29
854	0.21
855	0.27
856	0.33
857	0.32
858	0.34
859	0.33
860	0.31
861	0.28
862	0.31
863	0.28
864	0.29
865	0.33
866	0.31
867	0.34
868	0.36
869	0.37
870	0.38
871	0.39
872	0.35
873	0.34
874	0.37
875	0.4
876	0.36
877	0.4
878	0.45
879	0.47
880	0.49
881	0.54
882	0.58
883	0.63
884	0.65
885	0.65
886	0.62
887	0.62
888	0.67
889	0.64
890	0.62
891	0.59
892	0.58
893	0.54
894	0.52
895	0.47
896	0.45
897	0.46
898	0.45

A0A2H9TLS1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer