FuNGI

A0A2T4CCF1

Protein Details

Accession

A0A2T4CCF1

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
102-128	DAKSWLLGQKKRQKKIDKARKLEEELA	Hydrophilic
279-305	LAPSEIKVKKPKKKKGNKGTRQKQLDE	Basic
350-376	SLAIQRKNALKKRKKTRPEDIAKQLKE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
64-83	AKKRREEKAAAVRKAREKAQ
111-122	KKRQKKIDKARK
285-299	KVKKPKKKKGNKGTR
356-366	KNALKKRKKTR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.166, cyto 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MDAATIEETNRIRISLGMKPLPVPGAGPSPQAATSEEEEPGSTVESRQAQAYDNFKKVQEEEAAKKRREEKAAAVRKAREKAQLAAKLEGKGLGEEEQADLDAKSWLLGQKKRQKKIDKARKLEEELAAAEAAAAAAIQYTAKDLAGIKVAHDTTAFLDGDEQILTLKDTTIDENEEEGDELENLNLREQEKLTERLDLKKKLKGYNPNDYNDGEGTILAQYDEEINGKKAKKFTLDDDGAIAELSDILGQPERKAKKIQAISLDDIIDGDAAPSSDYLAPSEIKVKKPKKKKGNKGTRQKQLDEDDIFPIEPAPVDTGAMDVDVKDSSISTKRKATTDDFADDDDLQTSLAIQRKNALKKRKKTRPEDIAKQLKEEEEEPEEAPSGGLVIGEISEFVAGLSKPDDDDRHARRHRQATKTPEPGDRHMSGQDEDAEMDEYAAEHQEALAAAQQEEEERNRKREGSEPAGIADEKTVGEGMGAALALLRERGLIDTSSKSGSYEDFKAREEFLAKKRILETELEEQTRHQRERDRMSGRLDRMSVREREEWARQQNTHRDYQQSKRLAELFNATYKPNVELKYVDDHGRRLDQKEAFKHMSHQFHGKGSGKGKTEKLLKKIDDEKRREAQSMFDASQNAGMTLATAQQLKKRREAGVRLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.25
3	0.33
4	0.33
5	0.33
6	0.34
7	0.36
8	0.34
9	0.3
10	0.24
11	0.19
12	0.21
13	0.22
14	0.22
15	0.21
16	0.22
17	0.22
18	0.23
19	0.21
20	0.19
21	0.21
22	0.21
23	0.21
24	0.19
25	0.19
26	0.18
27	0.17
28	0.15
29	0.13
30	0.11
31	0.16
32	0.19
33	0.19
34	0.21
35	0.22
36	0.23
37	0.28
38	0.36
39	0.38
40	0.39
41	0.4
42	0.4
43	0.42
44	0.4
45	0.39
46	0.38
47	0.39
48	0.43
49	0.51
50	0.58
51	0.57
52	0.62
53	0.65
54	0.65
55	0.64
56	0.6
57	0.6
58	0.63
59	0.71
60	0.72
61	0.7
62	0.69
63	0.71
64	0.71
65	0.65
66	0.62
67	0.56
68	0.55
69	0.58
70	0.58
71	0.54
72	0.55
73	0.53
74	0.46
75	0.43
76	0.38
77	0.29
78	0.22
79	0.2
80	0.16
81	0.13
82	0.12
83	0.12
84	0.11
85	0.11
86	0.11
87	0.09
88	0.08
89	0.08
90	0.07
91	0.07
92	0.09
93	0.12
94	0.19
95	0.25
96	0.34
97	0.44
98	0.54
99	0.63
100	0.7
101	0.77
102	0.8
103	0.86
104	0.88
105	0.88
106	0.87
107	0.87
108	0.85
109	0.81
110	0.75
111	0.66
112	0.56
113	0.46
114	0.39
115	0.3
116	0.21
117	0.15
118	0.1
119	0.07
120	0.05
121	0.03
122	0.02
123	0.02
124	0.02
125	0.03
126	0.03
127	0.04
128	0.05
129	0.05
130	0.06
131	0.07
132	0.09
133	0.13
134	0.14
135	0.13
136	0.17
137	0.17
138	0.17
139	0.16
140	0.16
141	0.12
142	0.16
143	0.15
144	0.1
145	0.11
146	0.11
147	0.12
148	0.11
149	0.1
150	0.06
151	0.06
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.07
157	0.09
158	0.1
159	0.12
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.12
164	0.11
165	0.1
166	0.09
167	0.07
168	0.07
169	0.06
170	0.08
171	0.08
172	0.09
173	0.11
174	0.11
175	0.13
176	0.13
177	0.17
178	0.19
179	0.24
180	0.23
181	0.28
182	0.29
183	0.36
184	0.44
185	0.49
186	0.48
187	0.49
188	0.54
189	0.54
190	0.6
191	0.61
192	0.61
193	0.63
194	0.65
195	0.63
196	0.6
197	0.53
198	0.48
199	0.37
200	0.31
201	0.2
202	0.13
203	0.11
204	0.08
205	0.08
206	0.05
207	0.05
208	0.04
209	0.05
210	0.05
211	0.06
212	0.07
213	0.09
214	0.14
215	0.17
216	0.2
217	0.22
218	0.24
219	0.29
220	0.31
221	0.33
222	0.37
223	0.37
224	0.34
225	0.32
226	0.29
227	0.23
228	0.2
229	0.16
230	0.06
231	0.04
232	0.04
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.06
237	0.06
238	0.08
239	0.16
240	0.17
241	0.2
242	0.23
243	0.26
244	0.32
245	0.36
246	0.39
247	0.39
248	0.42
249	0.41
250	0.4
251	0.37
252	0.28
253	0.23
254	0.19
255	0.12
256	0.07
257	0.05
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.05
263	0.06
264	0.06
265	0.06
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.16
270	0.18
271	0.22
272	0.32
273	0.41
274	0.48
275	0.58
276	0.68
277	0.71
278	0.79
279	0.85
280	0.87
281	0.89
282	0.91
283	0.92
284	0.91
285	0.9
286	0.85
287	0.76
288	0.7
289	0.63
290	0.58
291	0.49
292	0.4
293	0.32
294	0.27
295	0.24
296	0.18
297	0.14
298	0.09
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.04
309	0.03
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.06
316	0.12
317	0.14
318	0.16
319	0.21
320	0.23
321	0.25
322	0.29
323	0.3
324	0.29
325	0.31
326	0.3
327	0.26
328	0.24
329	0.24
330	0.2
331	0.17
332	0.12
333	0.08
334	0.06
335	0.05
336	0.05
337	0.07
338	0.11
339	0.11
340	0.1
341	0.15
342	0.22
343	0.3
344	0.37
345	0.45
346	0.51
347	0.6
348	0.71
349	0.77
350	0.8
351	0.81
352	0.84
353	0.84
354	0.84
355	0.82
356	0.81
357	0.81
358	0.71
359	0.64
360	0.55
361	0.45
362	0.37
363	0.29
364	0.22
365	0.15
366	0.17
367	0.15
368	0.14
369	0.14
370	0.13
371	0.11
372	0.08
373	0.06
374	0.04
375	0.04
376	0.03
377	0.03
378	0.03
379	0.03
380	0.03
381	0.03
382	0.02
383	0.02
384	0.02
385	0.04
386	0.04
387	0.05
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.08
392	0.1
393	0.12
394	0.21
395	0.25
396	0.34
397	0.39
398	0.45
399	0.51
400	0.6
401	0.65
402	0.65
403	0.68
404	0.68
405	0.73
406	0.75
407	0.71
408	0.68
409	0.63
410	0.58
411	0.56
412	0.48
413	0.4
414	0.34
415	0.32
416	0.26
417	0.23
418	0.2
419	0.15
420	0.13
421	0.12
422	0.11
423	0.09
424	0.08
425	0.07
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.05
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.08
440	0.08
441	0.1
442	0.13
443	0.19
444	0.21
445	0.25
446	0.27
447	0.29
448	0.3
449	0.36
450	0.41
451	0.4
452	0.41
453	0.38
454	0.37
455	0.37
456	0.34
457	0.27
458	0.19
459	0.13
460	0.09
461	0.08
462	0.07
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.04
468	0.04
469	0.03
470	0.03
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.04
477	0.05
478	0.07
479	0.08
480	0.1
481	0.12
482	0.14
483	0.15
484	0.15
485	0.15
486	0.14
487	0.15
488	0.17
489	0.2
490	0.24
491	0.25
492	0.27
493	0.28
494	0.29
495	0.28
496	0.28
497	0.29
498	0.29
499	0.36
500	0.35
501	0.36
502	0.37
503	0.37
504	0.36
505	0.31
506	0.31
507	0.3
508	0.36
509	0.34
510	0.32
511	0.32
512	0.39
513	0.44
514	0.4
515	0.36
516	0.39
517	0.46
518	0.55
519	0.63
520	0.59
521	0.56
522	0.62
523	0.66
524	0.61
525	0.57
526	0.5
527	0.43
528	0.43
529	0.45
530	0.42
531	0.39
532	0.39
533	0.38
534	0.42
535	0.47
536	0.5
537	0.52
538	0.55
539	0.53
540	0.58
541	0.64
542	0.63
543	0.63
544	0.59
545	0.58
546	0.58
547	0.63
548	0.64
549	0.62
550	0.58
551	0.55
552	0.56
553	0.49
554	0.45
555	0.43
556	0.36
557	0.35
558	0.36
559	0.31
560	0.29
561	0.28
562	0.29
563	0.29
564	0.27
565	0.24
566	0.23
567	0.26
568	0.31
569	0.33
570	0.36
571	0.33
572	0.34
573	0.36
574	0.42
575	0.43
576	0.39
577	0.44
578	0.44
579	0.5
580	0.54
581	0.58
582	0.54
583	0.52
584	0.56
585	0.56
586	0.57
587	0.52
588	0.53
589	0.48
590	0.47
591	0.54
592	0.5
593	0.49
594	0.47
595	0.5
596	0.47
597	0.5
598	0.5
599	0.5
600	0.56
601	0.57
602	0.59
603	0.62
604	0.59
605	0.62
606	0.69
607	0.71
608	0.71
609	0.71
610	0.72
611	0.71
612	0.72
613	0.68
614	0.58
615	0.54
616	0.51
617	0.51
618	0.43
619	0.38
620	0.35
621	0.32
622	0.35
623	0.29
624	0.22
625	0.15
626	0.13
627	0.11
628	0.11
629	0.12
630	0.11
631	0.14
632	0.16
633	0.23
634	0.32
635	0.36
636	0.43
637	0.47
638	0.52
639	0.58

A0A2T4CCF1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer