Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QXB3

Protein Details
Accession C4QXB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MTKRKARKVKGPKKLAKQIHVSYEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
3-16KRKARKVKGPKKLA
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041667  Cupin_8  
IPR003347  JmjC_dom  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0055  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13621  Cupin_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51184  JMJC  
Amino Acid Sequences MTKRKARKVKGPKKLAKQIHVSYEGYTVSASSSIEIIDVDELDWNLMFSRFVSQRKPCLIDGVMPGLNLNIFQPHLLNELLDYGEALEVEQKINGGFGSNVQRLQMRFEELMENLRTGKGDLYLTTQYGGEDENDERKEEEEEEEEGNIENSGTEGFDDNSDTETCSLVSLSTSFHDDFEDLDDLDDLEKPRLFIQPPLCNLSSSILPSSPSFLDKLAIQQVNLWLGAARPTPLALDPLKTDLGVGNCVPNGTSSGLHHDHADNLYIPIHGRKRFTLFSPQDAPNLYTQGDIATIYENGVVDYITNKNAPNWRHIRDDGAIIGEVCRWKLEQQSDSLSETQQKLLLEQIKEEDKLLASFSSVPKVEPPSFSRIPPALLHIQEVESVEDRARLHELSQNGYPLLSKCHSLIVDLEPGQMLYLPAGWFHEVKSYGEESPEFPYVHEAINYWFEPPNGSTSDRPYEDSYWSEISPYLLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.92
2 0.9
3 0.87
4 0.85
5 0.81
6 0.78
7 0.73
8 0.63
9 0.54
10 0.48
11 0.4
12 0.31
13 0.24
14 0.16
15 0.12
16 0.12
17 0.1
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.07
36 0.15
37 0.2
38 0.24
39 0.33
40 0.38
41 0.46
42 0.52
43 0.56
44 0.49
45 0.5
46 0.47
47 0.43
48 0.4
49 0.38
50 0.32
51 0.27
52 0.26
53 0.2
54 0.19
55 0.14
56 0.11
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.1
68 0.1
69 0.08
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.1
85 0.18
86 0.19
87 0.2
88 0.21
89 0.24
90 0.23
91 0.28
92 0.25
93 0.22
94 0.21
95 0.22
96 0.23
97 0.21
98 0.26
99 0.22
100 0.2
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.14
105 0.14
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.15
114 0.13
115 0.12
116 0.12
117 0.08
118 0.09
119 0.11
120 0.16
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.19
126 0.17
127 0.18
128 0.14
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.12
135 0.1
136 0.07
137 0.05
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.12
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.08
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.14
180 0.15
181 0.18
182 0.25
183 0.29
184 0.31
185 0.35
186 0.34
187 0.31
188 0.31
189 0.27
190 0.2
191 0.16
192 0.14
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.12
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.15
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.13
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.07
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.16
246 0.15
247 0.15
248 0.15
249 0.15
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.12
256 0.17
257 0.19
258 0.2
259 0.21
260 0.26
261 0.27
262 0.29
263 0.35
264 0.32
265 0.34
266 0.39
267 0.38
268 0.35
269 0.35
270 0.33
271 0.24
272 0.23
273 0.18
274 0.12
275 0.11
276 0.09
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.06
287 0.05
288 0.04
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.13
295 0.19
296 0.21
297 0.28
298 0.33
299 0.35
300 0.4
301 0.4
302 0.41
303 0.37
304 0.37
305 0.28
306 0.23
307 0.2
308 0.14
309 0.13
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.1
316 0.16
317 0.21
318 0.22
319 0.24
320 0.29
321 0.3
322 0.32
323 0.32
324 0.27
325 0.26
326 0.25
327 0.23
328 0.21
329 0.19
330 0.17
331 0.21
332 0.26
333 0.21
334 0.21
335 0.24
336 0.24
337 0.25
338 0.25
339 0.2
340 0.15
341 0.15
342 0.15
343 0.11
344 0.09
345 0.12
346 0.13
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.19
351 0.25
352 0.26
353 0.27
354 0.3
355 0.33
356 0.35
357 0.35
358 0.38
359 0.32
360 0.33
361 0.3
362 0.31
363 0.28
364 0.27
365 0.28
366 0.23
367 0.23
368 0.21
369 0.21
370 0.18
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.15
375 0.14
376 0.15
377 0.17
378 0.15
379 0.15
380 0.19
381 0.21
382 0.22
383 0.24
384 0.24
385 0.21
386 0.21
387 0.21
388 0.17
389 0.21
390 0.19
391 0.18
392 0.17
393 0.22
394 0.22
395 0.21
396 0.23
397 0.2
398 0.25
399 0.23
400 0.23
401 0.19
402 0.18
403 0.17
404 0.15
405 0.12
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.1
411 0.12
412 0.12
413 0.13
414 0.18
415 0.18
416 0.19
417 0.23
418 0.24
419 0.23
420 0.25
421 0.26
422 0.22
423 0.25
424 0.28
425 0.23
426 0.21
427 0.25
428 0.23
429 0.24
430 0.23
431 0.19
432 0.18
433 0.23
434 0.23
435 0.2
436 0.2
437 0.19
438 0.22
439 0.22
440 0.23
441 0.21
442 0.25
443 0.26
444 0.31
445 0.39
446 0.38
447 0.4
448 0.41
449 0.4
450 0.4
451 0.4
452 0.38
453 0.33
454 0.31
455 0.28
456 0.24