FuNGI

A0A2T4CGW7

Protein Details

Accession

A0A2T4CGW7

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-60	PHPPSHGPPRPQKANPLRPLRKKPNPLVASSRKPPPKPSRPPANGAPSS	Hydrophilic
193-215	AKEVVAKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
14-53	PPSHGPPRPQKANPLRPLRKKPNPLVASSRKPPPKPSRPP
198-208	AKRPKKQKEEK
505-513	KKGKSLKRP
670-676	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSDPPGNPSGPPHPPSHGPPRPQKANPLRPLRKKPNPLVASSRKPPPKPSRPPANGAPSSSAQGAANGAKPTAEEIRNQYGGWSEPPPNYPYNDIPIMTTKKALLDGIRYHLMKFSQTKLGEKPIDPTDQEEFARPVTLHRRDARQPPPGRTVKVEEPERPPVDEQEAERLAQAKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVVAKRPKKQKEEKTMFNRAPKTSAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDGSVFRMIPLEKCYKFNSKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKKAGLHDLEATRRLLYGRGQMIKTESDTFRAASREEKIEHDELDVSGDEFQDDDETPHFEPQEDEDTKESKTRIRREQLGANLFGEADEQEVDKELQEQLREELERQKYGKTTKKALIKRDREEIYESDDSETNPWSSSSEDDSSDEEEEGAKEEEKKEGDSKDAQSDKDKAKLQSAKGSTTPQGKQKLSDMAKKGKSLKRPGSPTLSESSGNESTRKKQKKVTAAALGSRPGTPGLSQTTVRRPKITAGSGSDGEATAGEMSDGAMQKKKIKLVGSSRGTPSASRAGSPNPAATGASSPSSGGLIEPWEILEKIPADGITIGDLINLFQGRVGDGSGRMPRQEWIGLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.51
3	0.57
4	0.57
5	0.58
6	0.65
7	0.72
8	0.76
9	0.75
10	0.79
11	0.79
12	0.81
13	0.82
14	0.83
15	0.83
16	0.84
17	0.92
18	0.92
19	0.91
20	0.9
21	0.9
22	0.9
23	0.83
24	0.79
25	0.78
26	0.77
27	0.75
28	0.71
29	0.72
30	0.7
31	0.69
32	0.74
33	0.75
34	0.76
35	0.78
36	0.82
37	0.84
38	0.81
39	0.84
40	0.82
41	0.81
42	0.74
43	0.66
44	0.61
45	0.51
46	0.47
47	0.41
48	0.33
49	0.23
50	0.2
51	0.2
52	0.17
53	0.19
54	0.17
55	0.17
56	0.15
57	0.15
58	0.18
59	0.22
60	0.22
61	0.22
62	0.27
63	0.34
64	0.36
65	0.35
66	0.32
67	0.28
68	0.28
69	0.27
70	0.25
71	0.23
72	0.24
73	0.28
74	0.31
75	0.31
76	0.32
77	0.34
78	0.32
79	0.34
80	0.34
81	0.31
82	0.29
83	0.34
84	0.36
85	0.32
86	0.31
87	0.26
88	0.24
89	0.25
90	0.25
91	0.2
92	0.21
93	0.23
94	0.27
95	0.32
96	0.31
97	0.3
98	0.31
99	0.3
100	0.29
101	0.3
102	0.29
103	0.31
104	0.33
105	0.37
106	0.37
107	0.45
108	0.44
109	0.41
110	0.42
111	0.38
112	0.4
113	0.36
114	0.37
115	0.31
116	0.3
117	0.3
118	0.28
119	0.25
120	0.21
121	0.23
122	0.19
123	0.21
124	0.28
125	0.33
126	0.38
127	0.41
128	0.47
129	0.52
130	0.62
131	0.64
132	0.64
133	0.65
134	0.64
135	0.69
136	0.68
137	0.63
138	0.58
139	0.57
140	0.54
141	0.55
142	0.55
143	0.51
144	0.51
145	0.57
146	0.54
147	0.5
148	0.44
149	0.38
150	0.37
151	0.34
152	0.3
153	0.28
154	0.28
155	0.26
156	0.25
157	0.24
158	0.2
159	0.2
160	0.2
161	0.15
162	0.16
163	0.24
164	0.26
165	0.27
166	0.29
167	0.28
168	0.3
169	0.3
170	0.29
171	0.24
172	0.22
173	0.2
174	0.2
175	0.2
176	0.18
177	0.14
178	0.14
179	0.13
180	0.13
181	0.18
182	0.17
183	0.25
184	0.33
185	0.36
186	0.43
187	0.52
188	0.59
189	0.64
190	0.73
191	0.74
192	0.77
193	0.81
194	0.84
195	0.82
196	0.84
197	0.79
198	0.76
199	0.71
200	0.61
201	0.55
202	0.48
203	0.47
204	0.45
205	0.49
206	0.45
207	0.42
208	0.43
209	0.49
210	0.5
211	0.47
212	0.42
213	0.36
214	0.34
215	0.33
216	0.32
217	0.25
218	0.23
219	0.2
220	0.17
221	0.15
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.13
227	0.13
228	0.12
229	0.12
230	0.12
231	0.12
232	0.11
233	0.09
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.05
249	0.04
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.07
256	0.07
257	0.08
258	0.13
259	0.19
260	0.19
261	0.22
262	0.26
263	0.33
264	0.35
265	0.42
266	0.47
267	0.47
268	0.53
269	0.58
270	0.59
271	0.51
272	0.52
273	0.46
274	0.43
275	0.39
276	0.31
277	0.24
278	0.21
279	0.21
280	0.18
281	0.18
282	0.13
283	0.1
284	0.1
285	0.11
286	0.1
287	0.11
288	0.13
289	0.16
290	0.2
291	0.2
292	0.21
293	0.22
294	0.25
295	0.28
296	0.26
297	0.27
298	0.23
299	0.22
300	0.22
301	0.24
302	0.21
303	0.17
304	0.19
305	0.16
306	0.17
307	0.18
308	0.18
309	0.14
310	0.14
311	0.14
312	0.12
313	0.11
314	0.15
315	0.17
316	0.2
317	0.2
318	0.21
319	0.22
320	0.21
321	0.21
322	0.2
323	0.16
324	0.15
325	0.15
326	0.15
327	0.15
328	0.16
329	0.15
330	0.14
331	0.15
332	0.16
333	0.16
334	0.18
335	0.2
336	0.2
337	0.2
338	0.18
339	0.16
340	0.13
341	0.13
342	0.11
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.06
352	0.06
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.1
357	0.09
358	0.1
359	0.11
360	0.18
361	0.17
362	0.18
363	0.19
364	0.2
365	0.2
366	0.22
367	0.21
368	0.18
369	0.25
370	0.32
371	0.39
372	0.44
373	0.5
374	0.51
375	0.56
376	0.58
377	0.54
378	0.47
379	0.38
380	0.32
381	0.26
382	0.21
383	0.16
384	0.09
385	0.05
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.08
394	0.09
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.13
399	0.14
400	0.14
401	0.21
402	0.22
403	0.25
404	0.25
405	0.26
406	0.28
407	0.35
408	0.42
409	0.39
410	0.43
411	0.46
412	0.54
413	0.58
414	0.64
415	0.67
416	0.67
417	0.66
418	0.68
419	0.63
420	0.56
421	0.54
422	0.45
423	0.42
424	0.34
425	0.31
426	0.25
427	0.24
428	0.22
429	0.19
430	0.19
431	0.12
432	0.11
433	0.11
434	0.09
435	0.1
436	0.11
437	0.14
438	0.14
439	0.15
440	0.16
441	0.17
442	0.18
443	0.18
444	0.16
445	0.12
446	0.11
447	0.1
448	0.11
449	0.1
450	0.09
451	0.11
452	0.12
453	0.15
454	0.15
455	0.18
456	0.2
457	0.2
458	0.23
459	0.26
460	0.28
461	0.33
462	0.35
463	0.34
464	0.34
465	0.39
466	0.38
467	0.4
468	0.43
469	0.36
470	0.42
471	0.46
472	0.44
473	0.47
474	0.47
475	0.43
476	0.4
477	0.43
478	0.38
479	0.4
480	0.41
481	0.39
482	0.45
483	0.43
484	0.42
485	0.43
486	0.48
487	0.46
488	0.49
489	0.49
490	0.5
491	0.52
492	0.56
493	0.61
494	0.57
495	0.61
496	0.64
497	0.66
498	0.66
499	0.69
500	0.69
501	0.68
502	0.64
503	0.58
504	0.52
505	0.46
506	0.38
507	0.32
508	0.33
509	0.3
510	0.28
511	0.29
512	0.29
513	0.34
514	0.44
515	0.52
516	0.5
517	0.53
518	0.61
519	0.67
520	0.73
521	0.73
522	0.71
523	0.66
524	0.67
525	0.61
526	0.54
527	0.45
528	0.36
529	0.28
530	0.2
531	0.17
532	0.13
533	0.14
534	0.16
535	0.19
536	0.2
537	0.25
538	0.35
539	0.43
540	0.45
541	0.44
542	0.41
543	0.44
544	0.5
545	0.49
546	0.44
547	0.4
548	0.43
549	0.41
550	0.4
551	0.34
552	0.26
553	0.22
554	0.16
555	0.12
556	0.07
557	0.06
558	0.05
559	0.04
560	0.05
561	0.09
562	0.1
563	0.12
564	0.16
565	0.18
566	0.25
567	0.29
568	0.33
569	0.34
570	0.36
571	0.42
572	0.48
573	0.56
574	0.56
575	0.57
576	0.56
577	0.55
578	0.53
579	0.44
580	0.39
581	0.37
582	0.32
583	0.28
584	0.28
585	0.28
586	0.32
587	0.34
588	0.31
589	0.24
590	0.24
591	0.23
592	0.22
593	0.2
594	0.16
595	0.16
596	0.14
597	0.13
598	0.13
599	0.13
600	0.12
601	0.09
602	0.08
603	0.09
604	0.09
605	0.09
606	0.09
607	0.11
608	0.12
609	0.12
610	0.14
611	0.13
612	0.13
613	0.14
614	0.13
615	0.13
616	0.13
617	0.13
618	0.11
619	0.1
620	0.09
621	0.09
622	0.09
623	0.07
624	0.1
625	0.1
626	0.08
627	0.09
628	0.1
629	0.1
630	0.11
631	0.12
632	0.1
633	0.11
634	0.17
635	0.23
636	0.25
637	0.25
638	0.26
639	0.26
640	0.29
641	0.3
642	0.26
643	0.26
644	0.3
645	0.35
646	0.35
647	0.35
648	0.32
649	0.31
650	0.29
651	0.27
652	0.23
653	0.25
654	0.33
655	0.4
656	0.47

A0A2T4CGW7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer