Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4CIT6

Protein Details
Accession A0A2T4CIT6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
74-98SSTSSRQARGGRSRRGPRQGERGGTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-36RGASRGRRGRGRGGRGRGH
81-109ARGGRSRRGPRQGERGGTRHSAPRAPKPA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR000967  Znf_NFX1  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
Amino Acid Sequences MPEGEASQSQSQSQGASRGASRGRRGRGRGGRGRGHHGDSAQEAQGRSAPRVDGSENTPASTTALTSQQDATPSSTSSRQARGGRSRRGPRQGERGGTRHSAPRAPKPATTRRFGGHLTVDTEDTPSEGLSLSAEAPEFVPGQPILPRVNQRQSQASRAPRQPEAKLPKSTAADLGTRIHEDISNGNYECAVCTDEVLRKSHVWSCNVCWTVVHLKCAKKWYHNQMKQDAARPAETQPENSWRCPACNSKLSEEPGSYHCWCGKDINPRPSSTSLPPHSCGQTCSKPRGTCPHPCGLQCHAGPCPPCTLVGPTQTCFCGKNTSQKLCRETDYENGWSCQEICGDLLPCGEHFCPNPCHPGLCGDCDLKVDAKCYCGRVEKKIPCYERQEVRPSYSVEDGSWFEGSFSCLNPCERKFDCGTHSCSATCHAQDEQPAHCPYSPDLVTHCPCGKTPLESLLKAPRQSCQDPVPHCDKVCNKVLPCGHLCKAKCHTGDCGFCMEKIEISCRCGRTTSTSVCHQGDVQQPWCMRTCQANLSCGRHKCGERCCPGEKKAAERQAASRRKNRQPGDSVVEAEHICIRTCGRPLKCGSHDCQQMCHRGACASCPEAIFHEISCNCGRTVLQPPQPCGTHAPECRFNCPRRPACGHPPVEHNCHMDDISCPKCPFLVDKWCACGKEKLHSQPCHLQAAHCGRPCGKTLKCGLHKCRKLCHRPGECEDSGSSSQTCGQVCGKTKLFCDHACQSPCHGQTPCNESAPCTAKAIIACPCGQRQQEVKCLASTSNPTPSRPEIKCDDECLRLERNRRLAAALNIDPASHTNDHVPYSDTTLRLFKENLVWAEVQEREFRVLSKSPEEQRLRFKPMPSHQRQFLHALAEDYGLESKSEDIEPYRYVVIWKGAKFVSAPSKTLGQCLKIREAQAAEAAAAAAAASRAPTPPPAIVVDPFNAFLLVSPRFGLTVEDVEAAIRPDLASQSGLSFTTAFLPSDEVLIRATAHYSSFLTPAALEQALRSMKPRLEGTVKRQDIAGNVLLCHVDANEQVSRREDLTRSDASGWSAVAGRAATPVKKEEQGAAAAAGSGGGTGKRVLLGLRKKKVETPAKSWTAQLDGDVEC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.22
4 0.23
5 0.27
6 0.33
7 0.38
8 0.45
9 0.48
10 0.56
11 0.62
12 0.66
13 0.71
14 0.74
15 0.78
16 0.79
17 0.79
18 0.79
19 0.75
20 0.79
21 0.74
22 0.69
23 0.62
24 0.53
25 0.48
26 0.43
27 0.42
28 0.36
29 0.33
30 0.28
31 0.26
32 0.29
33 0.28
34 0.26
35 0.24
36 0.22
37 0.21
38 0.24
39 0.25
40 0.25
41 0.27
42 0.34
43 0.31
44 0.31
45 0.3
46 0.27
47 0.26
48 0.22
49 0.19
50 0.13
51 0.18
52 0.18
53 0.2
54 0.21
55 0.22
56 0.23
57 0.24
58 0.25
59 0.21
60 0.21
61 0.23
62 0.25
63 0.29
64 0.32
65 0.35
66 0.39
67 0.44
68 0.52
69 0.59
70 0.64
71 0.69
72 0.74
73 0.79
74 0.81
75 0.85
76 0.84
77 0.81
78 0.83
79 0.81
80 0.79
81 0.76
82 0.71
83 0.67
84 0.62
85 0.58
86 0.54
87 0.51
88 0.49
89 0.48
90 0.53
91 0.56
92 0.56
93 0.58
94 0.6
95 0.66
96 0.66
97 0.65
98 0.59
99 0.52
100 0.53
101 0.49
102 0.46
103 0.4
104 0.37
105 0.35
106 0.32
107 0.31
108 0.26
109 0.26
110 0.21
111 0.16
112 0.13
113 0.09
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.1
125 0.1
126 0.09
127 0.12
128 0.11
129 0.12
130 0.14
131 0.17
132 0.18
133 0.23
134 0.3
135 0.35
136 0.44
137 0.47
138 0.49
139 0.56
140 0.56
141 0.59
142 0.6
143 0.62
144 0.62
145 0.64
146 0.65
147 0.63
148 0.65
149 0.61
150 0.63
151 0.63
152 0.62
153 0.61
154 0.58
155 0.57
156 0.54
157 0.52
158 0.46
159 0.38
160 0.33
161 0.29
162 0.29
163 0.25
164 0.23
165 0.22
166 0.19
167 0.17
168 0.16
169 0.17
170 0.17
171 0.19
172 0.19
173 0.18
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.14
178 0.13
179 0.08
180 0.09
181 0.12
182 0.17
183 0.2
184 0.22
185 0.24
186 0.23
187 0.27
188 0.33
189 0.35
190 0.34
191 0.35
192 0.37
193 0.44
194 0.43
195 0.4
196 0.33
197 0.33
198 0.38
199 0.37
200 0.38
201 0.35
202 0.37
203 0.41
204 0.49
205 0.49
206 0.48
207 0.56
208 0.61
209 0.67
210 0.7
211 0.74
212 0.73
213 0.77
214 0.73
215 0.7
216 0.64
217 0.55
218 0.5
219 0.44
220 0.38
221 0.38
222 0.35
223 0.31
224 0.29
225 0.37
226 0.38
227 0.37
228 0.42
229 0.35
230 0.36
231 0.38
232 0.41
233 0.39
234 0.42
235 0.45
236 0.43
237 0.48
238 0.5
239 0.48
240 0.41
241 0.37
242 0.33
243 0.35
244 0.31
245 0.28
246 0.26
247 0.25
248 0.25
249 0.26
250 0.3
251 0.35
252 0.43
253 0.5
254 0.5
255 0.51
256 0.54
257 0.53
258 0.52
259 0.46
260 0.46
261 0.43
262 0.44
263 0.46
264 0.45
265 0.45
266 0.41
267 0.39
268 0.37
269 0.4
270 0.41
271 0.46
272 0.49
273 0.48
274 0.51
275 0.58
276 0.57
277 0.57
278 0.58
279 0.58
280 0.55
281 0.54
282 0.54
283 0.48
284 0.49
285 0.4
286 0.38
287 0.32
288 0.31
289 0.31
290 0.28
291 0.27
292 0.2
293 0.2
294 0.18
295 0.21
296 0.21
297 0.28
298 0.29
299 0.27
300 0.28
301 0.28
302 0.28
303 0.25
304 0.23
305 0.23
306 0.22
307 0.32
308 0.38
309 0.46
310 0.51
311 0.57
312 0.6
313 0.55
314 0.56
315 0.49
316 0.43
317 0.4
318 0.38
319 0.36
320 0.33
321 0.31
322 0.28
323 0.25
324 0.23
325 0.18
326 0.14
327 0.1
328 0.09
329 0.1
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.16
340 0.2
341 0.22
342 0.27
343 0.25
344 0.26
345 0.24
346 0.3
347 0.27
348 0.25
349 0.27
350 0.22
351 0.21
352 0.21
353 0.22
354 0.19
355 0.17
356 0.16
357 0.13
358 0.16
359 0.17
360 0.18
361 0.2
362 0.25
363 0.28
364 0.34
365 0.44
366 0.47
367 0.53
368 0.6
369 0.6
370 0.58
371 0.62
372 0.62
373 0.58
374 0.58
375 0.59
376 0.53
377 0.53
378 0.51
379 0.45
380 0.39
381 0.35
382 0.29
383 0.21
384 0.21
385 0.18
386 0.16
387 0.15
388 0.12
389 0.1
390 0.1
391 0.12
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.18
398 0.19
399 0.24
400 0.24
401 0.28
402 0.29
403 0.31
404 0.34
405 0.34
406 0.39
407 0.34
408 0.34
409 0.31
410 0.28
411 0.28
412 0.25
413 0.2
414 0.16
415 0.15
416 0.15
417 0.18
418 0.2
419 0.19
420 0.22
421 0.22
422 0.21
423 0.21
424 0.21
425 0.19
426 0.22
427 0.21
428 0.16
429 0.17
430 0.22
431 0.23
432 0.25
433 0.26
434 0.21
435 0.21
436 0.24
437 0.23
438 0.2
439 0.2
440 0.24
441 0.25
442 0.25
443 0.28
444 0.32
445 0.34
446 0.34
447 0.33
448 0.29
449 0.32
450 0.33
451 0.34
452 0.3
453 0.33
454 0.33
455 0.38
456 0.4
457 0.37
458 0.35
459 0.38
460 0.36
461 0.34
462 0.38
463 0.38
464 0.32
465 0.36
466 0.37
467 0.35
468 0.35
469 0.35
470 0.31
471 0.32
472 0.32
473 0.33
474 0.35
475 0.38
476 0.37
477 0.34
478 0.36
479 0.36
480 0.37
481 0.32
482 0.32
483 0.26
484 0.25
485 0.25
486 0.2
487 0.15
488 0.14
489 0.17
490 0.13
491 0.16
492 0.2
493 0.19
494 0.19
495 0.19
496 0.19
497 0.22
498 0.26
499 0.27
500 0.27
501 0.29
502 0.33
503 0.32
504 0.32
505 0.25
506 0.25
507 0.27
508 0.27
509 0.25
510 0.24
511 0.24
512 0.25
513 0.27
514 0.22
515 0.17
516 0.18
517 0.19
518 0.22
519 0.24
520 0.27
521 0.28
522 0.33
523 0.38
524 0.35
525 0.36
526 0.33
527 0.33
528 0.34
529 0.39
530 0.43
531 0.42
532 0.45
533 0.48
534 0.49
535 0.49
536 0.51
537 0.45
538 0.42
539 0.44
540 0.47
541 0.43
542 0.39
543 0.43
544 0.45
545 0.53
546 0.52
547 0.52
548 0.54
549 0.6
550 0.68
551 0.65
552 0.61
553 0.58
554 0.57
555 0.55
556 0.47
557 0.4
558 0.31
559 0.3
560 0.23
561 0.19
562 0.15
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.13
569 0.2
570 0.19
571 0.24
572 0.27
573 0.33
574 0.37
575 0.39
576 0.39
577 0.4
578 0.45
579 0.4
580 0.43
581 0.4
582 0.41
583 0.39
584 0.36
585 0.28
586 0.24
587 0.24
588 0.2
589 0.19
590 0.14
591 0.13
592 0.13
593 0.13
594 0.12
595 0.14
596 0.12
597 0.1
598 0.13
599 0.12
600 0.15
601 0.16
602 0.15
603 0.14
604 0.14
605 0.14
606 0.13
607 0.2
608 0.24
609 0.3
610 0.31
611 0.33
612 0.36
613 0.36
614 0.34
615 0.31
616 0.28
617 0.3
618 0.31
619 0.33
620 0.39
621 0.39
622 0.45
623 0.48
624 0.46
625 0.47
626 0.53
627 0.53
628 0.51
629 0.56
630 0.56
631 0.59
632 0.65
633 0.6
634 0.53
635 0.56
636 0.54
637 0.53
638 0.49
639 0.41
640 0.33
641 0.3
642 0.27
643 0.2
644 0.17
645 0.18
646 0.18
647 0.2
648 0.2
649 0.19
650 0.19
651 0.19
652 0.21
653 0.21
654 0.28
655 0.29
656 0.3
657 0.34
658 0.35
659 0.36
660 0.35
661 0.35
662 0.26
663 0.31
664 0.36
665 0.42
666 0.49
667 0.5
668 0.52
669 0.54
670 0.55
671 0.53
672 0.46
673 0.37
674 0.36
675 0.41
676 0.43
677 0.37
678 0.35
679 0.31
680 0.33
681 0.35
682 0.35
683 0.28
684 0.27
685 0.32
686 0.4
687 0.47
688 0.54
689 0.61
690 0.64
691 0.7
692 0.68
693 0.71
694 0.72
695 0.73
696 0.73
697 0.75
698 0.72
699 0.73
700 0.75
701 0.74
702 0.64
703 0.56
704 0.47
705 0.41
706 0.34
707 0.28
708 0.22
709 0.14
710 0.16
711 0.17
712 0.17
713 0.14
714 0.16
715 0.19
716 0.23
717 0.28
718 0.29
719 0.29
720 0.3
721 0.32
722 0.34
723 0.31
724 0.34
725 0.32
726 0.37
727 0.37
728 0.36
729 0.35
730 0.39
731 0.39
732 0.37
733 0.34
734 0.29
735 0.32
736 0.38
737 0.37
738 0.33
739 0.32
740 0.28
741 0.34
742 0.35
743 0.31
744 0.26
745 0.23
746 0.21
747 0.22
748 0.23
749 0.21
750 0.18
751 0.19
752 0.19
753 0.21
754 0.25
755 0.25
756 0.26
757 0.29
758 0.32
759 0.38
760 0.4
761 0.39
762 0.35
763 0.35
764 0.31
765 0.28
766 0.28
767 0.23
768 0.29
769 0.29
770 0.29
771 0.32
772 0.37
773 0.42
774 0.39
775 0.41
776 0.37
777 0.42
778 0.43
779 0.44
780 0.43
781 0.38
782 0.38
783 0.37
784 0.38
785 0.36
786 0.41
787 0.43
788 0.46
789 0.45
790 0.44
791 0.43
792 0.4
793 0.39
794 0.39
795 0.33
796 0.28
797 0.26
798 0.25
799 0.23
800 0.2
801 0.21
802 0.15
803 0.15
804 0.15
805 0.17
806 0.18
807 0.19
808 0.2
809 0.16
810 0.22
811 0.24
812 0.21
813 0.21
814 0.24
815 0.24
816 0.24
817 0.24
818 0.19
819 0.21
820 0.25
821 0.25
822 0.24
823 0.23
824 0.21
825 0.24
826 0.24
827 0.2
828 0.18
829 0.18
830 0.18
831 0.18
832 0.18
833 0.19
834 0.22
835 0.24
836 0.26
837 0.32
838 0.35
839 0.44
840 0.48
841 0.48
842 0.54
843 0.58
844 0.61
845 0.59
846 0.58
847 0.57
848 0.62
849 0.69
850 0.68
851 0.68
852 0.66
853 0.66
854 0.65
855 0.6
856 0.53
857 0.45
858 0.37
859 0.31
860 0.25
861 0.22
862 0.19
863 0.15
864 0.14
865 0.1
866 0.09
867 0.08
868 0.08
869 0.09
870 0.1
871 0.1
872 0.11
873 0.14
874 0.15
875 0.16
876 0.16
877 0.15
878 0.15
879 0.16
880 0.21
881 0.24
882 0.24
883 0.26
884 0.25
885 0.26
886 0.25
887 0.28
888 0.31
889 0.28
890 0.29
891 0.27
892 0.33
893 0.33
894 0.38
895 0.36
896 0.31
897 0.33
898 0.36
899 0.4
900 0.38
901 0.38
902 0.37
903 0.35
904 0.31
905 0.29
906 0.25
907 0.19
908 0.15
909 0.13
910 0.09
911 0.07
912 0.06
913 0.03
914 0.03
915 0.03
916 0.04
917 0.05
918 0.06
919 0.07
920 0.09
921 0.12
922 0.13
923 0.15
924 0.17
925 0.18
926 0.19
927 0.21
928 0.21
929 0.19
930 0.19
931 0.17
932 0.15
933 0.12
934 0.12
935 0.14
936 0.13
937 0.13
938 0.13
939 0.13
940 0.13
941 0.14
942 0.14
943 0.12
944 0.13
945 0.13
946 0.13
947 0.13
948 0.13
949 0.13
950 0.13
951 0.11
952 0.08
953 0.07
954 0.07
955 0.09
956 0.1
957 0.1
958 0.09
959 0.1
960 0.11
961 0.12
962 0.11
963 0.11
964 0.1
965 0.13
966 0.14
967 0.13
968 0.12
969 0.15
970 0.14
971 0.16
972 0.16
973 0.12
974 0.12
975 0.12
976 0.12
977 0.1
978 0.11
979 0.1
980 0.1
981 0.11
982 0.13
983 0.14
984 0.14
985 0.14
986 0.13
987 0.13
988 0.13
989 0.14
990 0.13
991 0.11
992 0.1
993 0.16
994 0.18
995 0.18
996 0.2
997 0.22
998 0.24
999 0.29
1000 0.31
1001 0.3
1002 0.38
1003 0.44
1004 0.51
1005 0.56
1006 0.56
1007 0.51
1008 0.5
1009 0.46
1010 0.39
1011 0.37
1012 0.33
1013 0.24
1014 0.22
1015 0.23
1016 0.22
1017 0.2
1018 0.18
1019 0.13
1020 0.09
1021 0.09
1022 0.13
1023 0.17
1024 0.19
1025 0.21
1026 0.24
1027 0.26
1028 0.26
1029 0.3
1030 0.27
1031 0.29
1032 0.33
1033 0.34
1034 0.34
1035 0.34
1036 0.33
1037 0.31
1038 0.3
1039 0.24
1040 0.19
1041 0.18
1042 0.15
1043 0.14
1044 0.13
1045 0.11
1046 0.15
1047 0.18
1048 0.19
1049 0.2
1050 0.25
1051 0.28
1052 0.31
1053 0.32
1054 0.31
1055 0.31
1056 0.31
1057 0.29
1058 0.25
1059 0.2
1060 0.17
1061 0.15
1062 0.11
1063 0.08
1064 0.06
1065 0.05
1066 0.05
1067 0.06
1068 0.06
1069 0.07
1070 0.08
1071 0.09
1072 0.11
1073 0.2
1074 0.31
1075 0.4
1076 0.49
1077 0.54
1078 0.56
1079 0.62
1080 0.7
1081 0.71
1082 0.68
1083 0.66
1084 0.67
1085 0.67
1086 0.66
1087 0.62
1088 0.54
1089 0.48
1090 0.4
1091 0.34