Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H9TJA7

Protein Details
Accession A0A2H9TJA7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-228TPAVTPESPREQKRRRTRKRIRPITFDAIPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
208-220REQKRRRTRKRIR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
IPR046360  T-box_DNA-bd  
IPR036960  T-box_sf  
IPR001699  TF_T-box  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00907  T-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50252  TBOX_3  
CDD cd00182  T-box  
Amino Acid Sequences MRAELVELDLWRQFHAQQNEMIITKAGRCLFPLFRVRFVPEEGMAVEEEREYRVSISIEPMDENKWKWRQGRWIPLLTSRLGIDETPEQIVCYERLKGSEMTLNGLNFDKIKLTNRESDSPMTVCLQSFHRYIPTVQIVECDNPKRIQILRFPETEFIAVTHYQNEQVTVLKKSYNPHAKGFVLSEGSPTQGTVDWLLTPAVTPESPREQKRRRTRKRIRPITFDAIPSDEEELQGSIALQLLGSKDDDKSCE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.31
4 0.31
5 0.34
6 0.36
7 0.35
8 0.32
9 0.24
10 0.2
11 0.18
12 0.21
13 0.19
14 0.16
15 0.18
16 0.23
17 0.24
18 0.3
19 0.39
20 0.36
21 0.39
22 0.41
23 0.42
24 0.4
25 0.4
26 0.36
27 0.27
28 0.25
29 0.21
30 0.19
31 0.16
32 0.14
33 0.12
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.15
44 0.15
45 0.15
46 0.16
47 0.16
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.25
52 0.29
53 0.34
54 0.37
55 0.41
56 0.49
57 0.55
58 0.64
59 0.62
60 0.62
61 0.59
62 0.59
63 0.56
64 0.46
65 0.38
66 0.27
67 0.22
68 0.17
69 0.15
70 0.12
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.12
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.17
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.16
91 0.15
92 0.15
93 0.13
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.13
99 0.17
100 0.19
101 0.25
102 0.28
103 0.32
104 0.33
105 0.33
106 0.3
107 0.26
108 0.24
109 0.19
110 0.16
111 0.12
112 0.11
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.14
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.14
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.18
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.18
133 0.19
134 0.21
135 0.25
136 0.3
137 0.31
138 0.32
139 0.33
140 0.32
141 0.3
142 0.27
143 0.2
144 0.13
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.1
154 0.12
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.18
160 0.2
161 0.29
162 0.36
163 0.37
164 0.38
165 0.42
166 0.41
167 0.4
168 0.39
169 0.32
170 0.24
171 0.21
172 0.2
173 0.16
174 0.16
175 0.15
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.11
180 0.09
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.13
192 0.22
193 0.3
194 0.37
195 0.46
196 0.53
197 0.64
198 0.74
199 0.81
200 0.83
201 0.87
202 0.92
203 0.93
204 0.95
205 0.96
206 0.93
207 0.9
208 0.88
209 0.84
210 0.76
211 0.67
212 0.58
213 0.49
214 0.42
215 0.34
216 0.29
217 0.21
218 0.17
219 0.16
220 0.14
221 0.12
222 0.11
223 0.1
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.09
231 0.1
232 0.11
233 0.13