Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4CCS1

Protein Details
Accession A0A2T4CCS1    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
939-1005TDSETGEKVKRKRKPAPRAPAGEGKPKRSKKKKAAADEDEGSEDESHTKKRRRLTKRESSKFKSAEIBasic
1076-1098DIDAPRTQPKRTRRGRVIAESDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
869-911EKNKEKIQAAKELREAELRRREEERQAALEKERERQEKIRKER
946-973KVKRKRKPAPRAPAGEGKPKRSKKKKAA
987-997KKRRRLTKRES
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.333, cyto 6, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031101  Ctr9  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0043231  C:intracellular membrane-bounded organelle  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF13374  TPR_10  
PF13174  TPR_6  
PF13181  TPR_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
PS50293  TPR_REGION  
Amino Acid Sequences MLIRGGNAIQSSNPRDKVSMICCLCWMYLWKSREAPRVAPDGVPATEAKTKEYYLQLATSSLNDAARLNPSFPPIFLARGVLLLLRASLQGPSKTAGGLGTEKSELLKNAAKAFDDALRVSQGKNVLALMGKARTLFSMHKYPEALAAYQDVLQKRPDLVDPDPRIGIGCCFWQLGFKEDAKVAWERCLEINPDSKIANILLGLYYLDASGHVPVNSDEFLKLYKTAMIEYTQKAFKLDKEVPITCATFASYFLSRKAWENADKLAHKAIQYTDVNAVASDGWYLLARKAHYNGDLERASDYYRRADDARGGTETGYLPAKFGVAQLSVIKNDLGEAKLRLEKIIQQSKNHEAMILLGTIYAEEIFTSQNNDNKEDRSAEMKKAIALLEGVRNSWKDPKKALSPDASVLLNLARLYETDSPDKALQCLQQVEQLEIDQIPESERPTDVPEAEVQAALRKFLPPQLLNNIGCFHFQAEKFDLASELFEAALGACMRAGEKDPTMDTDALVTTISFNLGRSYEARGLTDKAVEVYEGLLNRHDDYTDARTRLAYIKLRKNPNKEGPDAVAKLYQENTADLEVRALYGWYLGKVHSRKRPANIAEDHEFRHYKHTLQNYDKHDRYALVGMGNLYLVQAREMRRETEQEKQKRSATYSKAVEFFEKALSLDPKNAYAAQGIAIALVEDKKDYKTALTIFNQVKDTVKDAHLYVNLGHIYAELKQFSKAIEHYEIALSKEGKANDPVILSCLGRTWLNRGRADRDVDSYIKALECAKKALEVAPDQIHYQFNVAFVQIQLVTMIQALPENRRTAEQLEDASQGLEAAIESLDKIAAHPQTPYPKHDVEQRANMARNTLRKQLERALGKQKEWEEKNKEKIQAAKELREAELRRREEERQAALEKERERQEKIRKEREAIAARDRLLAEQRAEEERARLEAEMTTDSETGEKVKRKRKPAPRAPAGEGKPKRSKKKKAAADEDEGSEDESHTKKRRRLTKRESSKFKSAEIVVDSDEEANDNDDEDALERAERNLERDETPLSEANEDDVADKMDVDNEEQQREDEGERRGDGNRDDEDEDDIDAPRTQPKRTRRGRVIAESDDEDEDAEPSAKADDGAAAGGDDDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.4
4 0.44
5 0.41
6 0.45
7 0.39
8 0.36
9 0.36
10 0.36
11 0.33
12 0.28
13 0.29
14 0.25
15 0.32
16 0.34
17 0.37
18 0.43
19 0.5
20 0.57
21 0.57
22 0.55
23 0.52
24 0.57
25 0.53
26 0.46
27 0.42
28 0.37
29 0.33
30 0.29
31 0.24
32 0.21
33 0.25
34 0.25
35 0.25
36 0.24
37 0.25
38 0.28
39 0.31
40 0.31
41 0.28
42 0.29
43 0.27
44 0.25
45 0.25
46 0.21
47 0.2
48 0.19
49 0.16
50 0.15
51 0.15
52 0.16
53 0.21
54 0.21
55 0.21
56 0.21
57 0.25
58 0.25
59 0.24
60 0.27
61 0.23
62 0.24
63 0.22
64 0.23
65 0.18
66 0.18
67 0.18
68 0.13
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.11
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.19
80 0.19
81 0.18
82 0.18
83 0.16
84 0.15
85 0.16
86 0.16
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.18
91 0.2
92 0.17
93 0.19
94 0.23
95 0.23
96 0.28
97 0.29
98 0.29
99 0.27
100 0.29
101 0.27
102 0.25
103 0.23
104 0.2
105 0.22
106 0.22
107 0.22
108 0.23
109 0.22
110 0.2
111 0.2
112 0.19
113 0.16
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.15
121 0.14
122 0.17
123 0.19
124 0.22
125 0.29
126 0.3
127 0.34
128 0.34
129 0.34
130 0.36
131 0.35
132 0.3
133 0.21
134 0.21
135 0.19
136 0.21
137 0.25
138 0.2
139 0.19
140 0.2
141 0.21
142 0.21
143 0.22
144 0.22
145 0.23
146 0.26
147 0.35
148 0.37
149 0.39
150 0.38
151 0.36
152 0.33
153 0.29
154 0.26
155 0.17
156 0.15
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.17
161 0.18
162 0.2
163 0.23
164 0.22
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.22
169 0.26
170 0.23
171 0.24
172 0.24
173 0.24
174 0.24
175 0.27
176 0.27
177 0.26
178 0.31
179 0.27
180 0.28
181 0.27
182 0.25
183 0.24
184 0.21
185 0.18
186 0.11
187 0.1
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.07
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.11
207 0.12
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.13
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.16
216 0.2
217 0.21
218 0.25
219 0.25
220 0.24
221 0.25
222 0.25
223 0.25
224 0.28
225 0.3
226 0.32
227 0.37
228 0.38
229 0.39
230 0.4
231 0.39
232 0.31
233 0.27
234 0.21
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.16
240 0.17
241 0.19
242 0.19
243 0.22
244 0.26
245 0.28
246 0.3
247 0.32
248 0.35
249 0.39
250 0.39
251 0.38
252 0.37
253 0.33
254 0.28
255 0.28
256 0.24
257 0.25
258 0.24
259 0.24
260 0.23
261 0.22
262 0.21
263 0.18
264 0.18
265 0.1
266 0.1
267 0.08
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.11
274 0.13
275 0.15
276 0.18
277 0.21
278 0.23
279 0.25
280 0.25
281 0.28
282 0.27
283 0.25
284 0.23
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.2
289 0.18
290 0.18
291 0.2
292 0.21
293 0.21
294 0.26
295 0.26
296 0.27
297 0.24
298 0.24
299 0.21
300 0.22
301 0.2
302 0.16
303 0.16
304 0.13
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.08
312 0.09
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.14
317 0.13
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.13
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.21
330 0.28
331 0.37
332 0.37
333 0.38
334 0.43
335 0.49
336 0.51
337 0.45
338 0.36
339 0.26
340 0.24
341 0.22
342 0.16
343 0.1
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.09
355 0.11
356 0.14
357 0.16
358 0.2
359 0.21
360 0.22
361 0.24
362 0.23
363 0.22
364 0.26
365 0.28
366 0.26
367 0.28
368 0.27
369 0.25
370 0.25
371 0.23
372 0.16
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.14
380 0.15
381 0.23
382 0.26
383 0.26
384 0.29
385 0.34
386 0.41
387 0.45
388 0.48
389 0.44
390 0.41
391 0.39
392 0.37
393 0.32
394 0.24
395 0.19
396 0.15
397 0.11
398 0.09
399 0.07
400 0.05
401 0.05
402 0.09
403 0.13
404 0.15
405 0.17
406 0.17
407 0.19
408 0.21
409 0.22
410 0.19
411 0.17
412 0.17
413 0.17
414 0.19
415 0.17
416 0.18
417 0.18
418 0.18
419 0.16
420 0.14
421 0.12
422 0.1
423 0.1
424 0.07
425 0.06
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.12
433 0.14
434 0.12
435 0.13
436 0.12
437 0.14
438 0.14
439 0.13
440 0.1
441 0.13
442 0.13
443 0.12
444 0.12
445 0.1
446 0.11
447 0.14
448 0.19
449 0.16
450 0.19
451 0.23
452 0.29
453 0.29
454 0.29
455 0.28
456 0.23
457 0.22
458 0.19
459 0.15
460 0.14
461 0.14
462 0.16
463 0.17
464 0.17
465 0.17
466 0.17
467 0.16
468 0.12
469 0.12
470 0.08
471 0.06
472 0.05
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.05
482 0.05
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.09
488 0.11
489 0.14
490 0.13
491 0.11
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.09
496 0.07
497 0.05
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.06
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.11
507 0.14
508 0.15
509 0.15
510 0.16
511 0.17
512 0.17
513 0.16
514 0.13
515 0.1
516 0.09
517 0.08
518 0.07
519 0.06
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.09
526 0.09
527 0.08
528 0.07
529 0.09
530 0.15
531 0.18
532 0.18
533 0.18
534 0.18
535 0.19
536 0.21
537 0.23
538 0.23
539 0.27
540 0.35
541 0.42
542 0.52
543 0.57
544 0.61
545 0.64
546 0.68
547 0.65
548 0.58
549 0.53
550 0.45
551 0.44
552 0.38
553 0.3
554 0.23
555 0.18
556 0.17
557 0.16
558 0.14
559 0.1
560 0.1
561 0.1
562 0.09
563 0.09
564 0.08
565 0.08
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.04
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.12
577 0.16
578 0.22
579 0.28
580 0.35
581 0.39
582 0.42
583 0.5
584 0.47
585 0.5
586 0.48
587 0.46
588 0.43
589 0.41
590 0.38
591 0.34
592 0.32
593 0.25
594 0.27
595 0.23
596 0.21
597 0.24
598 0.3
599 0.34
600 0.39
601 0.46
602 0.48
603 0.55
604 0.53
605 0.49
606 0.42
607 0.35
608 0.31
609 0.26
610 0.2
611 0.12
612 0.11
613 0.1
614 0.1
615 0.09
616 0.07
617 0.05
618 0.05
619 0.04
620 0.05
621 0.08
622 0.09
623 0.13
624 0.15
625 0.17
626 0.18
627 0.22
628 0.24
629 0.3
630 0.38
631 0.42
632 0.46
633 0.49
634 0.51
635 0.49
636 0.51
637 0.5
638 0.45
639 0.45
640 0.44
641 0.42
642 0.41
643 0.39
644 0.36
645 0.29
646 0.25
647 0.18
648 0.14
649 0.12
650 0.12
651 0.14
652 0.13
653 0.16
654 0.15
655 0.15
656 0.16
657 0.16
658 0.14
659 0.12
660 0.11
661 0.08
662 0.08
663 0.07
664 0.06
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.05
669 0.04
670 0.04
671 0.05
672 0.06
673 0.07
674 0.07
675 0.08
676 0.11
677 0.13
678 0.19
679 0.2
680 0.27
681 0.27
682 0.3
683 0.3
684 0.28
685 0.27
686 0.22
687 0.23
688 0.18
689 0.18
690 0.16
691 0.16
692 0.18
693 0.17
694 0.17
695 0.14
696 0.15
697 0.14
698 0.12
699 0.12
700 0.09
701 0.09
702 0.1
703 0.12
704 0.1
705 0.1
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.13
710 0.12
711 0.15
712 0.17
713 0.16
714 0.17
715 0.18
716 0.19
717 0.17
718 0.19
719 0.15
720 0.14
721 0.17
722 0.17
723 0.17
724 0.18
725 0.18
726 0.16
727 0.16
728 0.15
729 0.13
730 0.14
731 0.12
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.1
736 0.11
737 0.16
738 0.22
739 0.29
740 0.33
741 0.35
742 0.39
743 0.42
744 0.46
745 0.4
746 0.37
747 0.34
748 0.31
749 0.29
750 0.25
751 0.21
752 0.17
753 0.16
754 0.15
755 0.16
756 0.16
757 0.17
758 0.17
759 0.17
760 0.18
761 0.2
762 0.2
763 0.17
764 0.2
765 0.2
766 0.2
767 0.2
768 0.21
769 0.19
770 0.16
771 0.16
772 0.12
773 0.11
774 0.11
775 0.1
776 0.09
777 0.08
778 0.1
779 0.08
780 0.08
781 0.07
782 0.06
783 0.06
784 0.06
785 0.06
786 0.04
787 0.06
788 0.07
789 0.11
790 0.14
791 0.15
792 0.16
793 0.18
794 0.2
795 0.2
796 0.22
797 0.21
798 0.2
799 0.21
800 0.21
801 0.2
802 0.18
803 0.15
804 0.12
805 0.09
806 0.07
807 0.04
808 0.04
809 0.04
810 0.03
811 0.03
812 0.04
813 0.04
814 0.04
815 0.05
816 0.09
817 0.11
818 0.12
819 0.13
820 0.18
821 0.27
822 0.3
823 0.34
824 0.35
825 0.35
826 0.37
827 0.44
828 0.49
829 0.45
830 0.5
831 0.51
832 0.51
833 0.52
834 0.51
835 0.46
836 0.42
837 0.44
838 0.4
839 0.43
840 0.42
841 0.41
842 0.45
843 0.48
844 0.52
845 0.5
846 0.52
847 0.54
848 0.53
849 0.52
850 0.54
851 0.52
852 0.53
853 0.52
854 0.56
855 0.54
856 0.59
857 0.67
858 0.68
859 0.67
860 0.62
861 0.64
862 0.59
863 0.6
864 0.56
865 0.52
866 0.49
867 0.47
868 0.44
869 0.44
870 0.42
871 0.41
872 0.46
873 0.44
874 0.43
875 0.45
876 0.47
877 0.48
878 0.53
879 0.48
880 0.45
881 0.45
882 0.44
883 0.43
884 0.46
885 0.4
886 0.4
887 0.44
888 0.42
889 0.45
890 0.51
891 0.58
892 0.62
893 0.7
894 0.73
895 0.7
896 0.7
897 0.72
898 0.72
899 0.7
900 0.64
901 0.61
902 0.56
903 0.52
904 0.5
905 0.44
906 0.36
907 0.33
908 0.31
909 0.25
910 0.23
911 0.25
912 0.25
913 0.27
914 0.26
915 0.24
916 0.21
917 0.22
918 0.2
919 0.18
920 0.15
921 0.14
922 0.15
923 0.15
924 0.15
925 0.15
926 0.14
927 0.14
928 0.14
929 0.13
930 0.14
931 0.19
932 0.25
933 0.32
934 0.41
935 0.49
936 0.59
937 0.69
938 0.76
939 0.81
940 0.84
941 0.87
942 0.88
943 0.87
944 0.83
945 0.82
946 0.76
947 0.75
948 0.69
949 0.67
950 0.68
951 0.7
952 0.75
953 0.76
954 0.83
955 0.83
956 0.88
957 0.89
958 0.9
959 0.91
960 0.87
961 0.84
962 0.76
963 0.67
964 0.58
965 0.48
966 0.39
967 0.29
968 0.22
969 0.18
970 0.18
971 0.23
972 0.31
973 0.38
974 0.42
975 0.51
976 0.61
977 0.68
978 0.77
979 0.8
980 0.82
981 0.86
982 0.91
983 0.92
984 0.89
985 0.89
986 0.8
987 0.71
988 0.66
989 0.56
990 0.51
991 0.43
992 0.37
993 0.28
994 0.26
995 0.25
996 0.19
997 0.17
998 0.13
999 0.11
1000 0.11
1001 0.1
1002 0.1
1003 0.09
1004 0.09
1005 0.09
1006 0.09
1007 0.1
1008 0.08
1009 0.09
1010 0.09
1011 0.1
1012 0.17
1013 0.17
1014 0.19
1015 0.23
1016 0.26
1017 0.26
1018 0.28
1019 0.3
1020 0.26
1021 0.29
1022 0.3
1023 0.26
1024 0.25
1025 0.23
1026 0.23
1027 0.21
1028 0.19
1029 0.16
1030 0.13
1031 0.13
1032 0.12
1033 0.12
1034 0.1
1035 0.12
1036 0.13
1037 0.15
1038 0.22
1039 0.24
1040 0.26
1041 0.26
1042 0.26
1043 0.25
1044 0.27
1045 0.27
1046 0.24
1047 0.26
1048 0.27
1049 0.29
1050 0.3
1051 0.31
1052 0.34
1053 0.34
1054 0.34
1055 0.32
1056 0.32
1057 0.32
1058 0.31
1059 0.31
1060 0.27
1061 0.26
1062 0.21
1063 0.19
1064 0.17
1065 0.17
1066 0.17
1067 0.22
1068 0.24
1069 0.29
1070 0.36
1071 0.45
1072 0.55
1073 0.64
1074 0.74
1075 0.75
1076 0.82
1077 0.85
1078 0.87
1079 0.85
1080 0.79
1081 0.74
1082 0.66
1083 0.58
1084 0.49
1085 0.39
1086 0.3
1087 0.22
1088 0.18
1089 0.14
1090 0.12
1091 0.1
1092 0.09
1093 0.1
1094 0.09
1095 0.09
1096 0.09
1097 0.09
1098 0.08
1099 0.09
1100 0.08
1101 0.07
1102 0.07