Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4BWJ8

Protein Details
Accession A0A2T4BWJ8    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
186-205RKASPPPKGNKNLKRKKAASBasic
310-335DSDSDADKKKKKTKKAVNGVSKPSQSHydrophilic
406-434LIVTKGKGFTKEKNKKKKGSFRGGPIDITHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
181-203KKPSFRKASPPPKGNKNLKRKKA
317-325KKKKKTKKA
361-374KKDAKGKGKPKTEP
412-427KGFTKEKNKKKKGSFR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13, mito 2, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSKPPAWLFSNNSNNNPSSKPNASSSSTSSSPAQQTTSNNNAMAPLKPLKPGASSDAEGQAASDQQPLAQPPAQLLDLVEQFLADNVFRAAHSAFKKQRAKKGWGELSSDAASNNGVTLVSVFEAWQKASKKTPADRDVDMDEDSSSSSSSSDSSSSSDSSSSESEDDSSSDSESESEADKKPSFRKASPPPKGNKNLKRKKAASPSSSSSSSSDSDSDSDSDSSSSSSSSDEQPRLKKQKVAAPESSSESDSSSSSSSSSSSSESSSSDESSSSDESSDSESEADAAAAAKVPLPESDSSSSSSSDSSDSDSDADKKKKKTKKAVNGVSKPSQSSSSSDSSATIDSLPNPPLPPNPNDLKKDAKGKGKPKTEPFSRVPRGIKVDPKFASNEYVPVSYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKKGSFRGGPIDITEKKSIYFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.53
3 0.5
4 0.44
5 0.42
6 0.41
7 0.41
8 0.41
9 0.45
10 0.46
11 0.46
12 0.46
13 0.45
14 0.41
15 0.4
16 0.37
17 0.37
18 0.36
19 0.35
20 0.32
21 0.3
22 0.33
23 0.39
24 0.44
25 0.41
26 0.38
27 0.36
28 0.37
29 0.34
30 0.3
31 0.28
32 0.27
33 0.25
34 0.28
35 0.29
36 0.28
37 0.29
38 0.31
39 0.3
40 0.3
41 0.29
42 0.29
43 0.3
44 0.29
45 0.26
46 0.23
47 0.18
48 0.15
49 0.14
50 0.13
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.14
55 0.18
56 0.19
57 0.18
58 0.17
59 0.2
60 0.2
61 0.18
62 0.16
63 0.16
64 0.14
65 0.14
66 0.13
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.15
79 0.18
80 0.27
81 0.33
82 0.42
83 0.52
84 0.57
85 0.66
86 0.67
87 0.72
88 0.7
89 0.75
90 0.74
91 0.68
92 0.66
93 0.57
94 0.54
95 0.47
96 0.39
97 0.28
98 0.2
99 0.17
100 0.11
101 0.1
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.15
114 0.17
115 0.19
116 0.25
117 0.31
118 0.35
119 0.41
120 0.51
121 0.52
122 0.53
123 0.52
124 0.5
125 0.46
126 0.41
127 0.34
128 0.25
129 0.18
130 0.14
131 0.13
132 0.1
133 0.08
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.11
166 0.15
167 0.16
168 0.2
169 0.23
170 0.31
171 0.34
172 0.34
173 0.41
174 0.49
175 0.58
176 0.64
177 0.68
178 0.66
179 0.7
180 0.77
181 0.78
182 0.77
183 0.77
184 0.78
185 0.79
186 0.82
187 0.77
188 0.76
189 0.76
190 0.75
191 0.68
192 0.64
193 0.6
194 0.55
195 0.52
196 0.44
197 0.35
198 0.29
199 0.25
200 0.21
201 0.17
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.1
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.07
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.08
217 0.12
218 0.16
219 0.19
220 0.24
221 0.28
222 0.37
223 0.43
224 0.44
225 0.44
226 0.43
227 0.45
228 0.48
229 0.5
230 0.45
231 0.41
232 0.41
233 0.4
234 0.38
235 0.33
236 0.25
237 0.2
238 0.17
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.09
283 0.09
284 0.13
285 0.16
286 0.16
287 0.18
288 0.19
289 0.2
290 0.18
291 0.17
292 0.14
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.12
299 0.14
300 0.18
301 0.24
302 0.32
303 0.35
304 0.44
305 0.53
306 0.6
307 0.69
308 0.75
309 0.78
310 0.82
311 0.86
312 0.88
313 0.89
314 0.89
315 0.85
316 0.81
317 0.71
318 0.62
319 0.52
320 0.45
321 0.36
322 0.31
323 0.29
324 0.26
325 0.26
326 0.25
327 0.24
328 0.22
329 0.21
330 0.18
331 0.14
332 0.12
333 0.12
334 0.15
335 0.16
336 0.16
337 0.17
338 0.18
339 0.23
340 0.26
341 0.27
342 0.31
343 0.37
344 0.43
345 0.46
346 0.49
347 0.51
348 0.52
349 0.58
350 0.58
351 0.6
352 0.61
353 0.66
354 0.72
355 0.74
356 0.77
357 0.76
358 0.79
359 0.77
360 0.75
361 0.73
362 0.74
363 0.71
364 0.7
365 0.65
366 0.62
367 0.62
368 0.61
369 0.64
370 0.58
371 0.6
372 0.54
373 0.53
374 0.49
375 0.43
376 0.42
377 0.34
378 0.33
379 0.27
380 0.27
381 0.25
382 0.24
383 0.27
384 0.25
385 0.27
386 0.26
387 0.27
388 0.29
389 0.3
390 0.3
391 0.29
392 0.27
393 0.31
394 0.32
395 0.28
396 0.28
397 0.3
398 0.3
399 0.35
400 0.37
401 0.41
402 0.49
403 0.59
404 0.68
405 0.75
406 0.82
407 0.85
408 0.91
409 0.92
410 0.91
411 0.92
412 0.9
413 0.89
414 0.89
415 0.82
416 0.72
417 0.65
418 0.62
419 0.55
420 0.52
421 0.45
422 0.36