Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2T3ZDM4

Protein Details
Accession A0A2T3ZDM4    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-151TFAGRWPHENKRGWKCKTKQLVEHydrophilic
294-314EEDTQPPKLRRGKKRSSDAIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-280GAKKPRAKRGTGAKAGRKKTKK
303-307RRGKK
367-375SRSRPGRKR
487-493KRGRKAG
545-553AGKRGRGRP
667-675KRGRGRPAK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR001370  BIR_rpt  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00653  BIR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50143  BIR_REPEAT_2  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd00022  BIR  
Amino Acid Sequences MATINFDQYFSYEARLASFQRTTKKRGSATGGRGAAKALNWPHKQISATSLARAGFVFSPSPDSPDNTICFLCEKGLDGWEAGDDPVYEHVKHAPHCGWALVAAIEADIGDYAREDPNDPEMVEARKATFAGRWPHENKRGWKCKTKQLVEAGWKYTPTGESDDMATCAYCQLALDGWEQGDKPLDEHYNRSPDCPFFSLVSQYKALGKASNRGRASRNSSVSAQSRGAAATDISNPSDMSAGFDDSVATGSSSAAQPGAKKPRAKRGTGAKAGRKKTKKEEPSELLDESSQMEEDTQPPKLRRGKKRSSDAIEESTMSLMGGPTLKKRASQLSVDDTIDNIAAHEDDSEMTDVSSVSYKKNGAPSSRSRPGRKRTSKLNSHASMASLRAPGGFLNDDEIERRLEADLEYHFTDDEEIAYDSDSTRNMAKASRTVTDSEAETTQIAKPKSPEHAMLETAVPEPNEIEVEDELQALQAEMEVKESAPKRGRKAGVQKTLKQLKFKKVEAESEFSESQKEEERVASADVSVSSTRSVLKIPNLPPPAGKRGRGRPRASLTSQDESIVETDESAQQPIKRGRGRPSRESLASLLSAESGDTHIAKASVKRGRGRPSNESPDSTGADEDSEAASALAPKRRGRPSKASSTSQNAHDYTAVGRSKDAYAPVKRGRGRPAKKMVDITSTEQTETEVDEEFVEAPEPSEALPRPPKQSPLRAIFSPKEDALSLAPLPGTPSKLLSPVPSARQPVLSPSQSPQSSDAENQPPVSRAPAAGDAKRIILAPVAATPIQGSPSKRNVMTGLRSTTQWASASLEAIFGSPLGTPGKENDVDRFLKRGNELTSPERQMSVEEWIYFNAAEAEKKLKYECESLVNRFEMEGTRAIKVLEGLEVVEAES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.22
3 0.23
4 0.26
5 0.31
6 0.33
7 0.4
8 0.46
9 0.5
10 0.55
11 0.62
12 0.6
13 0.62
14 0.66
15 0.65
16 0.67
17 0.69
18 0.66
19 0.59
20 0.55
21 0.49
22 0.42
23 0.33
24 0.33
25 0.31
26 0.36
27 0.37
28 0.42
29 0.44
30 0.46
31 0.47
32 0.41
33 0.38
34 0.38
35 0.36
36 0.34
37 0.34
38 0.3
39 0.29
40 0.27
41 0.25
42 0.17
43 0.17
44 0.17
45 0.14
46 0.21
47 0.21
48 0.25
49 0.24
50 0.26
51 0.28
52 0.32
53 0.33
54 0.3
55 0.29
56 0.26
57 0.26
58 0.23
59 0.2
60 0.15
61 0.16
62 0.15
63 0.16
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.11
70 0.1
71 0.08
72 0.08
73 0.13
74 0.16
75 0.15
76 0.16
77 0.21
78 0.24
79 0.26
80 0.31
81 0.28
82 0.29
83 0.3
84 0.29
85 0.24
86 0.2
87 0.19
88 0.13
89 0.12
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.03
98 0.04
99 0.06
100 0.09
101 0.1
102 0.11
103 0.13
104 0.17
105 0.19
106 0.18
107 0.19
108 0.2
109 0.22
110 0.22
111 0.22
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.18
116 0.18
117 0.22
118 0.29
119 0.32
120 0.39
121 0.44
122 0.53
123 0.61
124 0.66
125 0.69
126 0.71
127 0.77
128 0.76
129 0.81
130 0.78
131 0.79
132 0.82
133 0.78
134 0.74
135 0.71
136 0.72
137 0.71
138 0.7
139 0.63
140 0.54
141 0.48
142 0.41
143 0.35
144 0.28
145 0.21
146 0.21
147 0.19
148 0.18
149 0.2
150 0.21
151 0.19
152 0.19
153 0.16
154 0.11
155 0.1
156 0.09
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.08
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.14
169 0.12
170 0.12
171 0.16
172 0.21
173 0.22
174 0.26
175 0.32
176 0.38
177 0.38
178 0.4
179 0.38
180 0.35
181 0.38
182 0.35
183 0.31
184 0.23
185 0.25
186 0.3
187 0.3
188 0.31
189 0.27
190 0.26
191 0.26
192 0.26
193 0.25
194 0.22
195 0.21
196 0.27
197 0.33
198 0.4
199 0.4
200 0.42
201 0.45
202 0.48
203 0.55
204 0.55
205 0.52
206 0.46
207 0.47
208 0.49
209 0.48
210 0.44
211 0.36
212 0.28
213 0.25
214 0.21
215 0.2
216 0.14
217 0.11
218 0.09
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.1
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.1
245 0.18
246 0.27
247 0.32
248 0.38
249 0.43
250 0.53
251 0.59
252 0.59
253 0.59
254 0.6
255 0.65
256 0.67
257 0.71
258 0.69
259 0.71
260 0.75
261 0.78
262 0.74
263 0.71
264 0.72
265 0.74
266 0.74
267 0.73
268 0.76
269 0.71
270 0.71
271 0.68
272 0.58
273 0.48
274 0.39
275 0.32
276 0.23
277 0.18
278 0.11
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.11
283 0.12
284 0.15
285 0.19
286 0.2
287 0.28
288 0.36
289 0.45
290 0.53
291 0.61
292 0.68
293 0.73
294 0.81
295 0.82
296 0.8
297 0.77
298 0.7
299 0.64
300 0.55
301 0.46
302 0.37
303 0.28
304 0.21
305 0.14
306 0.1
307 0.06
308 0.05
309 0.06
310 0.07
311 0.09
312 0.13
313 0.14
314 0.15
315 0.18
316 0.24
317 0.25
318 0.28
319 0.29
320 0.31
321 0.33
322 0.32
323 0.3
324 0.24
325 0.2
326 0.18
327 0.14
328 0.08
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.2
349 0.23
350 0.24
351 0.29
352 0.36
353 0.43
354 0.51
355 0.55
356 0.56
357 0.62
358 0.68
359 0.73
360 0.75
361 0.71
362 0.73
363 0.77
364 0.78
365 0.77
366 0.77
367 0.67
368 0.6
369 0.55
370 0.45
371 0.36
372 0.28
373 0.23
374 0.14
375 0.12
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.09
380 0.08
381 0.06
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.07
395 0.09
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.06
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.1
416 0.1
417 0.13
418 0.15
419 0.16
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.18
424 0.17
425 0.15
426 0.13
427 0.12
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.14
432 0.13
433 0.13
434 0.14
435 0.16
436 0.2
437 0.21
438 0.22
439 0.21
440 0.23
441 0.22
442 0.21
443 0.19
444 0.16
445 0.15
446 0.13
447 0.09
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.06
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.03
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.1
470 0.11
471 0.17
472 0.23
473 0.27
474 0.29
475 0.37
476 0.39
477 0.42
478 0.52
479 0.56
480 0.59
481 0.61
482 0.62
483 0.64
484 0.71
485 0.66
486 0.64
487 0.61
488 0.6
489 0.6
490 0.57
491 0.55
492 0.49
493 0.53
494 0.48
495 0.46
496 0.38
497 0.36
498 0.35
499 0.28
500 0.26
501 0.19
502 0.16
503 0.17
504 0.16
505 0.13
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.14
510 0.13
511 0.09
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.13
524 0.2
525 0.22
526 0.3
527 0.32
528 0.31
529 0.33
530 0.35
531 0.4
532 0.37
533 0.4
534 0.38
535 0.46
536 0.56
537 0.63
538 0.63
539 0.61
540 0.64
541 0.66
542 0.61
543 0.59
544 0.54
545 0.48
546 0.45
547 0.37
548 0.31
549 0.25
550 0.23
551 0.16
552 0.1
553 0.07
554 0.08
555 0.1
556 0.11
557 0.11
558 0.12
559 0.12
560 0.18
561 0.22
562 0.29
563 0.31
564 0.36
565 0.45
566 0.53
567 0.59
568 0.61
569 0.64
570 0.62
571 0.58
572 0.56
573 0.47
574 0.39
575 0.32
576 0.25
577 0.18
578 0.12
579 0.11
580 0.08
581 0.07
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.07
588 0.08
589 0.1
590 0.17
591 0.21
592 0.26
593 0.33
594 0.39
595 0.47
596 0.54
597 0.58
598 0.59
599 0.63
600 0.68
601 0.64
602 0.6
603 0.54
604 0.48
605 0.43
606 0.35
607 0.27
608 0.17
609 0.15
610 0.13
611 0.11
612 0.08
613 0.06
614 0.06
615 0.05
616 0.05
617 0.08
618 0.11
619 0.15
620 0.19
621 0.22
622 0.3
623 0.39
624 0.46
625 0.51
626 0.59
627 0.61
628 0.68
629 0.71
630 0.68
631 0.64
632 0.65
633 0.61
634 0.55
635 0.53
636 0.42
637 0.37
638 0.33
639 0.28
640 0.22
641 0.25
642 0.22
643 0.17
644 0.17
645 0.18
646 0.19
647 0.2
648 0.24
649 0.24
650 0.26
651 0.34
652 0.39
653 0.46
654 0.49
655 0.52
656 0.57
657 0.6
658 0.63
659 0.65
660 0.7
661 0.69
662 0.68
663 0.69
664 0.62
665 0.57
666 0.54
667 0.49
668 0.44
669 0.38
670 0.34
671 0.28
672 0.26
673 0.2
674 0.18
675 0.14
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.09
680 0.09
681 0.08
682 0.08
683 0.07
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.06
688 0.1
689 0.11
690 0.17
691 0.25
692 0.29
693 0.35
694 0.37
695 0.46
696 0.49
697 0.57
698 0.59
699 0.58
700 0.6
701 0.57
702 0.61
703 0.55
704 0.52
705 0.47
706 0.39
707 0.33
708 0.28
709 0.26
710 0.21
711 0.21
712 0.16
713 0.13
714 0.13
715 0.11
716 0.14
717 0.14
718 0.16
719 0.13
720 0.15
721 0.16
722 0.19
723 0.2
724 0.19
725 0.24
726 0.26
727 0.31
728 0.34
729 0.36
730 0.35
731 0.36
732 0.34
733 0.34
734 0.37
735 0.34
736 0.31
737 0.3
738 0.37
739 0.35
740 0.37
741 0.34
742 0.3
743 0.3
744 0.31
745 0.36
746 0.33
747 0.35
748 0.34
749 0.33
750 0.31
751 0.29
752 0.29
753 0.23
754 0.17
755 0.18
756 0.25
757 0.29
758 0.29
759 0.32
760 0.3
761 0.29
762 0.3
763 0.26
764 0.19
765 0.15
766 0.13
767 0.1
768 0.11
769 0.13
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.14
775 0.17
776 0.2
777 0.24
778 0.31
779 0.37
780 0.36
781 0.38
782 0.4
783 0.43
784 0.46
785 0.46
786 0.44
787 0.4
788 0.41
789 0.42
790 0.39
791 0.35
792 0.29
793 0.23
794 0.22
795 0.21
796 0.22
797 0.18
798 0.17
799 0.14
800 0.13
801 0.11
802 0.07
803 0.07
804 0.06
805 0.08
806 0.09
807 0.1
808 0.11
809 0.13
810 0.19
811 0.22
812 0.24
813 0.26
814 0.31
815 0.35
816 0.35
817 0.38
818 0.34
819 0.35
820 0.37
821 0.38
822 0.36
823 0.38
824 0.41
825 0.42
826 0.48
827 0.47
828 0.46
829 0.41
830 0.37
831 0.33
832 0.3
833 0.32
834 0.27
835 0.24
836 0.24
837 0.23
838 0.24
839 0.21
840 0.2
841 0.17
842 0.14
843 0.14
844 0.16
845 0.21
846 0.21
847 0.23
848 0.25
849 0.25
850 0.29
851 0.33
852 0.33
853 0.37
854 0.43
855 0.45
856 0.49
857 0.46
858 0.42
859 0.37
860 0.35
861 0.28
862 0.25
863 0.26
864 0.23
865 0.23
866 0.23
867 0.23
868 0.22
869 0.21
870 0.18
871 0.14
872 0.12
873 0.11
874 0.11