Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4CDD8

Protein Details
Accession A0A2T4CDD8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-147IEETRQRKLREQRLREKKRFGEYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-143QRKLREQRLREKKR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, cyto 12, nucl 11.5, cyto_mito 8.499
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTDEEKELLARIGQLAGQINRHKNQQAGYQSVPPSHHPSRHRGNVYRQASAPYPTRGFSSRPAAAHRHRTLHLNASASASGSASSSAAPSPAPTGSGWVSKNDRHRQLINASIYEKDSQNRAKAIEETRQRKLREQRLREKKRFGEYLRRQAGAAGFPNSGMTANATGTNEISVNGIQFRVLEGGKKLVKAPGDPASPAMTPKSTVIAGVKFHRTKTGNLVAQSIVKDQRRSGAVKKLDQRCKIFSTTGSCPKGPTCRYIHDPNKVALCKDFMKDGKCPNGEACDLSHELTPERVPNCLHFAKGQCSRPDCPFTHSKAPPSAPVCEAFGFCGYCDKGADCTNRHVFECPNFSNTGSCNIRGCKLLHRERASVLRNQAKQREEAENKDEDLSSDDESVDSDDVDSDEVAEFLEADSDDSDFENPKDFLPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.19
3 0.2
4 0.26
5 0.33
6 0.39
7 0.42
8 0.48
9 0.48
10 0.46
11 0.47
12 0.49
13 0.48
14 0.47
15 0.48
16 0.48
17 0.47
18 0.47
19 0.46
20 0.43
21 0.44
22 0.45
23 0.49
24 0.47
25 0.54
26 0.6
27 0.68
28 0.72
29 0.71
30 0.74
31 0.77
32 0.76
33 0.72
34 0.63
35 0.57
36 0.5
37 0.47
38 0.42
39 0.38
40 0.35
41 0.31
42 0.34
43 0.32
44 0.33
45 0.34
46 0.38
47 0.36
48 0.37
49 0.41
50 0.46
51 0.51
52 0.59
53 0.58
54 0.55
55 0.52
56 0.56
57 0.54
58 0.54
59 0.5
60 0.42
61 0.38
62 0.35
63 0.33
64 0.28
65 0.25
66 0.16
67 0.12
68 0.1
69 0.1
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.09
81 0.12
82 0.14
83 0.19
84 0.19
85 0.22
86 0.27
87 0.3
88 0.4
89 0.46
90 0.51
91 0.51
92 0.52
93 0.52
94 0.53
95 0.56
96 0.49
97 0.43
98 0.37
99 0.33
100 0.33
101 0.3
102 0.27
103 0.21
104 0.24
105 0.25
106 0.28
107 0.29
108 0.28
109 0.28
110 0.32
111 0.34
112 0.35
113 0.4
114 0.43
115 0.49
116 0.54
117 0.54
118 0.57
119 0.63
120 0.66
121 0.67
122 0.71
123 0.74
124 0.79
125 0.87
126 0.87
127 0.86
128 0.81
129 0.78
130 0.76
131 0.7
132 0.7
133 0.69
134 0.72
135 0.67
136 0.61
137 0.54
138 0.48
139 0.44
140 0.36
141 0.29
142 0.21
143 0.16
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.12
148 0.09
149 0.08
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.16
175 0.16
176 0.17
177 0.16
178 0.19
179 0.19
180 0.19
181 0.19
182 0.19
183 0.19
184 0.18
185 0.18
186 0.15
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.21
198 0.2
199 0.2
200 0.26
201 0.26
202 0.26
203 0.31
204 0.35
205 0.32
206 0.31
207 0.32
208 0.27
209 0.27
210 0.26
211 0.22
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.18
216 0.21
217 0.22
218 0.24
219 0.26
220 0.3
221 0.32
222 0.37
223 0.46
224 0.52
225 0.57
226 0.6
227 0.59
228 0.54
229 0.53
230 0.49
231 0.42
232 0.35
233 0.33
234 0.33
235 0.39
236 0.38
237 0.34
238 0.33
239 0.34
240 0.4
241 0.35
242 0.35
243 0.3
244 0.32
245 0.38
246 0.47
247 0.51
248 0.51
249 0.52
250 0.49
251 0.51
252 0.47
253 0.42
254 0.33
255 0.3
256 0.25
257 0.23
258 0.26
259 0.22
260 0.24
261 0.28
262 0.32
263 0.36
264 0.35
265 0.35
266 0.31
267 0.32
268 0.3
269 0.26
270 0.22
271 0.17
272 0.18
273 0.17
274 0.17
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.17
284 0.23
285 0.23
286 0.23
287 0.22
288 0.25
289 0.31
290 0.37
291 0.41
292 0.4
293 0.44
294 0.46
295 0.48
296 0.52
297 0.45
298 0.43
299 0.45
300 0.45
301 0.51
302 0.5
303 0.5
304 0.5
305 0.5
306 0.51
307 0.47
308 0.44
309 0.35
310 0.34
311 0.31
312 0.25
313 0.24
314 0.19
315 0.18
316 0.15
317 0.13
318 0.17
319 0.15
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.16
324 0.22
325 0.27
326 0.25
327 0.33
328 0.38
329 0.4
330 0.4
331 0.4
332 0.37
333 0.38
334 0.43
335 0.37
336 0.34
337 0.33
338 0.32
339 0.32
340 0.29
341 0.32
342 0.27
343 0.27
344 0.28
345 0.29
346 0.31
347 0.32
348 0.33
349 0.33
350 0.4
351 0.48
352 0.53
353 0.56
354 0.57
355 0.58
356 0.65
357 0.6
358 0.56
359 0.56
360 0.55
361 0.57
362 0.62
363 0.64
364 0.58
365 0.59
366 0.57
367 0.59
368 0.56
369 0.55
370 0.53
371 0.49
372 0.47
373 0.45
374 0.4
375 0.3
376 0.27
377 0.23
378 0.2
379 0.17
380 0.16
381 0.14
382 0.14
383 0.15
384 0.12
385 0.1
386 0.09
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.12
407 0.13
408 0.17
409 0.17