Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H9TN64

Protein Details
Accession A0A2H9TN64    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-26DVPVLLVPRKPKNVRKKDEEELAHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSDVPVLLVPRKPKNVRKKDEEELAHDKTEDIRVTKIVRRDQPEDCSAGAETPTGSKLDLHFEASRDTNLSTADATATAEYETDVSQDHRALREQSSTQTSVLTDRYQGRSAYYAYLTRHDTTRANALSDKNHASAPHRLATHIRNTCRFDYAPDLCKDYNETGFCGFGDSCKFVHDRGDYKAGWELDDEWDEQQRRLKAGKTESDYEIKEEVVATDIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.76
3 0.81
4 0.83
5 0.84
6 0.82
7 0.82
8 0.76
9 0.73
10 0.69
11 0.63
12 0.54
13 0.46
14 0.39
15 0.31
16 0.32
17 0.27
18 0.21
19 0.2
20 0.22
21 0.26
22 0.3
23 0.35
24 0.39
25 0.43
26 0.48
27 0.51
28 0.53
29 0.54
30 0.53
31 0.48
32 0.4
33 0.34
34 0.28
35 0.24
36 0.19
37 0.14
38 0.11
39 0.09
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.09
45 0.14
46 0.15
47 0.18
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.21
52 0.21
53 0.17
54 0.16
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.05
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.08
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.18
81 0.18
82 0.19
83 0.21
84 0.21
85 0.19
86 0.18
87 0.17
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.17
94 0.18
95 0.18
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.16
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.16
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.22
111 0.2
112 0.19
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.24
117 0.25
118 0.19
119 0.19
120 0.19
121 0.2
122 0.24
123 0.25
124 0.26
125 0.24
126 0.24
127 0.27
128 0.29
129 0.35
130 0.36
131 0.36
132 0.38
133 0.42
134 0.43
135 0.43
136 0.4
137 0.33
138 0.34
139 0.35
140 0.36
141 0.33
142 0.36
143 0.32
144 0.32
145 0.33
146 0.28
147 0.28
148 0.23
149 0.23
150 0.19
151 0.2
152 0.19
153 0.18
154 0.15
155 0.12
156 0.14
157 0.14
158 0.14
159 0.15
160 0.16
161 0.14
162 0.21
163 0.24
164 0.24
165 0.28
166 0.33
167 0.31
168 0.32
169 0.38
170 0.32
171 0.27
172 0.25
173 0.21
174 0.19
175 0.21
176 0.2
177 0.16
178 0.22
179 0.23
180 0.24
181 0.29
182 0.29
183 0.31
184 0.34
185 0.38
186 0.38
187 0.45
188 0.52
189 0.52
190 0.54
191 0.54
192 0.56
193 0.52
194 0.48
195 0.41
196 0.32
197 0.26
198 0.22
199 0.18