Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4CD00

Protein Details
Accession A0A2T4CD00    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
136-155ESEKWDKRMKKKGAHRDNNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-147KKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MEVAEESQPVKSTEKPQPAEAVQESQPAKDAKVSQPVQPAAEPTAEESKKSEEDAAAKAQDRMARFKALQARAKKSSETNFKEATLESQRLSTNPSELTALHRRHAIASHKLLKADTEEAGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMKKKGAHRDNNAFQDYHQEANKSYKRQLRNVSVDLEKYEKQKMAAIEKAAASGGLDIVETEDGELIAVDKDGTFYSTADTTSFAQNKPDKEAVDRLVKDLQRAEEVRLKKRKERMAQNGEDGDVTYINEKNKQFNQKLSRFYNKYTAEIRDSFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.48
3 0.49
4 0.53
5 0.51
6 0.52
7 0.47
8 0.43
9 0.34
10 0.38
11 0.36
12 0.3
13 0.34
14 0.28
15 0.26
16 0.26
17 0.3
18 0.28
19 0.37
20 0.39
21 0.39
22 0.46
23 0.47
24 0.44
25 0.4
26 0.37
27 0.29
28 0.28
29 0.23
30 0.19
31 0.27
32 0.25
33 0.25
34 0.24
35 0.27
36 0.27
37 0.28
38 0.26
39 0.19
40 0.22
41 0.25
42 0.27
43 0.25
44 0.25
45 0.25
46 0.25
47 0.26
48 0.25
49 0.28
50 0.26
51 0.28
52 0.27
53 0.32
54 0.39
55 0.43
56 0.48
57 0.5
58 0.55
59 0.56
60 0.58
61 0.55
62 0.52
63 0.53
64 0.56
65 0.54
66 0.52
67 0.48
68 0.47
69 0.46
70 0.4
71 0.37
72 0.32
73 0.27
74 0.22
75 0.22
76 0.22
77 0.21
78 0.24
79 0.19
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.14
84 0.13
85 0.2
86 0.25
87 0.26
88 0.25
89 0.26
90 0.26
91 0.26
92 0.3
93 0.29
94 0.28
95 0.33
96 0.4
97 0.39
98 0.39
99 0.38
100 0.34
101 0.31
102 0.26
103 0.19
104 0.12
105 0.11
106 0.11
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.13
116 0.14
117 0.18
118 0.2
119 0.24
120 0.28
121 0.28
122 0.26
123 0.27
124 0.33
125 0.29
126 0.28
127 0.3
128 0.31
129 0.39
130 0.49
131 0.53
132 0.55
133 0.64
134 0.72
135 0.77
136 0.8
137 0.79
138 0.77
139 0.75
140 0.71
141 0.63
142 0.52
143 0.41
144 0.38
145 0.33
146 0.27
147 0.22
148 0.18
149 0.17
150 0.26
151 0.3
152 0.26
153 0.31
154 0.35
155 0.39
156 0.45
157 0.52
158 0.51
159 0.53
160 0.53
161 0.5
162 0.45
163 0.41
164 0.36
165 0.32
166 0.26
167 0.22
168 0.22
169 0.19
170 0.18
171 0.21
172 0.22
173 0.24
174 0.25
175 0.23
176 0.23
177 0.22
178 0.21
179 0.18
180 0.15
181 0.1
182 0.07
183 0.06
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.11
211 0.17
212 0.2
213 0.19
214 0.26
215 0.3
216 0.31
217 0.36
218 0.38
219 0.32
220 0.33
221 0.39
222 0.36
223 0.41
224 0.4
225 0.36
226 0.4
227 0.4
228 0.38
229 0.36
230 0.33
231 0.3
232 0.31
233 0.33
234 0.33
235 0.38
236 0.46
237 0.51
238 0.54
239 0.56
240 0.63
241 0.69
242 0.71
243 0.76
244 0.78
245 0.79
246 0.79
247 0.78
248 0.7
249 0.61
250 0.51
251 0.41
252 0.31
253 0.21
254 0.16
255 0.12
256 0.14
257 0.16
258 0.22
259 0.23
260 0.3
261 0.38
262 0.48
263 0.5
264 0.57
265 0.65
266 0.66
267 0.73
268 0.73
269 0.76
270 0.7
271 0.7
272 0.7
273 0.62
274 0.61
275 0.57
276 0.54
277 0.5
278 0.48
279 0.47
280 0.44
281 0.43
282 0.38