Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H9TNZ1

Protein Details
Accession A0A2H9TNZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
406-436EKKARKAAIKTERRENRVQKKELKVRFKLGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
403-433TAEEKKARKAAIKTERRENRVQKKELKVRFK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MTRQYIDKKNALHFRLVQKSVRDQAGEGDASERAFAPMNEAAAMKMAEMNGDDELPVVMEELDLDTITSPQHPEELDGHEAGEAAKYGIYYDDSSYDYTRHLKRIGEAPDAVFIPAASTQEVDATVIVDEATALNHATYDNIQELDIDPAVREVLDALDDEAFEDEDFEDDFVVKLNRDEAAVLCPVDYSAYREKKELSVEDDTDDDSYSDCGSLRGTAYAHSLAITSIDNKFDAILKMYDGEDDLDMVDLDDEDMDGEEVEEAMQEALDEFLSQQNEYLRPTVAERKQGAILLLDDIRKEMGVPSLAILNRQVSDTDDDVDVEGSSDESSDHFDCQSLAATLTNTENLPNVIREVSKKPASIIRLSRRTGMPIESGPNMDHTEREPEAPKENKGQSRSKDETAEEKKARKAAIKTERRENRVQKKELKVRFKLGEIETSRSRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.65
3 0.65
4 0.6
5 0.57
6 0.62
7 0.62
8 0.59
9 0.5
10 0.41
11 0.4
12 0.4
13 0.35
14 0.28
15 0.23
16 0.19
17 0.18
18 0.19
19 0.15
20 0.11
21 0.12
22 0.11
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.1
32 0.1
33 0.09
34 0.09
35 0.09
36 0.11
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.05
46 0.04
47 0.05
48 0.05
49 0.06
50 0.05
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.08
56 0.09
57 0.09
58 0.11
59 0.11
60 0.14
61 0.16
62 0.2
63 0.22
64 0.2
65 0.2
66 0.18
67 0.18
68 0.15
69 0.13
70 0.08
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.13
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.22
86 0.25
87 0.28
88 0.29
89 0.29
90 0.32
91 0.39
92 0.41
93 0.38
94 0.36
95 0.32
96 0.32
97 0.3
98 0.27
99 0.19
100 0.13
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.09
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.07
176 0.09
177 0.17
178 0.22
179 0.23
180 0.24
181 0.26
182 0.27
183 0.3
184 0.28
185 0.24
186 0.23
187 0.22
188 0.22
189 0.21
190 0.19
191 0.16
192 0.15
193 0.1
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.02
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.02
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.1
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.12
268 0.12
269 0.15
270 0.23
271 0.24
272 0.3
273 0.3
274 0.31
275 0.32
276 0.32
277 0.29
278 0.21
279 0.18
280 0.13
281 0.14
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.13
301 0.1
302 0.14
303 0.14
304 0.15
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.11
310 0.08
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.12
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.12
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.13
341 0.17
342 0.21
343 0.28
344 0.3
345 0.3
346 0.31
347 0.35
348 0.38
349 0.42
350 0.47
351 0.49
352 0.54
353 0.55
354 0.57
355 0.53
356 0.53
357 0.48
358 0.41
359 0.34
360 0.29
361 0.31
362 0.28
363 0.28
364 0.24
365 0.24
366 0.24
367 0.21
368 0.19
369 0.18
370 0.23
371 0.22
372 0.26
373 0.27
374 0.28
375 0.36
376 0.39
377 0.41
378 0.43
379 0.5
380 0.54
381 0.56
382 0.62
383 0.6
384 0.65
385 0.67
386 0.63
387 0.59
388 0.55
389 0.6
390 0.58
391 0.62
392 0.58
393 0.58
394 0.59
395 0.58
396 0.59
397 0.56
398 0.54
399 0.55
400 0.6
401 0.64
402 0.66
403 0.72
404 0.78
405 0.77
406 0.81
407 0.81
408 0.81
409 0.81
410 0.84
411 0.82
412 0.84
413 0.87
414 0.87
415 0.87
416 0.83
417 0.81
418 0.77
419 0.71
420 0.68
421 0.6
422 0.6
423 0.54
424 0.54