Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4C6V2

Protein Details
Accession A0A2T4C6V2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
172-236ADMYKEEKKEKKEKKHKDERRSRSRSRSSRSRSRSSSSSSSGSSRHRHHHRRHSHSRSRSGSRSRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
176-236KEEKKEKKEKKHKDERRSRSRSRSSRSRSRSSSSSSSGSSRHRHHHRRHSHSRSRSGSRSR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008816  Gly_zipper_2TM_dom  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Gene Ontology GO:0019867  C:outer membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF01476  LysM  
PF05433  Rick_17kDa_Anti  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MSGYGYQGGDYGHQGGEYGHQGGDYGQHNNQYPPQHNQQYPPQHGNQYPPQHNQYPPQQGHAGGSASSYYEGASAEQQQQQYHTLYQQPPPPYPSDGPGYGAAPQEGERGLMGALAGGAAGAFGGSKLGGQATGHAKTSGVVGAIVGAIAGSKLQDGVSDWRHERKEEKHEADMYKEEKKEKKEKKHKDERRSRSRSRSSRSRSRSSSSSSSGSSRHRHHHRRHSHSRSRSGSRSRGHGGTVTVQAGDTLREIAARYGTSFEEIARHNGIQNPDMIYPGQVLRVPGWH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.17
11 0.16
12 0.18
13 0.18
14 0.23
15 0.25
16 0.28
17 0.33
18 0.35
19 0.37
20 0.41
21 0.48
22 0.53
23 0.54
24 0.56
25 0.61
26 0.63
27 0.66
28 0.65
29 0.6
30 0.58
31 0.57
32 0.59
33 0.58
34 0.58
35 0.57
36 0.57
37 0.59
38 0.58
39 0.58
40 0.58
41 0.58
42 0.58
43 0.53
44 0.51
45 0.46
46 0.41
47 0.4
48 0.36
49 0.28
50 0.17
51 0.16
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.08
61 0.11
62 0.14
63 0.18
64 0.19
65 0.19
66 0.21
67 0.23
68 0.23
69 0.21
70 0.2
71 0.24
72 0.25
73 0.29
74 0.33
75 0.34
76 0.34
77 0.36
78 0.36
79 0.33
80 0.31
81 0.3
82 0.28
83 0.25
84 0.25
85 0.23
86 0.21
87 0.19
88 0.18
89 0.15
90 0.11
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.01
108 0.01
109 0.01
110 0.01
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.07
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.09
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.02
135 0.02
136 0.02
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.03
143 0.04
144 0.09
145 0.11
146 0.14
147 0.16
148 0.21
149 0.22
150 0.24
151 0.27
152 0.3
153 0.38
154 0.44
155 0.46
156 0.45
157 0.49
158 0.49
159 0.46
160 0.44
161 0.38
162 0.34
163 0.32
164 0.34
165 0.34
166 0.41
167 0.49
168 0.54
169 0.62
170 0.68
171 0.77
172 0.82
173 0.88
174 0.91
175 0.92
176 0.93
177 0.92
178 0.93
179 0.91
180 0.88
181 0.87
182 0.88
183 0.86
184 0.84
185 0.84
186 0.81
187 0.83
188 0.82
189 0.8
190 0.75
191 0.71
192 0.67
193 0.63
194 0.6
195 0.53
196 0.48
197 0.41
198 0.38
199 0.37
200 0.39
201 0.39
202 0.39
203 0.45
204 0.53
205 0.61
206 0.69
207 0.75
208 0.8
209 0.83
210 0.89
211 0.9
212 0.9
213 0.89
214 0.89
215 0.86
216 0.83
217 0.81
218 0.79
219 0.76
220 0.7
221 0.67
222 0.63
223 0.56
224 0.5
225 0.43
226 0.37
227 0.33
228 0.31
229 0.25
230 0.2
231 0.18
232 0.17
233 0.15
234 0.13
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.16
250 0.18
251 0.21
252 0.23
253 0.23
254 0.23
255 0.28
256 0.31
257 0.27
258 0.28
259 0.27
260 0.24
261 0.25
262 0.23
263 0.19
264 0.18
265 0.17
266 0.18
267 0.16
268 0.17