Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2T4CC11

Protein Details
Accession A0A2T4CC11    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-62ITSTIQDRFHRHRKHDPRAKAHLARARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-60RHRKHDPRAKAHLAR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046896  Cup1-like_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF20263  LYRM2-like  
CDD cd20273  Complex1_LYR_unchar  
Amino Acid Sequences MPAPAYPLPASPSPIQLYRHLLRECSYLPPVFRTEITSTIQDRFHRHRKHDPRAKAHLARARTALRTLRAANSGDKAAMEGLIFKGFGRSGSRRRELMAKFVIPQGPKDSSALEKVLTSPDAEGEGAAEDLAKGVPKAKKAFFDKWDQDKLLRILKSQRQQQRDTKGTASWLGNPVKTIDPDQFIPQQTIWGKPPCEALKQTKRAHWWRRNADKIMPPLGRGEWEILKELTAGAQERGEWQIPARRPLATSPAATEEMAARAQWNWKEYATKPAAIVEKPKALKQQRRTGQKDNGPYGVKDRDRELSKRWFQRAYSRTWQLTPTMTQDPNTLRYSFTWGSLSPRIPPAAKHQLDIFEGVDERGRKQAKSPSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.36
4 0.42
5 0.41
6 0.48
7 0.44
8 0.42
9 0.39
10 0.42
11 0.38
12 0.36
13 0.37
14 0.32
15 0.32
16 0.34
17 0.35
18 0.32
19 0.31
20 0.31
21 0.29
22 0.29
23 0.31
24 0.32
25 0.32
26 0.33
27 0.37
28 0.36
29 0.4
30 0.45
31 0.52
32 0.56
33 0.61
34 0.68
35 0.75
36 0.82
37 0.85
38 0.86
39 0.85
40 0.86
41 0.88
42 0.83
43 0.81
44 0.76
45 0.7
46 0.63
47 0.59
48 0.53
49 0.45
50 0.44
51 0.4
52 0.37
53 0.38
54 0.37
55 0.35
56 0.35
57 0.35
58 0.32
59 0.3
60 0.28
61 0.23
62 0.21
63 0.18
64 0.14
65 0.12
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.16
76 0.21
77 0.29
78 0.38
79 0.42
80 0.42
81 0.44
82 0.51
83 0.46
84 0.47
85 0.45
86 0.38
87 0.35
88 0.38
89 0.4
90 0.32
91 0.32
92 0.29
93 0.25
94 0.25
95 0.24
96 0.22
97 0.2
98 0.22
99 0.21
100 0.16
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.14
105 0.12
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.1
122 0.12
123 0.17
124 0.22
125 0.24
126 0.31
127 0.37
128 0.44
129 0.42
130 0.49
131 0.52
132 0.54
133 0.56
134 0.51
135 0.45
136 0.43
137 0.42
138 0.39
139 0.32
140 0.28
141 0.31
142 0.36
143 0.42
144 0.46
145 0.5
146 0.5
147 0.56
148 0.61
149 0.63
150 0.6
151 0.57
152 0.5
153 0.43
154 0.39
155 0.36
156 0.3
157 0.23
158 0.24
159 0.22
160 0.21
161 0.2
162 0.2
163 0.18
164 0.18
165 0.17
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.18
172 0.18
173 0.16
174 0.19
175 0.18
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.2
181 0.25
182 0.23
183 0.25
184 0.27
185 0.33
186 0.38
187 0.47
188 0.49
189 0.48
190 0.55
191 0.62
192 0.69
193 0.67
194 0.68
195 0.69
196 0.76
197 0.78
198 0.73
199 0.69
200 0.64
201 0.6
202 0.57
203 0.47
204 0.38
205 0.33
206 0.3
207 0.25
208 0.2
209 0.18
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.11
228 0.17
229 0.2
230 0.24
231 0.24
232 0.22
233 0.23
234 0.24
235 0.29
236 0.25
237 0.23
238 0.2
239 0.23
240 0.23
241 0.22
242 0.2
243 0.15
244 0.14
245 0.13
246 0.11
247 0.08
248 0.09
249 0.14
250 0.15
251 0.17
252 0.17
253 0.18
254 0.23
255 0.23
256 0.32
257 0.3
258 0.29
259 0.28
260 0.31
261 0.33
262 0.3
263 0.34
264 0.28
265 0.32
266 0.32
267 0.35
268 0.4
269 0.46
270 0.54
271 0.58
272 0.64
273 0.66
274 0.75
275 0.79
276 0.79
277 0.79
278 0.77
279 0.77
280 0.71
281 0.68
282 0.6
283 0.53
284 0.5
285 0.49
286 0.45
287 0.38
288 0.37
289 0.39
290 0.42
291 0.45
292 0.46
293 0.48
294 0.54
295 0.61
296 0.64
297 0.61
298 0.58
299 0.65
300 0.63
301 0.61
302 0.61
303 0.6
304 0.57
305 0.54
306 0.54
307 0.46
308 0.45
309 0.39
310 0.35
311 0.35
312 0.33
313 0.32
314 0.35
315 0.36
316 0.38
317 0.38
318 0.33
319 0.27
320 0.27
321 0.34
322 0.3
323 0.28
324 0.26
325 0.24
326 0.29
327 0.34
328 0.34
329 0.3
330 0.33
331 0.35
332 0.33
333 0.35
334 0.38
335 0.43
336 0.43
337 0.41
338 0.4
339 0.4
340 0.4
341 0.4
342 0.31
343 0.22
344 0.22
345 0.21
346 0.23
347 0.2
348 0.2
349 0.27
350 0.29
351 0.28
352 0.34