Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A2T3ZJD3

Protein Details
Accession A0A2T3ZJD3    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-38FVPSSSSKKRRLQDPEELKRRLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
543-577GSNQRGGPQQRGGRGGGGGGGGQQRGRGGPPRASH
Subcellular Location(s) cyto 10cysk 10, nucl 4, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MAGIDALLIAQDAEDFVPSSSSKKRRLQDPEELKRRLEDELLMPSPQFSDEWLDRLQQRWDFETDYTSLFKIAPPQTRTLTRFLRHGLEGRVTGYKNVTVPISGATAKNSTSLLRKPANRADFVRGAAGFFPFAPGGLEGIEATAALEDQIHAGPAVIDDAAGGNKLERVIQLGSEGGLLQTAPGMARGIDFGIKKVDKDADAAEAIKQELGEAPEEATVANAEDEDSSPPNGASGDSLEDEEEDGDDIDDLLPVEFPSLEPHGTLAASSAKRAGREWAHMVDIKHDMPNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQEFDEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDYERGVVWEEVIIMLPEHISLILLSATVPNTHEFASWVGRTKQRDIYVISTAKRPVPLEHYLWAGKDIHKIVDSDKKFLETGWKDANRATQSKDKPPAAGNTLAIRGGSQGNQRGGRGGSNQRGGPQQRGGRGGGGGGGGQQRGRGGPPRASHNPGHMGRAGNPGGRSTAAQDKNLWVHLVQFLKKQTLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTATEKSAIHMVIEKSIARLKPEDRVLPQIIRLRELLSRGIAVHHGGLLPIVKELVEILFARTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDKVGSVIIVPPGGDDAPPVAELRNMILGEPSKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKDVKLAQADLAKVKREACTICDGVVDECHQAAQDYKRLTTELYKNLLRISIGRRMFTPQRLIIFNWEGIRTAGILLAEGMSPKGTFDDPILHVCAIKPLRERRDATDQLPFIPAFRKYLTRLPQGKKRLATKNMFVPLSDVECLTRWVLKGVVPEIFKGGSGAEDARDKIQEICANWDDRWDEMDMGKVKSLQLQEMMEKRVQLSKTMANSAAVKCPSFLKHFAMCHDEWLIKEHIAQLKQSLSDQNLQLLPDYEQRVQALKELDFIDDATRIQLKGKVACEVHSGDELVLTELILDNVLADFEPAEIAALLSSFVFQEKTDIEPTLTGNLERGRDTIIAISEKVNDVQTRLQVIQSSEDSNDFTSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITALTDVLEGTIVRTITRLDETCREVKNAARIIGDPELYQKMQTAQEMIKRDITAVASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.07
4 0.09
5 0.1
6 0.15
7 0.24
8 0.32
9 0.4
10 0.48
11 0.56
12 0.64
13 0.73
14 0.77
15 0.79
16 0.82
17 0.84
18 0.85
19 0.8
20 0.72
21 0.65
22 0.59
23 0.5
24 0.41
25 0.34
26 0.28
27 0.33
28 0.34
29 0.31
30 0.29
31 0.26
32 0.25
33 0.22
34 0.18
35 0.12
36 0.17
37 0.18
38 0.22
39 0.23
40 0.27
41 0.29
42 0.32
43 0.38
44 0.35
45 0.37
46 0.37
47 0.39
48 0.36
49 0.35
50 0.35
51 0.29
52 0.28
53 0.26
54 0.22
55 0.2
56 0.17
57 0.18
58 0.23
59 0.28
60 0.34
61 0.36
62 0.41
63 0.46
64 0.54
65 0.56
66 0.55
67 0.57
68 0.51
69 0.53
70 0.52
71 0.51
72 0.47
73 0.49
74 0.45
75 0.41
76 0.39
77 0.36
78 0.38
79 0.34
80 0.32
81 0.29
82 0.28
83 0.24
84 0.25
85 0.23
86 0.18
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.16
91 0.16
92 0.17
93 0.18
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.18
98 0.22
99 0.26
100 0.31
101 0.37
102 0.42
103 0.49
104 0.57
105 0.6
106 0.6
107 0.59
108 0.58
109 0.54
110 0.5
111 0.47
112 0.37
113 0.32
114 0.28
115 0.25
116 0.18
117 0.14
118 0.15
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.09
155 0.08
156 0.11
157 0.12
158 0.12
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.11
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.07
176 0.08
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.2
181 0.21
182 0.21
183 0.24
184 0.26
185 0.23
186 0.25
187 0.25
188 0.2
189 0.21
190 0.21
191 0.18
192 0.16
193 0.16
194 0.14
195 0.13
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.08
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.09
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.09
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.19
258 0.2
259 0.21
260 0.22
261 0.27
262 0.24
263 0.29
264 0.33
265 0.3
266 0.32
267 0.34
268 0.34
269 0.3
270 0.3
271 0.26
272 0.25
273 0.24
274 0.23
275 0.21
276 0.26
277 0.24
278 0.21
279 0.21
280 0.19
281 0.23
282 0.23
283 0.22
284 0.19
285 0.23
286 0.24
287 0.23
288 0.23
289 0.19
290 0.18
291 0.17
292 0.18
293 0.15
294 0.17
295 0.19
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.2
301 0.19
302 0.17
303 0.15
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.14
308 0.1
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.1
338 0.12
339 0.18
340 0.19
341 0.21
342 0.23
343 0.26
344 0.27
345 0.3
346 0.38
347 0.38
348 0.47
349 0.47
350 0.52
351 0.54
352 0.54
353 0.61
354 0.53
355 0.46
356 0.42
357 0.43
358 0.35
359 0.32
360 0.32
361 0.2
362 0.19
363 0.16
364 0.1
365 0.07
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.07
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.05
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.08
387 0.09
388 0.11
389 0.1
390 0.09
391 0.1
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.09
397 0.09
398 0.1
399 0.08
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.07
404 0.06
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.1
412 0.11
413 0.08
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.1
418 0.1
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.06
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.04
433 0.03
434 0.03
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.1
446 0.13
447 0.14
448 0.17
449 0.19
450 0.24
451 0.26
452 0.3
453 0.34
454 0.32
455 0.34
456 0.33
457 0.33
458 0.35
459 0.36
460 0.33
461 0.3
462 0.3
463 0.28
464 0.28
465 0.25
466 0.21
467 0.23
468 0.26
469 0.25
470 0.25
471 0.26
472 0.24
473 0.24
474 0.23
475 0.19
476 0.16
477 0.18
478 0.18
479 0.16
480 0.16
481 0.16
482 0.18
483 0.25
484 0.25
485 0.24
486 0.23
487 0.24
488 0.23
489 0.22
490 0.29
491 0.21
492 0.25
493 0.3
494 0.31
495 0.3
496 0.32
497 0.37
498 0.32
499 0.32
500 0.31
501 0.32
502 0.35
503 0.42
504 0.48
505 0.43
506 0.41
507 0.42
508 0.41
509 0.36
510 0.33
511 0.27
512 0.21
513 0.21
514 0.19
515 0.16
516 0.13
517 0.1
518 0.09
519 0.11
520 0.12
521 0.15
522 0.19
523 0.2
524 0.2
525 0.2
526 0.2
527 0.19
528 0.21
529 0.23
530 0.24
531 0.26
532 0.27
533 0.27
534 0.33
535 0.33
536 0.31
537 0.31
538 0.3
539 0.3
540 0.32
541 0.3
542 0.25
543 0.23
544 0.2
545 0.14
546 0.11
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.09
556 0.13
557 0.15
558 0.2
559 0.22
560 0.29
561 0.33
562 0.37
563 0.37
564 0.35
565 0.4
566 0.36
567 0.36
568 0.31
569 0.27
570 0.25
571 0.29
572 0.26
573 0.2
574 0.19
575 0.18
576 0.16
577 0.15
578 0.14
579 0.11
580 0.19
581 0.19
582 0.2
583 0.2
584 0.21
585 0.22
586 0.22
587 0.2
588 0.11
589 0.1
590 0.13
591 0.15
592 0.15
593 0.17
594 0.17
595 0.18
596 0.19
597 0.18
598 0.19
599 0.19
600 0.21
601 0.18
602 0.2
603 0.18
604 0.19
605 0.19
606 0.16
607 0.2
608 0.19
609 0.25
610 0.24
611 0.27
612 0.27
613 0.32
614 0.34
615 0.34
616 0.38
617 0.33
618 0.31
619 0.29
620 0.28
621 0.23
622 0.19
623 0.13
624 0.08
625 0.06
626 0.11
627 0.11
628 0.1
629 0.14
630 0.14
631 0.13
632 0.16
633 0.16
634 0.12
635 0.15
636 0.14
637 0.12
638 0.12
639 0.12
640 0.1
641 0.14
642 0.14
643 0.12
644 0.14
645 0.14
646 0.19
647 0.22
648 0.23
649 0.22
650 0.26
651 0.27
652 0.25
653 0.28
654 0.28
655 0.26
656 0.24
657 0.23
658 0.19
659 0.19
660 0.19
661 0.16
662 0.11
663 0.12
664 0.1
665 0.1
666 0.09
667 0.08
668 0.07
669 0.06
670 0.06
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.05
675 0.04
676 0.04
677 0.04
678 0.04
679 0.04
680 0.04
681 0.05
682 0.05
683 0.05
684 0.06
685 0.06
686 0.07
687 0.06
688 0.07
689 0.06
690 0.06
691 0.06
692 0.06
693 0.07
694 0.06
695 0.08
696 0.07
697 0.08
698 0.07
699 0.07
700 0.07
701 0.06
702 0.07
703 0.07
704 0.07
705 0.06
706 0.06
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.1
712 0.13
713 0.19
714 0.23
715 0.28
716 0.28
717 0.29
718 0.34
719 0.36
720 0.38
721 0.41
722 0.41
723 0.36
724 0.41
725 0.4
726 0.34
727 0.29
728 0.25
729 0.19
730 0.15
731 0.15
732 0.09
733 0.1
734 0.1
735 0.1
736 0.11
737 0.11
738 0.11
739 0.13
740 0.14
741 0.15
742 0.16
743 0.16
744 0.15
745 0.13
746 0.13
747 0.11
748 0.1
749 0.09
750 0.08
751 0.06
752 0.06
753 0.05
754 0.05
755 0.05
756 0.05
757 0.04
758 0.04
759 0.05
760 0.05
761 0.06
762 0.05
763 0.06
764 0.06
765 0.07
766 0.09
767 0.08
768 0.08
769 0.09
770 0.1
771 0.11
772 0.12
773 0.14
774 0.14
775 0.17
776 0.18
777 0.2
778 0.25
779 0.3
780 0.31
781 0.37
782 0.35
783 0.38
784 0.38
785 0.36
786 0.32
787 0.25
788 0.22
789 0.15
790 0.13
791 0.09
792 0.07
793 0.06
794 0.05
795 0.06
796 0.06
797 0.07
798 0.09
799 0.11
800 0.13
801 0.14
802 0.14
803 0.14
804 0.15
805 0.17
806 0.17
807 0.19
808 0.19
809 0.23
810 0.25
811 0.25
812 0.24
813 0.26
814 0.26
815 0.23
816 0.22
817 0.2
818 0.19
819 0.19
820 0.19
821 0.17
822 0.17
823 0.16
824 0.15
825 0.14
826 0.14
827 0.15
828 0.19
829 0.19
830 0.19
831 0.2
832 0.21
833 0.2
834 0.21
835 0.21
836 0.19
837 0.23
838 0.21
839 0.2
840 0.19
841 0.19
842 0.16
843 0.16
844 0.15
845 0.09
846 0.09
847 0.08
848 0.08
849 0.07
850 0.11
851 0.13
852 0.16
853 0.17
854 0.18
855 0.19
856 0.2
857 0.2
858 0.24
859 0.28
860 0.28
861 0.32
862 0.33
863 0.32
864 0.32
865 0.32
866 0.25
867 0.23
868 0.21
869 0.24
870 0.25
871 0.25
872 0.25
873 0.3
874 0.35
875 0.35
876 0.37
877 0.31
878 0.33
879 0.34
880 0.34
881 0.34
882 0.31
883 0.29
884 0.25
885 0.23
886 0.2
887 0.18
888 0.17
889 0.12
890 0.1
891 0.08
892 0.06
893 0.06
894 0.05
895 0.06
896 0.05
897 0.05
898 0.05
899 0.05
900 0.05
901 0.05
902 0.07
903 0.06
904 0.07
905 0.08
906 0.13
907 0.14
908 0.17
909 0.19
910 0.17
911 0.17
912 0.16
913 0.23
914 0.19
915 0.21
916 0.26
917 0.33
918 0.39
919 0.46
920 0.49
921 0.47
922 0.56
923 0.57
924 0.52
925 0.52
926 0.46
927 0.4
928 0.39
929 0.33
930 0.24
931 0.24
932 0.22
933 0.17
934 0.19
935 0.21
936 0.22
937 0.31
938 0.36
939 0.43
940 0.51
941 0.55
942 0.62
943 0.67
944 0.7
945 0.68
946 0.7
947 0.7
948 0.69
949 0.68
950 0.64
951 0.64
952 0.63
953 0.57
954 0.48
955 0.41
956 0.33
957 0.3
958 0.26
959 0.18
960 0.13
961 0.13
962 0.15
963 0.13
964 0.14
965 0.11
966 0.12
967 0.13
968 0.14
969 0.17
970 0.17
971 0.21
972 0.19
973 0.19
974 0.2
975 0.19
976 0.17
977 0.14
978 0.12
979 0.08
980 0.08
981 0.09
982 0.09
983 0.11
984 0.12
985 0.13
986 0.14
987 0.14
988 0.14
989 0.18
990 0.2
991 0.19
992 0.24
993 0.26
994 0.28
995 0.27
996 0.29
997 0.26
998 0.23
999 0.24
1000 0.19
1001 0.16
1002 0.14
1003 0.21
1004 0.21
1005 0.21
1006 0.21
1007 0.2
1008 0.19
1009 0.23
1010 0.24
1011 0.19
1012 0.19
1013 0.2
1014 0.25
1015 0.28
1016 0.31
1017 0.27
1018 0.27
1019 0.26
1020 0.29
1021 0.28
1022 0.25
1023 0.25
1024 0.27
1025 0.3
1026 0.32
1027 0.32
1028 0.28
1029 0.32
1030 0.3
1031 0.33
1032 0.28
1033 0.25
1034 0.23
1035 0.25
1036 0.26
1037 0.27
1038 0.29
1039 0.28
1040 0.32
1041 0.34
1042 0.37
1043 0.4
1044 0.36
1045 0.34
1046 0.33
1047 0.29
1048 0.24
1049 0.26
1050 0.25
1051 0.19
1052 0.19
1053 0.22
1054 0.26
1055 0.26
1056 0.26
1057 0.25
1058 0.25
1059 0.26
1060 0.27
1061 0.26
1062 0.23
1063 0.27
1064 0.27
1065 0.28
1066 0.27
1067 0.27
1068 0.25
1069 0.22
1070 0.22
1071 0.22
1072 0.26
1073 0.23
1074 0.23
1075 0.24
1076 0.26
1077 0.25
1078 0.27
1079 0.24
1080 0.2
1081 0.23
1082 0.22
1083 0.22
1084 0.19
1085 0.19
1086 0.17
1087 0.14
1088 0.14
1089 0.12
1090 0.13
1091 0.13
1092 0.15
1093 0.18
1094 0.21
1095 0.25
1096 0.27
1097 0.31
1098 0.3
1099 0.31
1100 0.33
1101 0.31
1102 0.29
1103 0.25
1104 0.24
1105 0.17
1106 0.17
1107 0.16
1108 0.13
1109 0.11
1110 0.09
1111 0.07
1112 0.07
1113 0.07
1114 0.06
1115 0.05
1116 0.04
1117 0.04
1118 0.05
1119 0.04
1120 0.04
1121 0.04
1122 0.04
1123 0.05
1124 0.04
1125 0.05
1126 0.04
1127 0.05
1128 0.04
1129 0.04
1130 0.04
1131 0.04
1132 0.05
1133 0.05
1134 0.06
1135 0.06
1136 0.06
1137 0.1
1138 0.11
1139 0.15
1140 0.17
1141 0.18
1142 0.18
1143 0.18
1144 0.2
1145 0.21
1146 0.2
1147 0.17
1148 0.18
1149 0.21
1150 0.22
1151 0.21
1152 0.21
1153 0.2
1154 0.19
1155 0.2
1156 0.19
1157 0.19
1158 0.19
1159 0.19
1160 0.2
1161 0.19
1162 0.2
1163 0.2
1164 0.21
1165 0.18
1166 0.19
1167 0.22
1168 0.24
1169 0.27
1170 0.26
1171 0.27
1172 0.26
1173 0.27
1174 0.29
1175 0.27
1176 0.26
1177 0.23
1178 0.23
1179 0.23
1180 0.22
1181 0.23
1182 0.18
1183 0.21
1184 0.23
1185 0.24
1186 0.24
1187 0.25
1188 0.23
1189 0.22
1190 0.3
1191 0.27
1192 0.26
1193 0.24
1194 0.26
1195 0.24
1196 0.23
1197 0.22
1198 0.14
1199 0.13
1200 0.1
1201 0.12
1202 0.16
1203 0.18
1204 0.2
1205 0.24
1206 0.24
1207 0.25
1208 0.26
1209 0.24
1210 0.18
1211 0.17
1212 0.16
1213 0.12
1214 0.12
1215 0.11
1216 0.09
1217 0.12
1218 0.11
1219 0.09
1220 0.1
1221 0.11
1222 0.13
1223 0.19
1224 0.2
1225 0.22
1226 0.28
1227 0.34
1228 0.4
1229 0.42
1230 0.42
1231 0.39
1232 0.41
1233 0.45
1234 0.45
1235 0.42
1236 0.37
1237 0.36
1238 0.38
1239 0.4
1240 0.36
1241 0.27
1242 0.26
1243 0.28
1244 0.27
1245 0.26
1246 0.23
1247 0.23
1248 0.25
1249 0.26
1250 0.26
1251 0.26
1252 0.32
1253 0.37
1254 0.38
1255 0.38
1256 0.36
1257 0.35
1258 0.33
1259 0.3
1260 0.25