Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H9TP00

Protein Details
Accession A0A2H9TP00    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-329QEITRRESTKEARKEKKFKEKLKELRLKTRSKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-48SKLHRRLLKLVRKAGKDKSLKR
305-329TKEARKEKKFKEKLKELRLKTRSKS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
IPR004037  Ribosomal_L7Ae_CS  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
IPR022652  Znf_XPA_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
PF05181  XPA_C  
PF01286  XPA_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01082  RIBOSOMAL_L7AE  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MSSDGENQTMEFDQTALAIIAKPLAPSKLHRRLLKLVRKAGKDKSLKRGVPGDVSPIDVLTHIPVLCEEANIPYAYLPSKVELGAAGSTRRPTCCVMIPEPKSGTFSVGVILMSDNIELSEEQKLLIQTNMERARRLISSKRPLEDTVQQAAVNETITTSRRGGFLHPSQPDSTLKDTREARRLNDDIIVTYPLEGNATCRHCTSIELDAVLKTHFSINVCHNCREIHSNNYRLLTKTTVKDEYLLTDEELADTSVLPFMTKPNPYKSTWSDMQLYLSMHVEKFAVKKWGSLEALQQEITRRESTKEARKEKKFKEKLKELRLKTRSKSSSALSSRASRRHVHCFEIVAAGLKRCTECQLEVEEEDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.08
4 0.08
5 0.07
6 0.07
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.12
11 0.15
12 0.16
13 0.23
14 0.34
15 0.42
16 0.5
17 0.54
18 0.58
19 0.65
20 0.74
21 0.77
22 0.75
23 0.74
24 0.74
25 0.77
26 0.77
27 0.74
28 0.74
29 0.74
30 0.72
31 0.73
32 0.75
33 0.69
34 0.68
35 0.67
36 0.6
37 0.56
38 0.49
39 0.45
40 0.35
41 0.35
42 0.3
43 0.24
44 0.21
45 0.15
46 0.15
47 0.1
48 0.12
49 0.1
50 0.1
51 0.09
52 0.13
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.16
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.21
80 0.23
81 0.27
82 0.31
83 0.34
84 0.42
85 0.44
86 0.46
87 0.46
88 0.43
89 0.4
90 0.35
91 0.3
92 0.21
93 0.18
94 0.13
95 0.12
96 0.11
97 0.09
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.05
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.08
108 0.07
109 0.08
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.18
117 0.25
118 0.24
119 0.24
120 0.24
121 0.26
122 0.26
123 0.3
124 0.29
125 0.32
126 0.41
127 0.45
128 0.46
129 0.46
130 0.46
131 0.46
132 0.44
133 0.39
134 0.32
135 0.29
136 0.27
137 0.24
138 0.23
139 0.19
140 0.13
141 0.09
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.12
150 0.13
151 0.18
152 0.22
153 0.27
154 0.28
155 0.29
156 0.29
157 0.3
158 0.3
159 0.27
160 0.27
161 0.24
162 0.24
163 0.27
164 0.32
165 0.33
166 0.4
167 0.38
168 0.35
169 0.38
170 0.38
171 0.33
172 0.31
173 0.27
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.06
181 0.07
182 0.06
183 0.07
184 0.11
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.16
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.14
198 0.13
199 0.1
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.1
205 0.17
206 0.26
207 0.29
208 0.3
209 0.31
210 0.3
211 0.31
212 0.35
213 0.31
214 0.31
215 0.34
216 0.37
217 0.39
218 0.41
219 0.41
220 0.35
221 0.34
222 0.3
223 0.29
224 0.28
225 0.3
226 0.3
227 0.29
228 0.29
229 0.27
230 0.24
231 0.22
232 0.19
233 0.15
234 0.13
235 0.13
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.09
247 0.13
248 0.19
249 0.22
250 0.29
251 0.33
252 0.35
253 0.42
254 0.43
255 0.46
256 0.44
257 0.44
258 0.4
259 0.37
260 0.36
261 0.32
262 0.28
263 0.22
264 0.2
265 0.18
266 0.14
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.16
272 0.21
273 0.2
274 0.23
275 0.24
276 0.31
277 0.31
278 0.3
279 0.33
280 0.29
281 0.31
282 0.29
283 0.28
284 0.25
285 0.26
286 0.28
287 0.25
288 0.23
289 0.24
290 0.31
291 0.39
292 0.45
293 0.53
294 0.59
295 0.66
296 0.75
297 0.83
298 0.86
299 0.88
300 0.88
301 0.88
302 0.88
303 0.89
304 0.89
305 0.9
306 0.9
307 0.85
308 0.86
309 0.85
310 0.83
311 0.78
312 0.78
313 0.72
314 0.67
315 0.64
316 0.58
317 0.59
318 0.55
319 0.55
320 0.48
321 0.52
322 0.55
323 0.57
324 0.57
325 0.55
326 0.56
327 0.61
328 0.61
329 0.58
330 0.53
331 0.5
332 0.46
333 0.41
334 0.36
335 0.31
336 0.29
337 0.26
338 0.24
339 0.23
340 0.23
341 0.21
342 0.25
343 0.23
344 0.23
345 0.25
346 0.29
347 0.31