Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2H9TIQ1

Protein Details
Accession A0A2H9TIQ1    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
867-887ACRHGDKCSRKHVKPNYSVTLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 11.5, cyto 4.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031168  G_TrmE  
IPR006073  GTP-bd  
IPR018948  GTP-bd_TrmE_N  
IPR004520  GTPase_MnmE  
IPR027368  MnmE_dom2  
IPR025867  MnmE_helical  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR005225  Small_GTP-bd_dom  
IPR027266  TrmE/GcvT_dom1  
IPR009145  U2AF_small  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0089701  C:U2AF complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF01926  MMR_HSR1  
PF12631  MnmE_helical  
PF00566  RabGAP-TBC  
PF10396  TrmE_N  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50086  TBC_RABGAP  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12538  RRM_U2AF35  
cd04164  trmE  
cd14858  TrmE_N  
Amino Acid Sequences MRRHVNLFSKFPGKKPLRVNNTVSSEILVKRPPQTDETTSNKALLAGDTIFALATAQGRAGVGVIRVSGSDTLEVLRAILPAYKFSQIVSDPRRLVRTEIFDTTRLLDDGMAVFFKAELHIHSSKAIISSMYRKLGSIPMVRLAEAGEFSRRAFANGKINLAQIEGLADLIKAETEEQRKLAISHVSGSLTNSFEEWRRSVISAMAQTEAWIDFSEDELIETDTMNVVCQQITHLVSDIREQIERAKFGKVIRDGFKIALCGPPNAGKSSLLNVLARREAAIVSPIAGTTRDVLQVHMDMSGYPIILSDTAGINDLSEDAIEREGIKRAIQAAADADHVLFTIGADMLDNPGEWIDTLDHFDPDQTDFILNKIDLSVCISLQTLLPVKFSKCKIFEASSICPTPFITQFESHIKEKIAKMDSGQSSPVIANERQLCHARDALAHLCNFLASQGDVVIAAEQLRQAANCIGRITGHIDSEDVLDADDGITLVWGQAENFSEPLLCSAKALLAGQEASAVSGLLPSTITKIPSGIVAHAVSDIDSSTLLITLREPVNGQATFLFHPVENEMFAVQLLECTKSHQPDMDDAVFGIFDTFSKVSRFYYNTARSLLGAEDTSRRPRSPRDAHINPWIVERGSDKESRPEHWKRLFPKSSEHDYKELAAMAERTLHEEVINRIKKDVCRTDRTMDFYYPEVHDMEQDLELPNLAALYRILLSYAYLHEKTINYVQGMNDIASPILYVMQNEEDAFRVFECVMETHQDYFVENGQHTRNQLGLLAAMLQVADPVLHDRFGFSRDNSELFICYRWLLLLLKREVGFESFPIILETIFSCPTPSYELFIALALLLTYRDELLKFGHRFDLTLQIGACRHGDKCSRKHVKPNYSVTLLIPNIYLNPAHDVSCALSPDQLQQHFDLFFEDMYVELAVKYGEIEEMVICDNIGDHLIGNVYVRFKYEDAAGKAVEDLNKRWYAGRPIFAELSPVTDFRESCCRQYENGECNRGGYCNFMHLKYPNRELKKELFASQVESIKTKGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.64
3 0.68
4 0.67
5 0.72
6 0.75
7 0.73
8 0.74
9 0.68
10 0.58
11 0.49
12 0.44
13 0.38
14 0.37
15 0.32
16 0.3
17 0.33
18 0.37
19 0.39
20 0.4
21 0.44
22 0.47
23 0.5
24 0.54
25 0.54
26 0.52
27 0.49
28 0.44
29 0.38
30 0.32
31 0.25
32 0.2
33 0.14
34 0.13
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.1
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.09
65 0.09
66 0.13
67 0.12
68 0.14
69 0.17
70 0.19
71 0.18
72 0.18
73 0.23
74 0.22
75 0.31
76 0.33
77 0.39
78 0.4
79 0.44
80 0.47
81 0.44
82 0.45
83 0.43
84 0.45
85 0.42
86 0.45
87 0.44
88 0.42
89 0.42
90 0.39
91 0.35
92 0.27
93 0.22
94 0.16
95 0.14
96 0.14
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.15
107 0.17
108 0.18
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.13
115 0.14
116 0.2
117 0.25
118 0.28
119 0.27
120 0.26
121 0.28
122 0.31
123 0.34
124 0.33
125 0.3
126 0.32
127 0.33
128 0.33
129 0.3
130 0.27
131 0.21
132 0.17
133 0.17
134 0.13
135 0.13
136 0.13
137 0.18
138 0.17
139 0.19
140 0.21
141 0.25
142 0.31
143 0.33
144 0.36
145 0.33
146 0.34
147 0.31
148 0.29
149 0.24
150 0.14
151 0.12
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.04
160 0.06
161 0.12
162 0.16
163 0.18
164 0.19
165 0.21
166 0.22
167 0.22
168 0.24
169 0.22
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.2
175 0.21
176 0.2
177 0.17
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.16
182 0.19
183 0.18
184 0.19
185 0.2
186 0.2
187 0.21
188 0.21
189 0.23
190 0.23
191 0.23
192 0.21
193 0.19
194 0.18
195 0.18
196 0.16
197 0.12
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.1
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.11
219 0.12
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.17
225 0.19
226 0.16
227 0.16
228 0.16
229 0.21
230 0.25
231 0.27
232 0.26
233 0.26
234 0.27
235 0.28
236 0.35
237 0.33
238 0.36
239 0.37
240 0.39
241 0.38
242 0.36
243 0.36
244 0.29
245 0.25
246 0.24
247 0.21
248 0.18
249 0.18
250 0.22
251 0.23
252 0.23
253 0.23
254 0.19
255 0.19
256 0.21
257 0.23
258 0.2
259 0.2
260 0.2
261 0.21
262 0.21
263 0.2
264 0.17
265 0.15
266 0.13
267 0.11
268 0.12
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.11
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.05
304 0.04
305 0.05
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.1
323 0.09
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.11
357 0.1
358 0.09
359 0.09
360 0.08
361 0.07
362 0.1
363 0.1
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.13
373 0.14
374 0.15
375 0.2
376 0.23
377 0.27
378 0.26
379 0.29
380 0.31
381 0.32
382 0.35
383 0.36
384 0.37
385 0.34
386 0.33
387 0.3
388 0.26
389 0.24
390 0.22
391 0.19
392 0.18
393 0.17
394 0.16
395 0.2
396 0.25
397 0.28
398 0.27
399 0.26
400 0.25
401 0.25
402 0.26
403 0.29
404 0.26
405 0.22
406 0.22
407 0.28
408 0.29
409 0.26
410 0.25
411 0.19
412 0.17
413 0.17
414 0.17
415 0.13
416 0.12
417 0.15
418 0.17
419 0.18
420 0.2
421 0.23
422 0.23
423 0.21
424 0.22
425 0.19
426 0.16
427 0.19
428 0.19
429 0.19
430 0.17
431 0.16
432 0.14
433 0.14
434 0.13
435 0.09
436 0.07
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.03
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.05
452 0.08
453 0.08
454 0.09
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.13
460 0.12
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.1
467 0.06
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.03
474 0.02
475 0.02
476 0.02
477 0.02
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.04
482 0.05
483 0.05
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.08
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.08
495 0.08
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.03
509 0.03
510 0.03
511 0.06
512 0.07
513 0.08
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.1
518 0.1
519 0.08
520 0.09
521 0.08
522 0.09
523 0.08
524 0.08
525 0.06
526 0.06
527 0.05
528 0.04
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.07
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.13
542 0.13
543 0.13
544 0.1
545 0.12
546 0.12
547 0.13
548 0.12
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.08
554 0.07
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.05
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.07
563 0.07
564 0.1
565 0.13
566 0.14
567 0.15
568 0.16
569 0.16
570 0.17
571 0.22
572 0.2
573 0.17
574 0.15
575 0.15
576 0.12
577 0.11
578 0.09
579 0.04
580 0.03
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.1
587 0.14
588 0.16
589 0.17
590 0.26
591 0.29
592 0.3
593 0.31
594 0.3
595 0.27
596 0.26
597 0.23
598 0.14
599 0.1
600 0.09
601 0.11
602 0.13
603 0.19
604 0.21
605 0.21
606 0.23
607 0.28
608 0.37
609 0.41
610 0.47
611 0.51
612 0.54
613 0.57
614 0.63
615 0.62
616 0.52
617 0.46
618 0.39
619 0.28
620 0.25
621 0.23
622 0.18
623 0.17
624 0.2
625 0.19
626 0.26
627 0.27
628 0.3
629 0.37
630 0.4
631 0.45
632 0.49
633 0.55
634 0.53
635 0.62
636 0.64
637 0.57
638 0.59
639 0.57
640 0.6
641 0.6
642 0.58
643 0.49
644 0.45
645 0.44
646 0.36
647 0.3
648 0.21
649 0.15
650 0.12
651 0.09
652 0.11
653 0.1
654 0.13
655 0.12
656 0.12
657 0.12
658 0.13
659 0.17
660 0.24
661 0.28
662 0.25
663 0.26
664 0.29
665 0.32
666 0.38
667 0.45
668 0.42
669 0.45
670 0.49
671 0.53
672 0.54
673 0.57
674 0.52
675 0.43
676 0.38
677 0.32
678 0.31
679 0.25
680 0.23
681 0.18
682 0.14
683 0.13
684 0.13
685 0.13
686 0.1
687 0.1
688 0.09
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.06
693 0.05
694 0.05
695 0.04
696 0.03
697 0.04
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.05
702 0.06
703 0.07
704 0.09
705 0.12
706 0.12
707 0.13
708 0.15
709 0.16
710 0.18
711 0.21
712 0.21
713 0.17
714 0.19
715 0.18
716 0.18
717 0.19
718 0.16
719 0.12
720 0.1
721 0.09
722 0.08
723 0.07
724 0.05
725 0.06
726 0.06
727 0.06
728 0.07
729 0.08
730 0.09
731 0.09
732 0.09
733 0.09
734 0.1
735 0.1
736 0.08
737 0.09
738 0.08
739 0.09
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.12
744 0.14
745 0.14
746 0.15
747 0.15
748 0.14
749 0.15
750 0.17
751 0.16
752 0.15
753 0.17
754 0.18
755 0.2
756 0.21
757 0.2
758 0.18
759 0.16
760 0.16
761 0.13
762 0.11
763 0.09
764 0.09
765 0.07
766 0.06
767 0.06
768 0.05
769 0.04
770 0.04
771 0.04
772 0.03
773 0.06
774 0.07
775 0.08
776 0.08
777 0.09
778 0.11
779 0.14
780 0.17
781 0.15
782 0.2
783 0.21
784 0.22
785 0.22
786 0.22
787 0.21
788 0.18
789 0.19
790 0.14
791 0.13
792 0.11
793 0.1
794 0.11
795 0.12
796 0.15
797 0.22
798 0.23
799 0.27
800 0.27
801 0.28
802 0.27
803 0.26
804 0.23
805 0.16
806 0.17
807 0.13
808 0.13
809 0.13
810 0.12
811 0.1
812 0.1
813 0.1
814 0.09
815 0.1
816 0.09
817 0.1
818 0.1
819 0.11
820 0.16
821 0.15
822 0.17
823 0.17
824 0.18
825 0.17
826 0.17
827 0.16
828 0.1
829 0.1
830 0.06
831 0.05
832 0.04
833 0.04
834 0.05
835 0.05
836 0.06
837 0.07
838 0.08
839 0.11
840 0.2
841 0.21
842 0.22
843 0.28
844 0.27
845 0.28
846 0.28
847 0.35
848 0.27
849 0.28
850 0.26
851 0.23
852 0.24
853 0.24
854 0.24
855 0.16
856 0.16
857 0.2
858 0.29
859 0.35
860 0.41
861 0.51
862 0.6
863 0.63
864 0.73
865 0.77
866 0.79
867 0.8
868 0.82
869 0.77
870 0.7
871 0.65
872 0.56
873 0.53
874 0.43
875 0.34
876 0.26
877 0.19
878 0.17
879 0.17
880 0.16
881 0.1
882 0.14
883 0.15
884 0.15
885 0.15
886 0.15
887 0.16
888 0.19
889 0.19
890 0.14
891 0.14
892 0.15
893 0.2
894 0.26
895 0.26
896 0.25
897 0.26
898 0.28
899 0.27
900 0.26
901 0.22
902 0.17
903 0.14
904 0.12
905 0.11
906 0.08
907 0.09
908 0.09
909 0.07
910 0.06
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.06
915 0.05
916 0.05
917 0.05
918 0.06
919 0.06
920 0.07
921 0.08
922 0.08
923 0.07
924 0.07
925 0.07
926 0.07
927 0.07
928 0.06
929 0.05
930 0.06
931 0.07
932 0.07
933 0.08
934 0.1
935 0.11
936 0.12
937 0.13
938 0.15
939 0.15
940 0.17
941 0.21
942 0.27
943 0.29
944 0.32
945 0.3
946 0.28
947 0.29
948 0.3
949 0.29
950 0.24
951 0.23
952 0.27
953 0.29
954 0.3
955 0.31
956 0.34
957 0.39
958 0.42
959 0.47
960 0.43
961 0.45
962 0.47
963 0.44
964 0.42
965 0.32
966 0.3
967 0.25
968 0.23
969 0.21
970 0.22
971 0.22
972 0.21
973 0.32
974 0.3
975 0.33
976 0.39
977 0.39
978 0.38
979 0.47
980 0.53
981 0.51
982 0.57
983 0.59
984 0.52
985 0.51
986 0.5
987 0.43
988 0.35
989 0.3
990 0.22
991 0.25
992 0.29
993 0.28
994 0.32
995 0.36
996 0.45
997 0.48
998 0.56
999 0.57
1000 0.61
1001 0.64
1002 0.64
1003 0.67
1004 0.67
1005 0.64
1006 0.58
1007 0.54
1008 0.48
1009 0.49
1010 0.49
1011 0.46
1012 0.38
1013 0.35