Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T4CH39

Protein Details
Accession A0A2T4CH39    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
55-80NGAPKEVQKIKKQRKAKGKVKAEEEEBasic
414-442QEQVDKKASKGVKKKRGSKVKKEETSDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
62-75QKIKKQRKAKGKVK
419-435KKASKGVKKKRGSKVKK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 11, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001719  AP_endonuc_2  
IPR018246  AP_endonuc_F2_Zn_BS  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
IPR013022  Xyl_isomerase-like_TIM-brl  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01261  AP_endonuc_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00730  AP_NUCLEASE_F2_2  
PS00731  AP_NUCLEASE_F2_3  
PS51432  AP_NUCLEASE_F2_4  
CDD cd00019  AP2Ec  
Amino Acid Sequences MPRLTRGSQKAIKLEQEADVKITDSKPAKPAPSVSKRKADSPPHAELDNAEPLVNGAPKEVQKIKKQRKAKGKVKAEEEEAMVLAERTVVSSLRRAMYIGAHVSAAGGVQNSVTNALHIGANSFALFLKSQRKWANPPMTPEAQDGFVSGCKHHRYAANEHVLPHGSYLVNLAQADAAKAQQAYDSFVDDLARCERLGIRLYNFHPGSTGGEPKDAAIGRIAAQLNRAHRATQTVVTVLENMAGGGNVVGSTWEDLRDIIALVEDKTRVGVCIDTCHAFAAGYDLRTPEAFKKTVDSFNDIVGAKYLKAFHLNDSKAPLGSNRDLHANIGTGFLGLRAFHNVMNHADFQDKPMVLETPIDKKTPDGKTVEDKQVWADEIKLLESLVGMDPDTKEFARLEAELQDKGADERRRIQEQVDKKASKGVKKKRGSKVKKEETSDEESG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.49
3 0.48
4 0.43
5 0.36
6 0.32
7 0.28
8 0.27
9 0.25
10 0.27
11 0.25
12 0.28
13 0.33
14 0.38
15 0.4
16 0.41
17 0.48
18 0.51
19 0.58
20 0.65
21 0.65
22 0.68
23 0.67
24 0.71
25 0.73
26 0.72
27 0.71
28 0.69
29 0.69
30 0.63
31 0.61
32 0.53
33 0.46
34 0.41
35 0.36
36 0.29
37 0.21
38 0.18
39 0.18
40 0.2
41 0.2
42 0.15
43 0.11
44 0.15
45 0.17
46 0.24
47 0.31
48 0.35
49 0.43
50 0.55
51 0.64
52 0.69
53 0.77
54 0.8
55 0.83
56 0.87
57 0.87
58 0.86
59 0.86
60 0.84
61 0.82
62 0.78
63 0.71
64 0.62
65 0.54
66 0.44
67 0.33
68 0.26
69 0.18
70 0.13
71 0.09
72 0.07
73 0.06
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.12
79 0.16
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.2
86 0.18
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.09
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.07
113 0.07
114 0.1
115 0.19
116 0.19
117 0.27
118 0.32
119 0.37
120 0.42
121 0.52
122 0.58
123 0.52
124 0.58
125 0.56
126 0.54
127 0.51
128 0.47
129 0.38
130 0.3
131 0.26
132 0.2
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.12
137 0.16
138 0.18
139 0.19
140 0.21
141 0.25
142 0.27
143 0.33
144 0.41
145 0.44
146 0.42
147 0.42
148 0.41
149 0.38
150 0.32
151 0.26
152 0.19
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.09
171 0.09
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.11
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.12
184 0.15
185 0.15
186 0.15
187 0.19
188 0.21
189 0.28
190 0.28
191 0.25
192 0.22
193 0.21
194 0.22
195 0.19
196 0.22
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.14
201 0.17
202 0.13
203 0.12
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.13
208 0.14
209 0.1
210 0.13
211 0.15
212 0.16
213 0.19
214 0.19
215 0.15
216 0.15
217 0.18
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.13
222 0.13
223 0.13
224 0.13
225 0.1
226 0.08
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.08
258 0.07
259 0.1
260 0.12
261 0.12
262 0.12
263 0.12
264 0.12
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.11
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.14
275 0.14
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.22
280 0.25
281 0.31
282 0.31
283 0.32
284 0.28
285 0.27
286 0.31
287 0.27
288 0.23
289 0.19
290 0.17
291 0.12
292 0.13
293 0.14
294 0.1
295 0.15
296 0.16
297 0.2
298 0.28
299 0.29
300 0.29
301 0.32
302 0.32
303 0.28
304 0.27
305 0.24
306 0.22
307 0.24
308 0.25
309 0.22
310 0.25
311 0.25
312 0.26
313 0.24
314 0.19
315 0.16
316 0.14
317 0.13
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.07
324 0.1
325 0.11
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.17
330 0.2
331 0.2
332 0.17
333 0.19
334 0.18
335 0.19
336 0.23
337 0.2
338 0.18
339 0.19
340 0.19
341 0.17
342 0.2
343 0.21
344 0.22
345 0.24
346 0.25
347 0.23
348 0.26
349 0.34
350 0.35
351 0.38
352 0.33
353 0.36
354 0.44
355 0.51
356 0.56
357 0.49
358 0.45
359 0.41
360 0.41
361 0.38
362 0.3
363 0.24
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.15
368 0.12
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.11
377 0.12
378 0.15
379 0.14
380 0.15
381 0.14
382 0.15
383 0.16
384 0.16
385 0.17
386 0.2
387 0.23
388 0.21
389 0.21
390 0.2
391 0.18
392 0.2
393 0.27
394 0.26
395 0.27
396 0.36
397 0.43
398 0.48
399 0.49
400 0.52
401 0.52
402 0.56
403 0.63
404 0.64
405 0.59
406 0.54
407 0.61
408 0.61
409 0.62
410 0.63
411 0.64
412 0.64
413 0.73
414 0.82
415 0.85
416 0.9
417 0.91
418 0.92
419 0.92
420 0.93
421 0.91
422 0.88
423 0.84
424 0.8