Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H9TIM1

Protein Details
Accession A0A2H9TIM1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
698-722ETDQFKCGRCGQRKTKYYQLQTRSAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10mito 10mito_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017959  Asn/Gln-tRNA_amidoTrfase_suB/E  
IPR006075  Asn/Gln-tRNA_Trfase_suB/E_cat  
IPR003789  Asn/Gln_tRNA_amidoTrase-B-like  
IPR017958  Gln-tRNA_amidoTrfase_suB_CS  
IPR014746  Gln_synth/guanido_kin_cat_dom  
IPR003617  TFIIS/CRSP70_N_sub  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
IPR006289  TFSII  
IPR001222  Znf_TFIIS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016884  F:carbon-nitrogen ligase activity, with glutamine as amido-N-donor  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF02934  GatB_N  
PF08711  Med26  
PF01096  TFIIS_C  
PF07500  TFIIS_M  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01234  GATB  
PS51321  TFIIS_CENTRAL  
PS51319  TFIIS_N  
PS00466  ZF_TFIIS_1  
PS51133  ZF_TFIIS_2  
CDD cd13749  Zn-ribbon_TFIIS  
Amino Acid Sequences MLRSQTWTTVVGLEIHAQLASRHKLFSVAPNNCDAQLGTCCAPFDAAVPGALPLLNQECVDLALRAAIALRCNIRSRSFFDRKHYRYDDLPLGYQITQHRSPFAVDGVVHSNGRLYKIPRIQIEQDSAKRVGGMLDLNRCGVPLVEVVTAPEIGSASEAEGVARAIWRTLVDSGTTCGVLADGNVRFDVNVSLAGPVVGERVEIKNINTFAGLRRAIVSEEERQRKVFNSGDFVVKETRSWDETSRITLSSREKGNYFIMPEYDLPVLEITDSRIDQVKKELPEGTWERYSRMKELGLSEQEVDSMVDSGMLSIFEECRGNNDPRLVYNFVMNKYLGSLRKFPKGVDVEELRLIISHLATGDIDHPSASITELLKPSKAISASLTLEMCAMLEEMIKKNPKKLAQLREGRDVTDYFMGPLIKTKSGISPSALRPLVAEFLDHKKVRRLLGTFLADGTDFDAVVETLKELQDTPIKREVLEESKLGVQVNKVRKAGNEELAALATGILLKWRDIMLEEGKTTKKRPLEESKVEPPSKDIKKVKDVPSREPTPKDIEKVKDVSSIKPTPKDTISSREADEFKTGDAIRDKCYEMLLSALLQDTTESPTLKHYRICREIEECLFVEFGSTSPAYKAKFRSKYLNLKSTPALRHALLTHLTPAGFHAMNAAEMASEERRRQDSLLAEKNLAESKAVQDTEAETDQFKCGRCGQRKTKYYQLQTRSADEPMTTFVTCINCGNRWKFC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.14
4 0.12
5 0.13
6 0.19
7 0.24
8 0.23
9 0.23
10 0.23
11 0.26
12 0.28
13 0.36
14 0.4
15 0.39
16 0.4
17 0.43
18 0.45
19 0.42
20 0.4
21 0.31
22 0.24
23 0.21
24 0.23
25 0.2
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.19
30 0.16
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.12
39 0.1
40 0.09
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.15
48 0.12
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.15
57 0.18
58 0.2
59 0.25
60 0.29
61 0.32
62 0.34
63 0.39
64 0.45
65 0.52
66 0.54
67 0.6
68 0.67
69 0.65
70 0.72
71 0.71
72 0.65
73 0.59
74 0.61
75 0.58
76 0.51
77 0.49
78 0.4
79 0.38
80 0.33
81 0.33
82 0.31
83 0.3
84 0.31
85 0.3
86 0.3
87 0.29
88 0.3
89 0.28
90 0.25
91 0.2
92 0.16
93 0.18
94 0.2
95 0.22
96 0.2
97 0.18
98 0.2
99 0.18
100 0.21
101 0.23
102 0.22
103 0.28
104 0.35
105 0.41
106 0.42
107 0.47
108 0.49
109 0.49
110 0.53
111 0.52
112 0.49
113 0.49
114 0.45
115 0.39
116 0.34
117 0.3
118 0.23
119 0.17
120 0.18
121 0.17
122 0.21
123 0.22
124 0.23
125 0.23
126 0.22
127 0.2
128 0.16
129 0.13
130 0.08
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.04
187 0.06
188 0.08
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.17
196 0.16
197 0.16
198 0.21
199 0.2
200 0.16
201 0.17
202 0.17
203 0.17
204 0.19
205 0.2
206 0.22
207 0.3
208 0.36
209 0.36
210 0.36
211 0.37
212 0.36
213 0.38
214 0.34
215 0.27
216 0.27
217 0.27
218 0.31
219 0.3
220 0.3
221 0.27
222 0.23
223 0.21
224 0.17
225 0.18
226 0.17
227 0.18
228 0.19
229 0.21
230 0.21
231 0.25
232 0.24
233 0.23
234 0.21
235 0.24
236 0.26
237 0.27
238 0.29
239 0.27
240 0.26
241 0.28
242 0.3
243 0.28
244 0.25
245 0.2
246 0.17
247 0.17
248 0.17
249 0.16
250 0.14
251 0.12
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.13
262 0.14
263 0.14
264 0.2
265 0.23
266 0.23
267 0.25
268 0.26
269 0.21
270 0.28
271 0.31
272 0.3
273 0.3
274 0.29
275 0.29
276 0.33
277 0.34
278 0.29
279 0.28
280 0.24
281 0.21
282 0.24
283 0.27
284 0.24
285 0.23
286 0.21
287 0.19
288 0.18
289 0.16
290 0.13
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.05
305 0.09
306 0.14
307 0.15
308 0.17
309 0.19
310 0.19
311 0.2
312 0.24
313 0.23
314 0.19
315 0.22
316 0.23
317 0.21
318 0.22
319 0.21
320 0.16
321 0.16
322 0.19
323 0.18
324 0.17
325 0.24
326 0.25
327 0.31
328 0.31
329 0.3
330 0.34
331 0.33
332 0.32
333 0.3
334 0.29
335 0.25
336 0.25
337 0.25
338 0.17
339 0.14
340 0.13
341 0.08
342 0.06
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.09
359 0.11
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.1
367 0.09
368 0.12
369 0.13
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.05
377 0.05
378 0.03
379 0.04
380 0.05
381 0.07
382 0.11
383 0.16
384 0.16
385 0.2
386 0.25
387 0.28
388 0.36
389 0.43
390 0.48
391 0.52
392 0.6
393 0.6
394 0.64
395 0.6
396 0.51
397 0.45
398 0.36
399 0.29
400 0.22
401 0.18
402 0.1
403 0.12
404 0.11
405 0.1
406 0.13
407 0.14
408 0.12
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.17
413 0.19
414 0.17
415 0.2
416 0.21
417 0.27
418 0.26
419 0.23
420 0.21
421 0.21
422 0.21
423 0.15
424 0.14
425 0.1
426 0.15
427 0.22
428 0.22
429 0.23
430 0.26
431 0.3
432 0.31
433 0.33
434 0.31
435 0.28
436 0.34
437 0.35
438 0.29
439 0.26
440 0.24
441 0.19
442 0.17
443 0.14
444 0.07
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.05
450 0.05
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.08
457 0.14
458 0.15
459 0.2
460 0.25
461 0.25
462 0.25
463 0.26
464 0.29
465 0.28
466 0.29
467 0.24
468 0.19
469 0.21
470 0.22
471 0.2
472 0.17
473 0.15
474 0.2
475 0.27
476 0.31
477 0.31
478 0.31
479 0.32
480 0.39
481 0.41
482 0.38
483 0.32
484 0.27
485 0.26
486 0.25
487 0.23
488 0.15
489 0.11
490 0.05
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.08
500 0.12
501 0.14
502 0.15
503 0.16
504 0.18
505 0.22
506 0.24
507 0.26
508 0.28
509 0.29
510 0.31
511 0.39
512 0.46
513 0.52
514 0.57
515 0.62
516 0.65
517 0.69
518 0.66
519 0.58
520 0.51
521 0.51
522 0.48
523 0.5
524 0.48
525 0.45
526 0.54
527 0.63
528 0.69
529 0.68
530 0.68
531 0.68
532 0.7
533 0.71
534 0.67
535 0.62
536 0.56
537 0.55
538 0.54
539 0.5
540 0.48
541 0.45
542 0.45
543 0.45
544 0.43
545 0.42
546 0.4
547 0.39
548 0.4
549 0.43
550 0.42
551 0.45
552 0.46
553 0.42
554 0.43
555 0.44
556 0.39
557 0.4
558 0.4
559 0.37
560 0.36
561 0.38
562 0.37
563 0.34
564 0.33
565 0.26
566 0.22
567 0.24
568 0.22
569 0.21
570 0.26
571 0.26
572 0.27
573 0.29
574 0.3
575 0.25
576 0.26
577 0.22
578 0.16
579 0.16
580 0.13
581 0.1
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.07
588 0.1
589 0.12
590 0.12
591 0.12
592 0.2
593 0.25
594 0.27
595 0.31
596 0.35
597 0.42
598 0.5
599 0.53
600 0.49
601 0.49
602 0.52
603 0.49
604 0.46
605 0.37
606 0.3
607 0.27
608 0.22
609 0.19
610 0.13
611 0.11
612 0.1
613 0.1
614 0.1
615 0.12
616 0.15
617 0.16
618 0.22
619 0.3
620 0.36
621 0.44
622 0.48
623 0.57
624 0.62
625 0.72
626 0.75
627 0.77
628 0.69
629 0.65
630 0.65
631 0.63
632 0.57
633 0.5
634 0.45
635 0.36
636 0.37
637 0.33
638 0.33
639 0.27
640 0.25
641 0.23
642 0.2
643 0.2
644 0.17
645 0.17
646 0.18
647 0.16
648 0.14
649 0.14
650 0.13
651 0.14
652 0.14
653 0.12
654 0.07
655 0.08
656 0.11
657 0.13
658 0.16
659 0.18
660 0.24
661 0.27
662 0.29
663 0.29
664 0.32
665 0.35
666 0.42
667 0.49
668 0.46
669 0.45
670 0.43
671 0.45
672 0.43
673 0.35
674 0.26
675 0.18
676 0.19
677 0.25
678 0.25
679 0.22
680 0.2
681 0.22
682 0.26
683 0.26
684 0.23
685 0.18
686 0.19
687 0.23
688 0.25
689 0.24
690 0.22
691 0.29
692 0.39
693 0.47
694 0.56
695 0.63
696 0.71
697 0.78
698 0.82
699 0.84
700 0.83
701 0.84
702 0.84
703 0.8
704 0.79
705 0.76
706 0.73
707 0.65
708 0.57
709 0.48
710 0.39
711 0.33
712 0.27
713 0.26
714 0.21
715 0.18
716 0.19
717 0.2
718 0.21
719 0.24
720 0.25
721 0.27
722 0.35