Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4C6J4

Protein Details
Accession A0A2T4C6J4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
476-500NIATKKIPPKAPPPRRQGKARMAETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
448-466KAKKPLPAVPKHRHGIPFK
478-496ATKKIPPKAPPPRRQGKAR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences MADYDETAPSPPTPLSPEEEDALWSELDRCVSEQCESYEAIDDALRSWLDVTTKLRDQQPTSQEEVVMCAQILLDSVIFQKHKDYVRKQLIYSLLQEDEAGPLHAIVCMLLLDGHRDEATFPRMIQEACFPRLLELISSRYTNDDPRLHRFLLQLMYEMSRVERLSPEDLALVDDDFIHLLFGLIEGVSSDVNDPYHYPTIRVLLVLNEQYMLASTDTVTNSGSVPEPLTNRIVKCLSLHGPRYRTFGENIILLLNRETETSLQLLILKLLYLLFTTKATYEYFYTNDLRVLLDVIIRNLMDLPDERMSLRHTYLRILYPLLAHTQMNQPPHYKKDEILRVIRILRGSQNAHFAPADPTTLRLVNRVAKVSWLEADDEEYEASGQAEVARKLLGMSVSPRDSSSSVSVSDVAEVTEKPGVQTPSRSQDAKANQGHPEHDGESEDSAGKAKKPLPAVPKHRHGIPFKHAAATVHIANIATKKIPPKAPPPRRQGKARMAETASDEHLAGPIN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.25
3 0.28
4 0.3
5 0.3
6 0.29
7 0.28
8 0.26
9 0.25
10 0.19
11 0.15
12 0.14
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.14
17 0.15
18 0.17
19 0.19
20 0.2
21 0.2
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.22
26 0.2
27 0.19
28 0.17
29 0.15
30 0.13
31 0.15
32 0.14
33 0.1
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.17
38 0.2
39 0.24
40 0.28
41 0.33
42 0.38
43 0.43
44 0.46
45 0.5
46 0.54
47 0.53
48 0.53
49 0.5
50 0.45
51 0.39
52 0.38
53 0.3
54 0.23
55 0.17
56 0.12
57 0.11
58 0.09
59 0.1
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.07
64 0.11
65 0.12
66 0.12
67 0.15
68 0.2
69 0.28
70 0.37
71 0.42
72 0.48
73 0.58
74 0.62
75 0.59
76 0.6
77 0.57
78 0.51
79 0.48
80 0.4
81 0.31
82 0.27
83 0.26
84 0.21
85 0.16
86 0.14
87 0.12
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.1
105 0.13
106 0.17
107 0.15
108 0.15
109 0.16
110 0.18
111 0.18
112 0.18
113 0.22
114 0.24
115 0.25
116 0.26
117 0.24
118 0.23
119 0.24
120 0.23
121 0.17
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.17
126 0.16
127 0.18
128 0.19
129 0.21
130 0.25
131 0.29
132 0.31
133 0.38
134 0.42
135 0.4
136 0.41
137 0.38
138 0.36
139 0.33
140 0.29
141 0.23
142 0.19
143 0.2
144 0.17
145 0.16
146 0.13
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.07
182 0.1
183 0.15
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.18
188 0.18
189 0.17
190 0.13
191 0.11
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.14
217 0.16
218 0.15
219 0.18
220 0.18
221 0.17
222 0.16
223 0.18
224 0.21
225 0.23
226 0.28
227 0.3
228 0.33
229 0.34
230 0.37
231 0.35
232 0.31
233 0.27
234 0.25
235 0.21
236 0.18
237 0.17
238 0.14
239 0.12
240 0.1
241 0.09
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.14
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.16
299 0.16
300 0.17
301 0.2
302 0.21
303 0.2
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.11
311 0.12
312 0.18
313 0.2
314 0.22
315 0.23
316 0.27
317 0.29
318 0.33
319 0.37
320 0.31
321 0.31
322 0.37
323 0.43
324 0.44
325 0.45
326 0.43
327 0.41
328 0.41
329 0.41
330 0.32
331 0.26
332 0.23
333 0.24
334 0.24
335 0.23
336 0.28
337 0.26
338 0.27
339 0.25
340 0.23
341 0.21
342 0.19
343 0.19
344 0.13
345 0.14
346 0.15
347 0.17
348 0.17
349 0.16
350 0.19
351 0.23
352 0.26
353 0.26
354 0.24
355 0.24
356 0.25
357 0.24
358 0.22
359 0.17
360 0.16
361 0.14
362 0.16
363 0.14
364 0.13
365 0.12
366 0.1
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.05
371 0.05
372 0.07
373 0.11
374 0.11
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.13
380 0.11
381 0.09
382 0.12
383 0.17
384 0.18
385 0.19
386 0.19
387 0.21
388 0.21
389 0.22
390 0.22
391 0.18
392 0.17
393 0.18
394 0.19
395 0.16
396 0.16
397 0.13
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.1
402 0.11
403 0.11
404 0.11
405 0.16
406 0.19
407 0.2
408 0.26
409 0.3
410 0.35
411 0.4
412 0.4
413 0.37
414 0.42
415 0.46
416 0.5
417 0.5
418 0.47
419 0.47
420 0.49
421 0.49
422 0.43
423 0.4
424 0.32
425 0.26
426 0.25
427 0.21
428 0.19
429 0.19
430 0.17
431 0.14
432 0.16
433 0.16
434 0.16
435 0.2
436 0.23
437 0.26
438 0.3
439 0.37
440 0.44
441 0.52
442 0.61
443 0.65
444 0.71
445 0.7
446 0.71
447 0.72
448 0.7
449 0.68
450 0.66
451 0.66
452 0.58
453 0.58
454 0.53
455 0.46
456 0.43
457 0.39
458 0.32
459 0.24
460 0.23
461 0.2
462 0.2
463 0.21
464 0.18
465 0.16
466 0.19
467 0.24
468 0.31
469 0.37
470 0.41
471 0.5
472 0.6
473 0.69
474 0.75
475 0.8
476 0.83
477 0.84
478 0.87
479 0.86
480 0.85
481 0.85
482 0.79
483 0.77
484 0.69
485 0.64
486 0.58
487 0.52
488 0.43
489 0.34
490 0.3
491 0.22