FuNGI

A0A2T4C3J8

Protein Details

Accession

A0A2T4C3J8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
548-572	VQNGGGRPRRTRARPKSLEQFCRML	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
554-561	RPRRTRAR

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 5, cyto 4, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024500 DUF3074 IPR002078 Sigma_54_int
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF11274 DUF3074
PROSITE	View protein in PROSITE PS50045 SIGMA54_INTERACT_4

Amino Acid Sequences

MAQYGPYVRLWGIRPSQLPAETASAQELIPFIQSILSEAVPFVSSVPQYSSSSSSSSSSSSSGKSSKSSQGGGVGSPDGPWKPKGCRAFPHSAAPVHMFERVVSAEDLKLAAKSGNLPQASGGAGAPKIRPETWSLRRSVHEGAKKAGTADWDEWTRCFKDGHADAEMKFTPTVLSHSLKKQWDCKGAEVALGDDVYEDITLKLEESTHRMPAPLNNRVFPVLQVTAAVRGRREFIVVQIAAVPESSSRAEEQRADGALRGAYTSIERLREVDEQGNVEWLMGTVSDARGVLPAWIQRMAVPGQVAKDVDMFLEWIAKEREGKNNNSRLLSHADALARMTVELNVRAVSAQTERLEKSLGALVACTKEDKAFRETHDARLQSMCREILAVKQRMEEIQGPEWNKGGGGRTTDAEGGGGQKEVDESIEQLRREMGELRGLVSDISSALDKLPTAAEAEALMERTRASALANNGGGTPAGSSATNQSSGTKTRSIKQRIEDTIASTRRWNRDHKTTKLTDAVFIANYLKQQSKRDPQMAVFMQRAIQKHVQNGGGRPRRTRARPKSLEQFCRMLVWKDVLDTAEAVLVRDWRRTARALEERG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.37
2	0.39
3	0.44
4	0.41
5	0.39
6	0.34
7	0.34
8	0.29
9	0.27
10	0.25
11	0.2
12	0.18
13	0.18
14	0.16
15	0.11
16	0.1
17	0.1
18	0.08
19	0.08
20	0.08
21	0.1
22	0.12
23	0.12
24	0.11
25	0.11
26	0.12
27	0.11
28	0.11
29	0.1
30	0.11
31	0.11
32	0.12
33	0.15
34	0.18
35	0.19
36	0.22
37	0.24
38	0.22
39	0.24
40	0.24
41	0.23
42	0.21
43	0.21
44	0.2
45	0.19
46	0.2
47	0.2
48	0.23
49	0.25
50	0.25
51	0.28
52	0.32
53	0.37
54	0.39
55	0.39
56	0.36
57	0.38
58	0.37
59	0.33
60	0.3
61	0.23
62	0.19
63	0.18
64	0.19
65	0.16
66	0.17
67	0.2
68	0.23
69	0.28
70	0.35
71	0.43
72	0.46
73	0.53
74	0.58
75	0.64
76	0.63
77	0.65
78	0.62
79	0.55
80	0.52
81	0.46
82	0.41
83	0.32
84	0.31
85	0.23
86	0.18
87	0.19
88	0.17
89	0.16
90	0.14
91	0.14
92	0.12
93	0.12
94	0.13
95	0.11
96	0.1
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.11
101	0.15
102	0.22
103	0.21
104	0.21
105	0.21
106	0.21
107	0.21
108	0.18
109	0.14
110	0.09
111	0.1
112	0.12
113	0.12
114	0.14
115	0.16
116	0.16
117	0.17
118	0.21
119	0.3
120	0.38
121	0.43
122	0.43
123	0.44
124	0.46
125	0.48
126	0.49
127	0.48
128	0.45
129	0.43
130	0.43
131	0.41
132	0.4
133	0.36
134	0.31
135	0.25
136	0.22
137	0.21
138	0.21
139	0.22
140	0.22
141	0.22
142	0.25
143	0.24
144	0.22
145	0.21
146	0.17
147	0.23
148	0.26
149	0.29
150	0.29
151	0.29
152	0.28
153	0.33
154	0.32
155	0.25
156	0.21
157	0.17
158	0.14
159	0.12
160	0.15
161	0.15
162	0.17
163	0.2
164	0.24
165	0.31
166	0.36
167	0.39
168	0.43
169	0.46
170	0.51
171	0.5
172	0.48
173	0.47
174	0.42
175	0.39
176	0.32
177	0.26
178	0.18
179	0.15
180	0.12
181	0.07
182	0.06
183	0.05
184	0.05
185	0.04
186	0.04
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.07
193	0.13
194	0.15
195	0.17
196	0.17
197	0.17
198	0.18
199	0.23
200	0.3
201	0.32
202	0.32
203	0.3
204	0.31
205	0.32
206	0.32
207	0.26
208	0.22
209	0.15
210	0.13
211	0.12
212	0.12
213	0.15
214	0.17
215	0.17
216	0.14
217	0.14
218	0.16
219	0.16
220	0.17
221	0.13
222	0.12
223	0.18
224	0.17
225	0.16
226	0.16
227	0.15
228	0.13
229	0.13
230	0.11
231	0.05
232	0.07
233	0.07
234	0.06
235	0.07
236	0.09
237	0.11
238	0.12
239	0.13
240	0.14
241	0.14
242	0.14
243	0.13
244	0.13
245	0.11
246	0.1
247	0.09
248	0.07
249	0.06
250	0.06
251	0.08
252	0.09
253	0.1
254	0.1
255	0.11
256	0.13
257	0.15
258	0.17
259	0.17
260	0.16
261	0.16
262	0.16
263	0.16
264	0.13
265	0.11
266	0.08
267	0.06
268	0.05
269	0.04
270	0.04
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.08
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.1
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.09
290	0.09
291	0.1
292	0.1
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.05
299	0.04
300	0.06
301	0.06
302	0.08
303	0.08
304	0.09
305	0.12
306	0.14
307	0.22
308	0.25
309	0.31
310	0.37
311	0.43
312	0.46
313	0.43
314	0.42
315	0.36
316	0.37
317	0.32
318	0.24
319	0.19
320	0.17
321	0.16
322	0.16
323	0.13
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.06
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.07
337	0.1
338	0.1
339	0.13
340	0.13
341	0.14
342	0.15
343	0.13
344	0.13
345	0.13
346	0.12
347	0.1
348	0.1
349	0.1
350	0.11
351	0.11
352	0.1
353	0.08
354	0.1
355	0.12
356	0.15
357	0.18
358	0.2
359	0.22
360	0.32
361	0.33
362	0.37
363	0.41
364	0.38
365	0.36
366	0.37
367	0.36
368	0.27
369	0.28
370	0.21
371	0.15
372	0.15
373	0.14
374	0.17
375	0.24
376	0.27
377	0.25
378	0.26
379	0.27
380	0.26
381	0.29
382	0.27
383	0.22
384	0.22
385	0.26
386	0.26
387	0.26
388	0.26
389	0.23
390	0.19
391	0.16
392	0.15
393	0.12
394	0.13
395	0.14
396	0.14
397	0.16
398	0.16
399	0.15
400	0.12
401	0.1
402	0.1
403	0.09
404	0.08
405	0.07
406	0.06
407	0.07
408	0.06
409	0.07
410	0.06
411	0.07
412	0.12
413	0.17
414	0.17
415	0.17
416	0.18
417	0.17
418	0.18
419	0.2
420	0.16
421	0.16
422	0.17
423	0.18
424	0.17
425	0.17
426	0.15
427	0.12
428	0.11
429	0.06
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.07
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.09
446	0.09
447	0.08
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.08
453	0.11
454	0.13
455	0.18
456	0.19
457	0.18
458	0.18
459	0.18
460	0.17
461	0.12
462	0.1
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.07
467	0.11
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.16
472	0.18
473	0.22
474	0.25
475	0.28
476	0.29
477	0.35
478	0.45
479	0.51
480	0.54
481	0.57
482	0.63
483	0.6
484	0.64
485	0.58
486	0.53
487	0.54
488	0.51
489	0.45
490	0.42
491	0.45
492	0.46
493	0.5
494	0.54
495	0.52
496	0.6
497	0.68
498	0.7
499	0.72
500	0.69
501	0.69
502	0.68
503	0.61
504	0.52
505	0.45
506	0.39
507	0.3
508	0.27
509	0.23
510	0.17
511	0.18
512	0.19
513	0.23
514	0.25
515	0.31
516	0.4
517	0.48
518	0.56
519	0.6
520	0.6
521	0.56
522	0.61
523	0.59
524	0.55
525	0.46
526	0.38
527	0.36
528	0.36
529	0.36
530	0.34
531	0.36
532	0.34
533	0.38
534	0.43
535	0.45
536	0.45
537	0.5
538	0.54
539	0.56
540	0.56
541	0.55
542	0.58
543	0.62
544	0.68
545	0.73
546	0.73
547	0.75
548	0.8
549	0.84
550	0.87
551	0.87
552	0.86
553	0.8
554	0.74
555	0.63
556	0.61
557	0.55
558	0.48
559	0.41
560	0.36
561	0.32
562	0.29
563	0.29
564	0.24
565	0.22
566	0.19
567	0.16
568	0.14
569	0.14
570	0.13
571	0.13
572	0.18
573	0.19
574	0.22
575	0.24
576	0.25
577	0.29
578	0.33
579	0.35
580	0.4

A0A2T4C3J8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer